Cre-loxP重組系統(tǒng)
一.Cre-loxP重組系統(tǒng)作用原理
1. Cre重組酶和loxP位點
Cre重組酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大腸桿菌噬菌體P1的Cre基因編碼,是由343個氨基酸組成的38kD的蛋白質(zhì)。它不僅具有催化活性,而且與限制酶相似,能夠特異性識別loxP位點。
LoxP(locus of X-overP1)位點長為34bp,包括兩個13bp的反向重復序列和一個8bp的間隔區(qū)域。其中,反向重復序列是Cre重組酶的特異識別位點,而間隔區(qū)域決定了loxP位點的方向。
圖1. Cre重組酶和loxP位點
(http://2012.igem.org/Team:Tsinghua-A/Project/Design)
2. Cre-loxP重組系統(tǒng)誘導基因重組的方式
Cre-loxP系統(tǒng)存在幾種誘導重組的方式,這是基于Cre重組酶與loxP位點的相互作用而實現(xiàn)的。
當基因組內(nèi)存在loxP位點時,一旦有Cre重組酶,便會結(jié)合到loxP位點兩端的反向重復序列區(qū)形成二聚體。此二聚體與其他loxP位點的二聚體結(jié)合,進而形成四聚體。隨后,loxP位點之間的DNA被Cre重組酶切下,切口在DNA連接酶的作用下重新連接。重組的結(jié)果取決于loxP位點的位置和方向。主要存在幾下幾種重組方式:
(1) 兩個loxP位點位于同一條DNA鏈上且方向相同,Cre重組酶敲除loxP間的序列;
(2) 兩個loxP位點位于同一條DNA鏈上且方向相反,Cre重組酶誘導loxP間的序列翻轉(zhuǎn);
(3) 兩個loxP位點位于不同的DNA鏈或染色體上,Cre重組酶誘導兩條DNA鏈發(fā)生交換或染色體易位;
(4) 四個loxP位點分別位于兩條DNA鏈或染色體上,Cre重組酶誘導loxP間的序列互換。
圖2. Cre-loxP誘導基因重組的方式
(https:///search/rolling%20circle%20replication)
二.Cre-loxP重組系統(tǒng)的優(yōu)勢
之所以Cre-loxP重組系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因動物方面得到廣泛的應(yīng)用,因其具有非常明顯的優(yōu)勢。主要體現(xiàn)在:時空特異、高效性、準確性、快速性。
圖3. Cre-loxP重組系統(tǒng)的優(yōu)勢
三.Cre-loxP重組系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用
由于Cre-loxP重組系統(tǒng)的高效簡單的作用方式,它已在基因定點刪除、外源基因定點整合、疾病動物模型建立、篩選高效表達基因座等方面得到了有效利用,成為體內(nèi)外DNA重組的有力工具。
圖4. Cre-loxP重組系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用
四.病毒依賴的基因重組的優(yōu)勢
應(yīng)用Cre-loxP重組系統(tǒng)較為常見的形式是兩種轉(zhuǎn)基因動物的雜交。一般的策略為:
(1) 利用原核注射的方法獲得轉(zhuǎn)基因“Cre小鼠”。一般利用特定啟動子控制此小鼠的Cre重組酶的表達;
(2) 通過置換型載體的同源重組,在胚胎干細胞中向靶位點引入選擇標記基因,并在其兩側(cè)引入兩個loxP位點,要求兩條同源染色體都帶有l(wèi)oxP位點,且不能干擾靶基因的轉(zhuǎn)錄。將此胚胎干細胞注入假孕母鼠中,發(fā)育成“floxed小鼠”;
(3) “Cre小鼠”與“floxed小鼠”交配,產(chǎn)生的后代體內(nèi),Cre重組酶會與loxP位點發(fā)生作用,導致基因重組。
雖然此法具備了Cre-loxP重組系統(tǒng)的高效、特異的重組,但存在許多不足:
目前,由于病毒依賴的基因重組能否克服轉(zhuǎn)基因的動物的諸多不足,從而成為越來越多科研工作者的新選擇。病毒依賴的Cre-loxP重組系統(tǒng)的策略為:
(1) 通過轉(zhuǎn)基因動物辦法獲得一只“Cre小鼠”或“floxed小鼠”;
(2) 病毒注射此“Cre小鼠”或“floxed小鼠”,引入loxP或Cre重組酶元件。
此方法優(yōu)勢明顯:
五.維真為您提供Cre-loxP重組系統(tǒng)的AAV載體構(gòu)建和病毒包裝服務(wù)
1. 依賴Cre重組酶誘導表達的FLEX-ON系統(tǒng)
結(jié)合組織特異性的啟動子和不同的AAV血清型,維真提供的FLEX-ON系統(tǒng)能幫您獲得更精準的組織特異性控制和時間控制。
在FLEX-ON系統(tǒng)中,目的基因反方向位于啟動子下方,兩側(cè)分別連接兩個“頭對頭”的loxP。Cre重組酶不存在時,目的基因不能表達;當Cre重組酶存在時,可以誘導目的基因的“翻轉(zhuǎn)”,從而表達。
圖5.維真提供依賴Cre的FLEX-ON系統(tǒng)示意圖(上)維真的FLEX-ON實驗圖(下)
2. 依賴Cre重組酶反式剪接系統(tǒng)——輕松擁有“表達大基因的AAV”
較小的包裝能力(小于5kb)使得AAV應(yīng)用受到限制。維真為您提供依賴Cre的反式剪接系統(tǒng),讓您輕松擁有“表達大基因的AAV”。
多個重組AAV的共轉(zhuǎn)染效率高達90%,維真將較大基因分為兩部分構(gòu)建于兩個AAV載體上。通過ITR的重組、mRNA剪接和Cre-loxP消除ITR的對轉(zhuǎn)錄的抑制作用,實現(xiàn)目的蛋白的表達。相比于單個載體維真提供的依賴Cre的反式剪接系統(tǒng)的表達效率約20%。
圖7. 維真提供依賴Cre的反式剪接系統(tǒng)示意圖(左)維真的依賴Cre的反式剪接系統(tǒng)實驗圖(右)