這篇文章醞釀了很久了。一直沒(méi)敢寫。擔(dān)心自己的積累不夠。這段時(shí)間,看到做中藥的筒子們,不管是拿到國(guó)自然的還是沒(méi)拿到的。在課題設(shè)計(jì)上,總是會(huì)有些瑕疵。所以,今天就壯著膽子,寫出本文。希望能夠給做中藥研究的筒子們一點(diǎn)提示。
在“疾病的最終出路在哪里”中,季博說(shuō)了下,西方科學(xué)研究,用的是化約論。往細(xì)了看。所以大家看SCI文章,做得越細(xì)的,分值越高。而東方科學(xué),是整體論。往大了看。中醫(yī)中藥真要研究好,需要先把“黃帝內(nèi)經(jīng)”學(xué)習(xí)好,這個(gè)是中醫(yī)的醫(yī)理。不過(guò)這個(gè)很難。所以,真要學(xué)好中醫(yī),很難。能理解的人就更少了。再加上如佛學(xué)中講到的,“末法時(shí)代,邪師說(shuō)法如恒河沙”,造成大家對(duì)中醫(yī)中藥的誤解。
在中藥研究中,有個(gè)說(shuō)法,“中藥一個(gè)方子里面分君臣佐使,是集團(tuán)作戰(zhàn)。用西方化約論去研究,肯定不行“。以前季博也感覺(jué)有道理。不過(guò),現(xiàn)在想想,看看西方的研究。查查文獻(xiàn),會(huì)發(fā)現(xiàn),同一個(gè)病,發(fā)病的原因不是一個(gè)基因。但是,一篇高分文章里面,只會(huì)做一個(gè)主要基因。大家明白了嗎。中藥是集團(tuán)作戰(zhàn),但每個(gè)成份都會(huì)有其自身的作用,這個(gè)作用在整體的治療中,功能可大可小,但其功能是存在的。我們采用西方的化約論研究方式,就是要把這個(gè)成份與其發(fā)揮的功能聯(lián)系起來(lái)。這樣,通過(guò)大量的研究,就可以對(duì)整個(gè)方子了解比較全面。從而為中藥的現(xiàn)代化提供”科學(xué)依據(jù)“。抱歉,這里的”科學(xué)依據(jù)“季博打上引號(hào),是西方科學(xué)體系。等每個(gè)成份與其功能闡明清楚后,其實(shí)整合起來(lái)看的話,就需要用整體論了。化約論和整體論,其實(shí)是一個(gè)事物的陰陽(yáng)兩面,不可分開。做中藥研究的筒子們特別要注意,不要否定化約論,同時(shí)也不要拋棄整體論。
說(shuō)了這么多,是想從一個(gè)理論的角度跟大家說(shuō)明下,這篇文章是從化約論的理論體系和方法來(lái)告訴大家怎么去研究中藥。黃帝內(nèi)經(jīng),季博沒(méi)看明白,不敢妄言。
臨床疾病研究,最終的目的是發(fā)現(xiàn)疾病發(fā)生發(fā)展的原因。這個(gè)原因就是候選藥靶。
西藥的研究,是有了候選藥靶后,根據(jù)候選藥靶,尋找藥物。
中藥的研究,是先有藥。然后呢,去看機(jī)制,為啥會(huì)發(fā)生這個(gè)作用,藥靶是誰(shuí)。先有藥,后找藥靶。
所以,中藥的研究,其實(shí)最重要的是找到發(fā)揮功能的藥靶。而這里的藥靶,就是疾病中的功能基因。所以,在做中藥課題設(shè)計(jì)之初,建議先看看“課題設(shè)計(jì)思路“,藥靶是如何被證明的。這個(gè)是做藥的前提。
中藥研究,季博分成3個(gè)部分。1、藥物。2、有效性。3、機(jī)理(藥靶)。
一、藥物
這方面,就是探討有效藥物是什么,F(xiàn)在研究的中藥,可以分為,復(fù)方、減方拆方、單方、單體。
大家注意,單體,其實(shí)就跟西藥一樣了。很多植物來(lái)源的化療藥,其實(shí)就屬這一類。
從研究的角度來(lái)說(shuō),單體好于單方,單方好于減方拆方,減方拆方好于復(fù)方。
所以,在藥物這個(gè)方面,大家找找做藥物分離的老師。尋求合作。
在這方面,從植物藥中分離出單體,鑒定出結(jié)構(gòu),就是SCI文章。如果加上后面兩個(gè)步驟對(duì)單體和藥靶進(jìn)行研究,那就不得了了。
Six enzymes from mayapple that complete the biosynthetic pathway to the etoposide aglycone. Science. 2015.
這篇文章是今年發(fā)在science上的。Etoposide是臨床化療藥,這個(gè)藥的前體是從mayapple中來(lái)的。做講座時(shí),一位主任告訴季博,這個(gè)mayapple就是傳統(tǒng)中藥八角蓮。
這篇文章做的是,這個(gè)前體在植物體內(nèi)是如何合成出來(lái)的。其實(shí)能夠發(fā)science,除了是研究重要的藥物外,更重要的是,為以后可以大規(guī)模生產(chǎn)這種藥物前體做準(zhǔn)備。
二、有效性
季博講座中,說(shuō)為啥相信中藥,一個(gè)原因是中藥是做了幾千年人體實(shí)驗(yàn)的總結(jié)。如果從炎帝神農(nóng)氏開始計(jì)算的話,差不多有5000年了。
不過(guò),大家注意,中藥是否有效,從研究角度來(lái)證明的話,臨床有效,機(jī)理不清楚的話,很難通過(guò)FDA認(rèn)證。這個(gè)就是現(xiàn)在中藥面臨的問(wèn)題。
這里的有效性最主要的是指,動(dòng)物模型和細(xì)胞模型的數(shù)據(jù)。
1 、動(dòng)物模型
疾病建模。單疾病建模,就是很好的課題。在此基礎(chǔ)上,把藥物加進(jìn)來(lái),評(píng)估藥物有效性。
2 、細(xì)胞模型
細(xì)胞模型背景簡(jiǎn)單,易于操作,同時(shí)也易于評(píng)估。這里要注意,細(xì)胞上的檢測(cè)指標(biāo)需要與疾病功能基因研究時(shí)的檢測(cè)指標(biāo)一致。一般建議是增殖凋亡存活方面的指標(biāo)。
為啥建議增殖凋亡方向的指標(biāo)呢,因?yàn)楹米鲅。大家注意,在“臨床疾病的研究思路“講座中,科研的第一步是確定研究的細(xì)胞模型和檢測(cè)指標(biāo)。在這個(gè)過(guò)程中,有兩個(gè)原則。
a 、細(xì)胞模型和檢測(cè)指標(biāo)是什么。需要有高分的參考文獻(xiàn)。也就是我用的細(xì)胞模型和檢測(cè)指標(biāo)與該疾病的關(guān)系,是大家認(rèn)可的。
b 、我能不能做。這個(gè)很重要,很多人課題設(shè)計(jì)得不錯(cuò),但要么是細(xì)胞養(yǎng)不出來(lái),要么是具體實(shí)驗(yàn)做不了。現(xiàn)在國(guó)自然申請(qǐng)中,一審專家很多人在可行性方面做評(píng)估。因?yàn)榇蠹铱次墨I(xiàn)多了,該怎么做,看高分文獻(xiàn)就可以了。但實(shí)際是否真的能夠做,需要結(jié)合研究人員的背景,評(píng)估可行性了。
動(dòng)物模型和細(xì)胞模型檢測(cè)下來(lái),藥物是有功能表型的。那么就接著往下走。當(dāng)然,如果著急發(fā)SCI,只要這里有創(chuàng)新性,是可以去發(fā)SCI的。
三、機(jī)理(藥靶)
這一步就是說(shuō)明藥物為啥有功能表型。其實(shí)就是找受藥物調(diào)控的疾病功能基因。
在疾病研究中,我們希望找到的疾病功能基因,是在正常組中低,疾病組中高。也就是說(shuō),由于這個(gè)基因的高表達(dá)導(dǎo)致了疾病的發(fā)生發(fā)展。這樣的基因作為藥靶的成功率高些。
在中藥研究中,我們希望藥靶的表現(xiàn)是,正常組低,疾病組高,疾病治療組低。季博把這類基因叫做“山“字形基因。三組的表達(dá)差異呈現(xiàn)”山“字形。
在正常組,疾病組,疾病治療組中的“山“字形基因。季博分成3類。
1 、1 類。為已知疾病相關(guān)的信號(hào)通路基因。
這類基因其實(shí)是現(xiàn)在中藥發(fā)SCI最多的一類。分值不高。
2 、2 類。為已知疾病相關(guān)的重要疾病基因。
如果做這類基因,分值就高些了。“p53是抑癌基因嗎-轉(zhuǎn)錄調(diào)控-甲基化乙;-藥靶“這篇文章中的nature文章,所做藥靶季博歸為2類。季博日志中凡是標(biāo)題帶有”藥靶“的文章,希望大家都看看。如果在自己做的篩選過(guò)程的,”山“字形基因中有這些基因在。那么就做這些基因去。因?yàn)榧静┓窒淼奈恼露际莕ature。且基本上是今年的。把這些基因作為自己研究藥物的藥靶,是非常新的。
3 、3 類。未知的疾病相關(guān)基因。
其實(shí),在季博幫人設(shè)計(jì)課題的時(shí)候,如果是著急拿國(guó)自然發(fā)SCI,那么就做做1類2類的藥靶。但其實(shí)3類藥靶是最好的。因?yàn)閯?chuàng)新性是最高的。藥靶是新發(fā)現(xiàn)的,藥物跟藥靶的關(guān)系也是新發(fā)現(xiàn)的。
OK。不管是1類2類還是3類藥靶,都需要在研究中進(jìn)行藥靶鑒定。藥靶鑒定,其實(shí)就是我們的疾病功能基因研究的三大塊,再加上“藥靶與藥物的相關(guān)性“。
疾病功能基因研究的三大塊,臨床相關(guān)性,功能,機(jī)制。這部分大家想了解的話,看下“課題設(shè)計(jì)思路“。
藥靶與藥物的相關(guān)性。其實(shí)與我們做疾病功能基因機(jī)制時(shí),闡明A基因與B機(jī)制間的關(guān)系,其實(shí)是一樣的思路。把A基因換成我們的藥物。
1 、分子相關(guān)性
加藥后,藥靶的改變。
2 、功能相關(guān)性
a 、加藥后,藥靶下降,細(xì)胞有功能表型。那么單獨(dú)把藥靶干擾,看功能表型是否與加藥一致。其實(shí),這里的藥靶如果是1類和2類,這個(gè)實(shí)驗(yàn)別人是已經(jīng)做過(guò)的。我們需要重復(fù)下。
b 、加藥后,藥靶下降,細(xì)胞有功能表型。那么在加藥的前提下,把藥靶做過(guò)表達(dá),看細(xì)胞表型是否回復(fù)。這個(gè)步驟,其實(shí)是很多nature上會(huì)做的。以證明,藥物的功能確實(shí)是通過(guò)該靶點(diǎn)。這就是rescue實(shí)驗(yàn)。
3 、直接互作
這里跟大家說(shuō)聲抱歉。我們說(shuō)到現(xiàn)在的藥靶,是藥物的起效藥靶。是否為直接的結(jié)合靶點(diǎn),不一定。藥物跟藥靶間要做到直接互作的話,藥物需要是單體。從單體找可結(jié)合的蛋白。且該蛋白為疾病功能基因。如果能夠做出來(lái),直接投nature medicine吧。
大道至簡(jiǎn)。在疾病功能基因研究中,總結(jié)一句話就是“A基因通過(guò)調(diào)控B信號(hào)通路影響C疾病的D功能“。創(chuàng)新性放A基因上,也就是A基因與疾病的關(guān)系是首次報(bào)道。
對(duì)于中藥研究。總結(jié)一句話就是“藥物E通過(guò)調(diào)控A基因影響B(tài)信號(hào)通路抑制C疾病的發(fā)生發(fā)展“。創(chuàng)新性放什么地方呢。
1 、藥物E 與疾病的關(guān)系是已知的。
這種情況適合科研剛起步的筒子們。因?yàn)樗幬锱c疾病關(guān)系是已知的,也就是評(píng)估有效性中的動(dòng)物模型或細(xì)胞模型是已知的。那么我們只需要尋找藥靶就可以了。
a 、A基因與疾病的關(guān)系是已知的。
這種情況下,藥物E與疾病是已知的。A基因與疾病關(guān)系是已知的。創(chuàng)新性在于藥物E與A基因的關(guān)系是首次報(bào)道?梢园l(fā)SCI,但創(chuàng)新性小,分值不高。除非,藥物是單體,該單體與A基因直接結(jié)合。
b 、A基因與疾病的關(guān)系是未知的。
這個(gè)是季博建議的方向。因?yàn)閱蜛基因與疾病的關(guān)系,證明好了,就是很好的課題。如果按照“課題設(shè)計(jì)思路“中的去做,做好了10分以上也沒(méi)問(wèn)題。這個(gè)就屬于疾病功能基因研究。在此基礎(chǔ)上把藥物的工作加進(jìn)來(lái)。創(chuàng)新性是有保障的。其實(shí),不少中藥中標(biāo)的國(guó)自然,就是做的這個(gè)地方。
2 、藥物E 與疾病的關(guān)系是未知的。
這種情況,需要先化大精力在疾病模型和有效性評(píng)估上。
因?yàn)樗幬顴與疾病關(guān)系是新的。那么A基因如果是老的話,故事容易被人理解。如果也是新的,創(chuàng)新性好,不過(guò)需要好好設(shè)計(jì)課題來(lái)證明清楚。
這里,季博給大家說(shuō)個(gè)事情。有個(gè)老師,按照中標(biāo)標(biāo)書的課題,設(shè)計(jì)完,能夠發(fā)表SCI文章的前提下。季博提出再找找新的藥物。
中藥有個(gè)說(shuō)法為“扶正祛邪“。扶正為養(yǎng)。驅(qū)邪為毒。這位老師是做腫瘤的。模型啥的都容易搞定。藥物上,季博建議到中藥中找驅(qū)邪的藥物。這類藥物,對(duì)于在腫瘤上來(lái)做研究的話,細(xì)胞和動(dòng)物模型上容易操作。這兩天看到微信上,張亭棟老先生拿到”求是“獎(jiǎng)。Arsenic trioxide ,就是中藥中屬驅(qū)邪,毒的類型。還有就是雷公藤。大家找找吧。
做中藥的筒子們,如果想找人討論課題,可以找季博。因?yàn)槲覀兿胱屇目蒲懈鼘I(yè),更簡(jiǎn)單。同時(shí),季博也希望,大家把中醫(yī)中藥傳承好。
PS:希望和季博在學(xué)習(xí)、實(shí)驗(yàn)上有更多交流的朋友們,可以關(guān)注吉?jiǎng)P基因微信并回復(fù)“季博”兩個(gè)字。