一、操作安全性
(1)可在生物安全柜、常規(guī)超凈工作臺(不開啟排風(fēng)機)中進(jìn)行慢病毒使用操作;
(2)操作者須穿著實驗服,戴口罩、一次性手套,謹(jǐn)防毒液直接接觸眼耳鼻口或皮膚傷口;
(3)操作過程注意避免毒液飛散、滴灑,注意勿被銳利器材、針頭等劃破皮膚;
(4)不慎直接接觸毒液的操作臺、需回收器材,可通過0.25% SDS、70%乙醇、1%次氯酸鈉等溶液滅活病毒;
(5)使用過的工作臺面、顯微鏡載物臺等經(jīng)70%乙醇擦拭;
(6)培養(yǎng)器皿、槍頭等廢棄物應(yīng)84消毒液(1:9稀釋)浸泡,或121℃高溫消毒,方可丟棄。
二、慢病毒的保存
(1)慢病毒載體經(jīng)過干冰運輸,在-80℃可保存6個月,保存超過6個月時需重新摸索工作滴度。
(2)凍存的毒液在使用前置于冰上或4℃融化,最好于當(dāng)天用完,未用完的毒液可暫時保存于4℃,不超過2天。
(3)反復(fù)凍融會嚴(yán)重降低慢病毒滴度,每次凍融可降低20%以上,建議在初次使用時按用量進(jìn)一步小量分裝凍存。
慢病毒包裝
三、慢病毒包裝常見問題及預(yù)防
1、不宜使用polybrene的常見細(xì)胞系
Polybrene可以通過中和細(xì)胞表面糖蛋白唾液酸殘基所帶電荷起到增加慢病毒感染效率的作用。但對一些細(xì)胞具有明顯細(xì)胞毒性,若使用反而影響實驗效果。這些細(xì)胞有例如:HSC-T6(大鼠肝星型細(xì)胞),Raw264.7(小鼠單核巨噬細(xì)胞白血病細(xì)胞),MCF-7(人乳腺癌細(xì)胞),H929(人多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞),GBC-SD(人膽囊癌細(xì)胞株),NB4(人白血病細(xì)胞株),kasumi(人白血病細(xì)胞株),Jurkat(人白血病細(xì)胞株),等。建議在開始實驗前查閱相應(yīng)文獻(xiàn)報道,以及參考的polybrene工作濃度。
2、過表達(dá)不成功的可能原因
(1)質(zhì)粒構(gòu)建有一定的問題。
(2)由于序列具有特殊結(jié)構(gòu)導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄困難、mRNA十分不穩(wěn)定等情況下,可導(dǎo)致mRNA水平無法顯著過表達(dá)。在排除質(zhì)粒構(gòu)建問題之后,先通過q-PCR驗證目的基因在mRNA水平的過表達(dá),可以同時使用293T等易表達(dá)細(xì)胞作為對照。
(3)如果mRNA水平能夠過表達(dá),可能由于存在翻譯后修飾、密碼子構(gòu)成、翻譯效率、蛋白快速降解等因素,導(dǎo)致蛋白水平過表達(dá)不顯著。同時,使用WB進(jìn)行蛋白水平分析時,需要設(shè)置陽性對照,對實驗條件,尤其是抗體進(jìn)行驗證。
3、如何提高病毒感染效率
除了提高M(jìn)OI以外,還可以從其他角度嘗試改善感染效率。
(1)適當(dāng)減小孵育培養(yǎng)基體積(加入病毒量不變),可增大病毒密度,有利于提高感染效率。減小體積孵育時需考慮對細(xì)胞狀態(tài)、換液時間的影響。例如,96孔板(50ul),24孔板(250ul),6孔板(1ml),小體積孵育4h,然后補液至正常培養(yǎng)體積,繼續(xù)培養(yǎng)24h后換液。
(2)適當(dāng)延長孵育時間。如延至24 h再換液,注意需要兼顧細(xì)胞狀態(tài),主要適用于原孵育時間較短(如4-6 h)時。因為慢病毒在37℃半衰期約8小時,所以一味延長孵育時間效用并不明顯。
(3)Polybrene對于很多細(xì)胞可提高感染效率,但同時也存在細(xì)胞毒性,對部分類別細(xì)胞(如神經(jīng)元、DC細(xì)胞)毒性較大而不宜使用。當(dāng)MOI低于20時,也沒有添加Polybrene的必要。具體細(xì)胞的Polybrene使用濃度可參考文獻(xiàn)報道,以及通過預(yù)實驗確定。通常在4-10 ug/ml范圍。Protamine sulfate作為Polybrene替代物對部分細(xì)胞毒性較小。
(4)如果有可離心孔板的平角離心轉(zhuǎn)頭,可以2200rpm邊離心邊感染2 h(37℃),然后繼續(xù)置于培養(yǎng)箱中按標(biāo)準(zhǔn)條件孵育培養(yǎng)。該方式對于懸浮細(xì)胞的感染尤為有益。
(5)如果細(xì)胞狀態(tài)允許,可進(jìn)行重復(fù)感染。孵育結(jié)束后更換不含病毒的完全培養(yǎng)基,培養(yǎng)16-24 h后,重復(fù)感染過程1-2次,可提高感染效率。
四、 “病毒包裝+蛋白質(zhì)組”專屬方案
方案一:根據(jù)興趣因子尋找下游作用因子
病毒轉(zhuǎn)染到細(xì)胞后,將要研究的基因過表達(dá)或者敲低,通過SILAC和iTRAQ技術(shù),我們可以找到相關(guān)通路差異表達(dá)蛋白,再進(jìn)行相關(guān)通路特定蛋白的驗證,輕松幫您找到您研究的因子的相關(guān)通路關(guān)鍵效應(yīng)因子。
方案二:根據(jù)特定條件尋找特定作用因子
通過SILAC和iTRAQ技術(shù),我們可以篩選特定條件(藥物、刺激因子等)下細(xì)胞(標(biāo)本)蛋白水平的變化,根據(jù)研究課題的方向,找到相關(guān)的通路的差異蛋白。再進(jìn)行特異基因在細(xì)胞水平或者在體水平的干擾或者過表達(dá),進(jìn)行細(xì)胞功能或者在體驗證。