廣大臨床醫(yī)生朋友們,是否還在熬夜看文獻寫標書頭疼不已?Dr.S的臨床醫(yī)生如何發(fā)表高分SCI文章系列又來了,上期咱們說了肺癌(想看點我),今天咱們繼續(xù)從肝癌說起,來分析一篇Hepatology(11.7分)的文章,該期刊是消化領(lǐng)域的老牌雜志,權(quán)威性和影響力相當?shù)母摺?/SPAN>
廢話不多說,我們先解讀一下題目:The microtubule-associated protein PRC1 promotes early recurrence of hepatocellular carcinoma in association with the Wnt/β-catenin signalling pathway
非常經(jīng)典的:A基因通過B信號通路在C疾病中發(fā)揮D功能寫法,建議廣大的醫(yī)生朋友但凡研究基因功能寫標書或?qū)懳恼碌亩急M量按照這個寫法,思路清晰,涵蓋文章的所有要點。
作者不知道哪里找到這么個基因PRC1,發(fā)現(xiàn)這個基因的mRNA和蛋白表達水平在癌旁組織,原位灶和復發(fā)灶中逐漸上升,還和患者預后生存期相關(guān),同時用了TCGA數(shù)據(jù)庫來輔助證明,證據(jù)很扎實。(Dr.S小貼士:很多朋友寫文章的時候以為一定要把自己做了什么樣的篩選找到這個基因的過程寫出來,怕審稿人問基因怎么來的,其實根本不用擔心,基因怎么找到的不是很重要,重要的是基因要有臨床相關(guān)性和功能)
既然基因和肝癌的復發(fā)如此相關(guān),是否有功能呢,下面閉著眼睛也能知道作者要用細胞和動物模型驗證基因功能了,發(fā)現(xiàn)確實把基因敲減了以后細胞也不增值不侵襲轉(zhuǎn)移了,皮下瘤也不長了,漂亮的數(shù)據(jù)。(Dr.S小貼士:如果你做了很多種類似的細胞功能實驗驗證的話細胞系用兩株就ok了,如果你做的細胞功能實驗類型不多的話可以考慮多做幾株細胞)。
臨床相關(guān)性和體內(nèi)外功能都驗證了,下面該做什么了?要沖10分的文章肯定要做深入機制研究嘛。作者發(fā)現(xiàn)PRC1啟動子區(qū)域有TCF4結(jié)合位點因此可能受WNT通路影響,實驗結(jié)果證實了作者的猜想,而且PRC1基因還能夠和Axin1/APC/GSK3B形成蛋白復合物,參與調(diào)控WNT通路下游靶基因。形成了一個反饋負反饋調(diào)控通路。
好了,又一個漂亮的故事誕生了,WNT3a通過結(jié)合細胞外受體激活WNT通路,導致PRC1的表達量上升,而過量的PRC1又通過抑制APC復合物的形成保護B-catenin不被降解,從而導致了WNT通路下游的靶向癌基因(包括PRC1自己)都被激活形成一個惡性循環(huán),最終導致了肝癌的發(fā)生同時促進肝癌的復發(fā)。
Dr.S解讀:
1. 要發(fā)Hepatology,首先你得要有一個具有臨床相關(guān)性,而且有功能的基因,這個基因在所研究的疾病中沒報道過功能。
2. 要想沖10分以上的文章,機制部分可以往上游扯一扯再往下游扯一扯,一定要解釋到目的基因能和哪些蛋白結(jié)合形成復合物,或者目的基因的啟動子區(qū)域哪些堿基受到了上游蛋白的調(diào)控,直接互作機制最好了。
3. 機制部分最好找明星基因或者通路,這樣比較容易把功能回復實驗做出來,因為下游基因的功能肯定是很強的。
4.發(fā)高分文章可以多用幾株細胞來驗證功能(人海戰(zhàn)術(shù)很多時候是很有效的),做機制的話可以只用一株細胞。
根據(jù)吉凱基因的經(jīng)驗,從樣本出發(fā)通過芯片、測序、質(zhì)譜等高通量方法篩選到的候選基因會很多,但從中再得到有功能的新基因的概率大約只有10%,因此想要篩選驗證得到一個新功能基因的難度非常大。吉凱基因歷經(jīng)3年,斥資上億,已完成近6000個腫瘤相關(guān)基因的功能學篩選,已從中找到明確的腫瘤功能標志基因若干,等待您來尋寶~~~
長按加關(guān)注