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知識分享:WesternBlot實驗方法及注意事項

瀏覽次數(shù):5840 發(fā)布日期:2018-6-28  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

 

實驗原理:

WesternBlot印跡方法,又稱為免疫印記,是將獲得的蛋白質(zhì)樣品通過SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,對不同分子量的蛋白質(zhì)進行分離,并通過轉(zhuǎn)移電泳將凝膠上分離到的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)印至固相支持物(NC膜或PVDF膜)上,用抗靶蛋白的非標記抗體(一抗)與轉(zhuǎn)印后膜上的靶蛋白進行特異性結(jié)合,再與經(jīng)辣根過氧化物酶標記(偶聯(lián))的二抗結(jié)合,最后用ECL超敏發(fā)光液試劑檢測。如果轉(zhuǎn)印膜上含有靶蛋白,經(jīng)X光片曝光、顯影后,則會在X-光片上出現(xiàn)特異性蛋白條帶。

實驗材料:

分離膠及積層膠溶液 、水飽和異丁醇 、1×Tris・Cl/SDS,pH8.8 、蛋白質(zhì)分子量標準混合物 、1×SDS電泳緩沖液 、電泳裝置及夾子、玻璃板、灌膠支架、緩沖液槽等附件 、0.75mm封邊墊片 、0.75mm樣品梳子 、50μl微量加樣器 、恒流電源

常用試劑:

1)30%丙烯酰胺/0.8% N,N’-亞甲丙烯酰胺

將30克丙烯酰胺和0.8克N,N’-亞甲丙烯酰胺溶于總體積為60ml水中,加熱至37℃溶解之,補加水至終體積為100ml。0.45μm微孔濾膜過濾除菌,查證該溶液pH應(yīng)不大于7.0,置棕色瓶中保存。

小心:丙烯酰胺具有很強的神經(jīng)毒性并可通過皮膚吸收,其作用具有累積性。稱量丙烯酰胺和N,N’-亞甲丙烯酰胺時應(yīng)戴手套和面具?烧J為聚丙烯酰胺無毒,但也應(yīng)謹慎操作,因為它還可能含有少量未聚合材料。

2)4×Tris・Cl/SDS,pH8.8,

在300mlH2O中溶解91g Tris堿(1.5mol/L),用1mol/L調(diào)節(jié)pH至8.8,補加H2O至體積500ml。用0.45μm濾膜過濾溶液,再加入2g SDS[0.4%(w/v)],于4℃可保存1月。

3)4×Tris・Cl/SDS,pH6.8,

在40mlH2O中溶解6.05g Tris堿(0.5mol/L),用1mol/L調(diào)節(jié)pH至6.8,補加H2O至體積100ml。用0.45μm濾膜過濾溶液,再加入0.4g SDS[0.4%(w/v)],于4℃可保存1月。

4)4×SDS電泳緩沖液

Tris base 24.2 g 、Glycerin 115.3 g 、20%SDS 20 ml

加水至總體積1000ml。

應(yīng)用時稀釋4倍即為1×SDS電泳緩沖液(Tris 0.05M,Glycerin 0.38M,SDS 0.1%)。

5)TEMED (N,N,N’,N’-四甲基乙二胺)

TEMED通過催化過硫酸銨形成自由基而加速丙烯酰胺和N,N’-亞甲丙烯酰胺的聚合。

6)10%過硫酸銨

過硫酸銨提供驅(qū)動丙烯酰胺和亞甲丙烯酰胺聚合所必需癿自由基?捎萌ルx子水配制小量10%(w/v)癿貯存液并保存于4℃。由于過硫酸銨會緩慢分解,故應(yīng)隔周新鮮配制。

實驗步驟:

轉(zhuǎn)染后的樣品,收毒,12000rpm離心,2min,去上清,細胞碎片就直接進行下面步驟:

(1)加入10 x RIPA buffer/每孔200μl,4°裂解30min。

(2)準備熱變性,用八連管,每孔加入5 x loading buffer  5μl。                

(3)用20μl移液槍,將裂解后的細胞取出20μl,加入對應(yīng)的八連管中,并吹打混勻。

(4)封口,用PCR儀進行熱變性處理:97°8min。

(5)4°儲存變性后的樣品,待檢。

1、SDS-PAGE凝膠的配制

預(yù)先配制混合液(Tris-HCL/Acr-bis/SDS/H2O),APS以及TEMED在配制凝膠時現(xiàn)加。

分離膠:用1.5M Tris-HCL 8.8、10%分離膠。(所謂的10%濃度為Acr-Bis的濃度,即丙烯酰胺的濃度,用水定容,其他成分不變);濃縮膠:用1M Tirs-HCL 6.8、濃度:5%。

2、上樣電泳:

所用梳子為15孔,Marker占用一孔,故每塊凝膠可以檢測14支樣品。上樣量:Marker:5 μl/孔; 樣品:20μl/孔;參數(shù):80V,待樣品跑出上樣孔;120V,樣品進入分離膠;200V,直至結(jié)束(藍色指示帶到凝膠底部即完成電泳)

3、轉(zhuǎn)膜:

轉(zhuǎn)膜三明治結(jié)構(gòu)順序:黑色板、網(wǎng)墊、一層濾紙、凝膠(習(xí)慣將Marker放在右側(cè))、NC膜(在膜的蛋白面左上角做好標記)、兩層濾紙、網(wǎng)墊、白色板。

備注:所用的濾紙也分粗糙面和細膩面,細膩面對著凝膠和NC膜,粗糙面對著網(wǎng)墊。將三明治結(jié)構(gòu)的夾子放入電極時,黑色板對應(yīng)電極的黑色一面(負極)、白色版對應(yīng)電極的紅色一面(正極)。

強調(diào):凝膠和NC膜(硝化纖維素膜)的順序千萬不要放反,所用的NC膜分粗糙面和光滑面,粗糙面為接受蛋白面,該面和凝膠直接接觸。蓋槽蓋時,同樣注意黑色對應(yīng)黑色、紅色對應(yīng)紅色;同樣導(dǎo)線電極連接電源的時候,也是黑色對黑色、紅色對紅色。上述任何一步弄反,都會導(dǎo)致蛋白轉(zhuǎn)膜失敗,切記。

轉(zhuǎn)膜所用參數(shù):穩(wěn)流45mA,過夜(999min)。

4、封閉

所用封閉液:5% Nonfat milk,用TBST配制,RT(室溫),30min~1h(根據(jù)實際情況確定時間,比如封閉液已使用次數(shù)、ECL顯色的背景)。為了防止奶粉變質(zhì),加入疊氮鈉即NaN3(一種光譜的防腐劑),終濃度為0.02%(本實驗室疊氮鈉儲存液濃度為2%)

洗:TBST,洗去殘余的奶粉。

5、一抗孵育

 所用抗體:mouse,Anti-Flag。

 一抗稀釋:4%BSA by Super Block,1:1000。亦加入0.02%的疊氮鈉NaN3。

孵育:RT,約3h。

洗:TBST,3 x 5min

6、二抗孵育

所用抗體:HRP,anti-mouse。

二抗稀釋:5%Nonfat milk by TBST,1:2000.(二抗一般用兩次或三次就更新)(強調(diào):二抗中不可以加NaN3,,因為其會抑制HRP的活性)

孵育:RT,1h。

洗:TBST,6 x 5min。

7、顯色:ECL。

 A液/B液,各取300μl等體積混合,現(xiàn)用現(xiàn)配。用熒光筆標記好NC膜上的Marker以及上樣孔的位置。將反應(yīng)液均勻的加到膜上(蛋白面),浸濕整張膜,然后輕輕的將膜的蛋白面向下放入顯色儀,蓋上蓋子,點擊開始。

 

注意事項

1、開始配膠的板子一定得夾緊,防止漏膠。

2、上樣的板子也得夾緊,防止漏電緩液,在跑膠出現(xiàn)膠的快慢不一樣,原因上樣前兩塊膠的板子沒有加緊漏電緩液,還有就是膠的濃度不一樣。

3、上樣時,marker5ul加5 x loading buffer混勻一起上樣,這樣可以防止在跑電泳的過程,樣品把marker給擠的越來越窄。

4、轉(zhuǎn)膜時,NC膜的正面左上角先用marker筆做好標記,防止后面孵育抗體與顯色的過程分不清NC膜的正反面。

5、轉(zhuǎn)膜之前,先把NC膜放在轉(zhuǎn)膜液浸泡,注意從一端慢慢的往下浸泡,否者NC膜容易泡不透,影響轉(zhuǎn)膜。

6、顯色時,往NC膜上加轉(zhuǎn)膜液也得從一邊慢慢往下加,否者最后顯色效果也不好。

7、轉(zhuǎn)膜時,NC膜與膠的接觸之前千萬不可有氣泡,否者對結(jié)果的目的條帶有影響。

常見問題

1、膠片是一片空白,是怎么回事?
如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。
1)二抗的HRP 活性太強,將底物消耗光;
2)ECL底物中H2O2不穩(wěn)定,失活;
3) ECL底物沒覆蓋到相應(yīng)位置;
4)一抗選擇不當;
5)二抗失活。
2、背景高咋回事?
膜沒有完全均勻濕透,建議 使用100% methanol浸透膜;
洗膜不充分,可以增加洗液體積和洗滌次數(shù);
電極不平衡或者加樣位置偏斜,可以調(diào)整電極和加樣;
封閉物用量不足,可以提高封閉物濃度,孵育時保證封閉液完全浸沒轉(zhuǎn)印膜;
封閉物使用不當,比如檢測生物素標記的蛋白時不可用脫脂奶粉封閉;
封閉時間不夠,一般情況下室溫37度封閉1小時以上或者4度封閉過夜;
7)抗體非特異性結(jié)合,可以降低抗體濃度,減少孵育時間
8)一抗稀釋度不適宜,可以對抗體進行滴度測試,選擇最適宜的抗體稀釋度
9)一抗孵育的溫度偏高,建議4℃結(jié)合過夜
10)抗體濃度過高或洗滌不夠,建議降低抗體濃度,增加洗滌次數(shù)和時間
11)化學(xué)顯色底物過多,建議按說明書加入適量的顯色底物
3、為啥條帶形狀不好看?
1)膠凝的不均勻或聚合不好,建議灌膠前將溶液充分混勻
2)某些樣品鹽濃度較高,建議除鹽或?qū)悠符}濃度調(diào)成一致
3) 緩沖液陳舊,成分改變,可以重配
4) 凝膠下面有氣泡,電泳前要先將氣泡趕走
5)電泳時溫度過高,可以降低電流或電壓
6)樣品中含有不溶性顆粒,建議樣品充分攪拌混勻
4、蛋白條帶位置(大。┎粚φφ
膠濃度不對,不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差,可以調(diào)整濃度
抗體孵育不充分,建議增加抗體濃度,延長孵育時間
3)酶失活,建議直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物
4)目的蛋白存在翻譯后修飾或剪切體,建議查詢相關(guān)文獻確定
5)標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低,建議設(shè)置陽性對照比對結(jié)果,增加標本上樣量
5、有很多雜帶咋回事?
1)目的蛋白有多個修飾位點,本身可以呈現(xiàn)多條帶,建議查閱文獻或進行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白實際大小
2) 樣本處理過程中目的蛋白發(fā)生降解,建議加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時在冰上操作
3)雜蛋白多,建議處理目的蛋白
4)抗體特異性不強,建議使用特異性強的抗體
5)抗體孵育時間過久,建議減少抗體孵育時間
6)二抗與抗原有交叉反應(yīng),建議選擇合適的封閉物
7)二聚體或多聚體存在,建議增加蛋白質(zhì)變性過程及強度
8)底物顯色與曝光時間過長,建議縮短顯色及曝光的時間
6、背景有黑色斑點或有不均勻的白色斑點以及暗背景上白色帶
1)抗體與封閉試劑反應(yīng),建議使用前過濾封閉試劑
2)HRP含量過高,建議降低酶聯(lián)二抗的濃度
3)HRP偶聯(lián)二抗中有聚集體,建議過濾二抗試劑,去除聚集體
4)抗體分布不均勻,建議孵育抗體時使用搖床
7、細胞水平要做WB,多少細胞提的蛋白夠做WB?
答:一般5×10^6就足夠。
8、為什么我的細胞提取液中沒有檢測到目的蛋白?
可能的原因有:
1)細胞中不表達這種蛋白質(zhì),換一種細胞;
2)抗體不能識別目標蛋白,多看看說明,是否有問題;
3)可能是沒有保持低溫操作,樣品保存不當,樣品放置時間過長;
4)細胞中的蛋白質(zhì)被酶降解掉了,可加入蛋白酶抑制劑,抑制蛋白酶活性。
9、我的目的帶很弱,如何加強?
1)可以加大抗原上樣量,這是最主要的;
2)也可以將一抗稀釋比例降低;
3)還可以延長曝光時間。
10、我做的蛋白質(zhì)分子量很。10KD),請問怎么做WB?
1)可選擇孔徑0.22um的PVDF膜或者NC膜,轉(zhuǎn)膜時間縮短,另外可采用Tricine-SDS-PAGE體系;
2)也可以選擇PSQ 膜,同時縮短轉(zhuǎn)移時間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可。
11、大分子量蛋白200KD,在做WB要注意什么?
1)做200kd蛋白的WB時要注意,分離膠最好選擇>7%的;剝膠時要小心;
2)轉(zhuǎn)移時間需要相應(yīng)延長;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析);
3)轉(zhuǎn)膜液中甲醇含量可適當降低,推薦使用濕裝轉(zhuǎn)膜效率更高哦!
12、如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量?
可以濃縮樣品,也可以根據(jù)目標分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會有問題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5mm的。
13、WB中抗體的可以重復(fù)應(yīng)用嗎?
抗體工作溶液一般不主張儲存反復(fù)使用,但是如抗體比較珍貴,可反復(fù)使用2-3次。稀釋后應(yīng)在2-3天內(nèi)使用,4度保存,避免反復(fù)凍融。
14、上下槽緩沖液有何要求,怎樣才能達到最佳效果?
無特殊要求。但一般是上槽放新鮮的緩沖液,下槽可以是重復(fù)使用過一兩次的緩沖液。
15、免疫組化和WB可以用同一種抗體嗎?
免疫組化時抗體識別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表位是線性的,而有的屬于構(gòu)象型;線性表位不受蛋白變性的影響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構(gòu)象型表位由于受蛋白空間結(jié)構(gòu)限制,煮后變性會消失。如果所用的抗體識別的是蛋白上連續(xù)的幾個氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時用于免疫組化和WB,而如果抗體識別構(gòu)象形表位,則只能用于免疫組化。

 

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