1 菌液的準(zhǔn)備
1.1. 取含目的質(zhì)粒的甘油菌液(-80℃或-20℃冰箱中),待菌液融化后,在超凈臺(tái)用接種環(huán)劃線于氨芐抗性的平板上,37℃倒置培養(yǎng)12-16h。待平板長(zhǎng)出菌落,挑選生長(zhǎng)狀態(tài)良好的單克隆菌落。若無(wú)目的質(zhì)粒的菌液,則需取庫(kù)存質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)化,然后挑單克隆搖菌。
1.2. 將單克隆接種于5ml氨芐抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37℃,220rpm/min,震蕩培養(yǎng)12-16h;
1.3. 將上述的5ml LB菌液分裝到2個(gè)2ml離心管中5000g 離心8 min,棄上清(將離心管倒置于紙巾上數(shù)分鐘,除盡上清),細(xì)菌沉淀待用。
2 腺病毒質(zhì)粒的抽提(參考AxyPrep™ 質(zhì)粒小抽試劑盒說(shuō)明書(shū))
2.1 取250ul 已加入RNase A 的Buffer S1 對(duì)細(xì)菌沉淀進(jìn)行懸浮,將細(xì)菌沉淀吹打需均勻,不應(yīng)留有小的菌塊。
2.2 取250ul Buffer S2加入到上述菌懸液中,溫和并充分地上下翻轉(zhuǎn)6-8 次混合均勻使菌體充分裂解,直至形成透亮的溶液;
2.3 取250ul 4℃預(yù)冷的Buffer S3加入到上述溶液中,溫和并充分地上下翻轉(zhuǎn)10 次混合均勻,直至形成緊實(shí)的凝集塊,室溫放置5 min。
2.4 將上清轉(zhuǎn)移到小抽制備管中,4℃ 5000g 離心1min,然后將小抽制備管從2 ml 離心管中取出,棄離心管中的濾液。
2.5 將制備管放置回離心管,加0.5 ml Buffer W1,5000g 離心1 min,棄濾液。
2.6 將制備管放置回離心管,加0.7ml Buffer W2,5000g 離心1 min,棄濾液;同樣的方法,再用0.7ml Buffer W2 操作一次,棄濾液。
2.7 最后將小抽制備管置回2 ml 離心管中,12,000g 離心1 min,甩干酒精。
2.8 然后將小抽制備管取出,放置于潔凈的1.5 ml 離心管中(試劑盒內(nèi)提供),在小抽制備管的膜上均勻加60-80ul 的Eluent,室溫靜置1 min;然后12000g 離心1 min ,收集離心液,此為小抽質(zhì)粒初液,-20℃保存。
2.9 取適量質(zhì)粒初液進(jìn)行質(zhì)粒濃度測(cè)定,以備后續(xù)的質(zhì)粒酶切線性化試驗(yàn)。
3 腺病毒質(zhì)粒初液的酶切線性化
小抽質(zhì)粒經(jīng)PacI 線性化,體系如下:
10×NEB Buffer I |
10 ul |
質(zhì)粒 |
10-20ug |
100×BSA |
2.0 ul |
Pac I(15 U/ul) |
1.0 ul |
加ddH2O至 |
200.0 ul |
37℃培養(yǎng)箱中酶切過(guò)夜(17-20h左右)。
4 線性化的腺病毒質(zhì)粒純化
4.1 將上述過(guò)夜酶切的產(chǎn)物短暫離心,轉(zhuǎn)移至已滅菌的進(jìn)口EP管內(nèi);然后加入200 ul(等體積)氯仿,上下顛倒混勻, 12000 rpm離心10min。
4.2 小心吸取上層液體至新的已滅菌的進(jìn)口1.5mlEP管內(nèi),加入1/10體積(上清體積)NaAc(3M pH5.2)及2.5倍體積的無(wú)水乙醇(-20℃預(yù)冷),上下顛倒混勻,此時(shí)會(huì)出現(xiàn)明顯的絮狀物即為DNA,-20℃中放置2-3h,13000 rpm離心15min。
4.3 棄上清,加入1ml 75%乙醇,手指輕彈EP管底部幾次,重懸沉淀, 8000 rpm離心5min,棄上清;重復(fù)此步驟。
4.4 重復(fù)步驟3.4.3,浸泡沉淀10min,離心后取出離心管,將離心管帶到細(xì)胞間生物安全柜內(nèi)操作,盡可能棄上清液(最好調(diào)低壓用泵吸,這樣又快又干凈,也可用10ul槍頭吸殘液,以免沉淀被吸走),在安全柜內(nèi)開(kāi)蓋晾干酒精,沉淀由白色變透明即可。
4.5 加入10-20ul滅菌ddH2O溶解沉淀,4℃溶解過(guò)夜,輕彈/用槍吹打均勻后,取出0.5 ul加至含2ul ddH2O(5倍稀釋)后電泳測(cè)定DNA濃度用于濃度的測(cè)定,其余質(zhì)粒-20℃保存。
4.6 計(jì)算質(zhì)粒濃度,做好記錄和標(biāo)記,-20℃保存。
腺病毒表達(dá)載體圖譜:
持續(xù)發(fā)布中......
參考鏈接:http://www.research-bio.com/h-col-159.html