腫瘤早期預(yù)警的血清多肽質(zhì)譜
1. 被檢查者的基本資料的收集:
1.1 被檢查者的基本信息,包括年齡、性別、身高、體重、職業(yè)、民族、飲食習(xí)慣等。
1.2 被檢查者的家族的遺傳史,以往的患病與治療史,過(guò)敏等情況。
1.3 被檢查者的臨床表現(xiàn),包括各種體癥的表現(xiàn),如發(fā)燒,疼痛等。
1.4 被檢查者的臨床影像學(xué)的表現(xiàn),如核磁、CT和PET等。
1.5 被檢查者的病理切片、活檢結(jié)果、細(xì)胞學(xué)觀察、腫瘤標(biāo)志物的檢測(cè)結(jié)果等臨床其它的檢測(cè)結(jié)果。
2. 血清的制備和保存:
2.1 被檢查者早上禁食,上午抽血。
2.2 采用10-20ml的一次性注射器從被檢查者的上臂的靜脈血管抽出5ml血液,抽出后,放入10ml的聚丙烯的塑料管,水平靜置,室溫30分鐘(室溫為25℃)。
2.3 在角轉(zhuǎn)頭小型離心機(jī)中于1400g,室溫,離心10分鐘。
2.4 取出上面的血清,避免取出下層的血漿,將血清分裝成100微升每小管,置于200μl的聚丙烯的塑料管中。
2.5 將裝有血清的200μl的聚丙烯的塑料管立即保存于-80℃?杀46個(gè)月。
3. 運(yùn)用磁珠對(duì)血清進(jìn)行純化:
3.1 徹底渦旋混勻磁珠至少1min,以獲得均一的磁珠混懸液。
3.2 將10μl結(jié)合液和5μl樣品(如人血清)(含有的蛋白最多為500pmol) 轉(zhuǎn)移入一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的薄壁聚丙烯PCR管中。加入5μl混勻的磁珠,上下吹吸5次,小心混合液體。等待1min。
3.3 將PCR管置于一個(gè)磁隔離器(magnetic bead separator,MBS)內(nèi),等待20sec,以將磁珠從上清液中分離。注意管內(nèi)磁珠的運(yùn)動(dòng)。
3.4 用移液器小心移去上清。避免槍頭和磁珠接觸,小心不要移動(dòng)磁珠。
3.5 將PCR管從磁隔離器中轉(zhuǎn)移出來(lái)。
3.6 為了洗滌,加入100μl洗液。
3.7 將PCR管放入磁隔離器內(nèi),將管在臨近孔之間來(lái)回移動(dòng)20次,以洗滌磁珠。
3.8 等待20sec以聚集磁珠于管壁上,用槍小心移去上清。
3.9 重復(fù)步驟6-8兩次。
3.10 在磁珠中,加入5μl乙腈(50%),徹底混勻。等待1min。(小心:乙腈 是易揮發(fā)性的,可快速蒸發(fā)!)。
3.11 將管放置在磁隔離器內(nèi),等待30sec以將磁珠從洗脫液中分離出來(lái),而存留在管壁上。
2.12 最后,將含有純化的多肽/蛋白質(zhì)的洗脫液轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的0.2ml薄壁聚丙烯PCR管中。
4.純化后血清樣品的質(zhì)譜分析
4.1 取1μl洗脫液加入新的0.2ml薄壁聚丙烯PCR管中,加入10μl基質(zhì),混勻,加1μl在Anchorchip靶板上,在空氣中干燥,約5-10分鐘。
4.2 按說(shuō)明書對(duì)質(zhì)譜儀調(diào)整參數(shù),用外標(biāo)進(jìn)行校正,然后對(duì)樣品進(jìn)行分析。
4.3 軟件獲取數(shù)據(jù),處理,得到每個(gè)樣品的質(zhì)譜圖。
4.4 軟件分析,建立疾病組和正常對(duì)照組的標(biāo)準(zhǔn)譜圖,并根據(jù)差異的蛋白峰建立疾病組的特征血清多肽譜。
5.未知樣品的盲性測(cè)試
5.1 取臨床高;蚱詹榈娜巳旱难,按上述方法進(jìn)行資料的收集,血清的采集、保存、純化和質(zhì)譜分析。
5.2 軟件分析與統(tǒng)計(jì),決定其歸屬疾病或健康。
5.3 與臨床金標(biāo)準(zhǔn)如病理、細(xì)胞學(xué)等進(jìn)行比較。
5.4 根據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果,確定未知樣品的盲性測(cè)試準(zhǔn)確率。