2024年P(guān)EAKS中國(guó)第二屆用戶會(huì)完美閉幕
瀏覽次數(shù):1962 發(fā)布日期:2024-7-26
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會(huì)議回顧
2024 年 7 月 18 日,Bioinformatics Solutions Inc. 在上海成功舉辦了“PEAKS®中國(guó)第二屆用戶會(huì)”。此次會(huì)議邀請(qǐng)了國(guó)內(nèi)資深用戶分享運(yùn)用 PEAKS®軟件進(jìn)行各類研究的綜合數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),包括高通量蛋白組、糖蛋白組學(xué)、免疫肽組學(xué)和臨床研究等。
PEAKS®系列軟件作為業(yè)界知名的一站式蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析平臺(tái),一直引領(lǐng)質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展前沿,不斷優(yōu)化算法、迭代產(chǎn)品,以滿足相關(guān)研究領(lǐng)域工作者的各類分析需求。PEAKS®將深度學(xué)習(xí)算法全面應(yīng)用在各數(shù)據(jù)分析流程中,包括PEAKS®特有的DeepNovo和免疫肽組工作流;整合譜圖庫(kù)搜索,直接序列數(shù)據(jù)庫(kù)搜索和從頭測(cè)序的DIA數(shù)據(jù)分析工作流;同時(shí)深度學(xué)習(xí)也賦能DDA數(shù)據(jù)的分析。不斷優(yōu)化的算法,使靈敏度和準(zhǔn)確度都有進(jìn)一步的提高,特別DIA數(shù)據(jù),在PEAKS®12 中更是提升約20%以上。
7 月 19 日,BSI 聯(lián)合上海醫(yī)學(xué)院公共技術(shù)平臺(tái)舉辦了“PEAKS®第七屆蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析及應(yīng)用培訓(xùn)班”。培訓(xùn)班展示了 PEAKS®12 的最新功能及應(yīng)用方向,為相關(guān)科研人員提供了交流學(xué)習(xí)的平臺(tái),促進(jìn)了質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)、生物制藥等領(lǐng)域的研究與發(fā)展,受到了廣大參與者的熱烈歡迎和積極評(píng)價(jià)。
本次用戶會(huì)首先由 Bioinformatics Solutions Inc. 的 CEO 單寶珍博士致開幕詞。單博士在開幕詞中介紹并感謝了特邀嘉賓的到來(lái),感謝所有用戶對(duì)我們PEAKS軟件產(chǎn)品的支持,同時(shí)為大家介紹了BSI公司的背景和發(fā)展歷程,我們聚焦在提供質(zhì)譜技術(shù)與數(shù)據(jù)方案,通過(guò)發(fā)現(xiàn)和靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,幫助用戶揭示蛋白質(zhì)的奧秘。BSI團(tuán)隊(duì)從數(shù)據(jù)層到知識(shí)庫(kù),落地在抗體和免疫多肽等免疫治療的應(yīng)用領(lǐng)域。
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復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院的張瑩研究員分享了通過(guò)一種全新的OPA-S-S-alkyne化學(xué)探針,有效且選擇性地靶向標(biāo)記活細(xì)胞表面的賴氨酸,結(jié)合后續(xù)的點(diǎn)擊化學(xué)和生物素標(biāo)簽富集,用于發(fā)現(xiàn)和識(shí)別出許多新的細(xì)胞表面高反應(yīng)性氨基酸的整體方法,這對(duì)于理解細(xì)胞表面蛋白質(zhì)的功能和藥物開發(fā)具有重要意義。4月8日,陸豪杰/張瑩團(tuán)隊(duì)聯(lián)合在線發(fā)表的相關(guān)研究成果中,質(zhì)譜數(shù)據(jù)的定性定量即使用PEAKS® Online完成。
02
復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系/生物醫(yī)學(xué)研究院?jiǎn)塘裂芯繂T分享了基于深度學(xué)習(xí)和數(shù)據(jù)非依賴采集的糖蛋白質(zhì)組學(xué)分析新方法,主要介紹了針對(duì)完整糖肽的DDA和DIA數(shù)據(jù)分別進(jìn)行譜圖解析的思路,并對(duì)比了不同質(zhì)譜儀、不同的糖譜解析軟件的對(duì)糖基化修飾鑒定的表現(xiàn)。其中,PEAKS® GlycanFinder對(duì)DDA糖肽、糖基化位點(diǎn)的鑒定深度均超過(guò)其他軟件。
03
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院的申華莉研究員分享了標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)和疾病診斷新方法的研究進(jìn)展,從蛋白質(zhì)組學(xué)方法和臨床診斷要求間的差距出發(fā),在不同的人群隊(duì)列中結(jié)合發(fā)現(xiàn)和靶向質(zhì)譜方法,篩選蛋白標(biāo)志物,以期建立基于蛋白質(zhì)組學(xué)的多癌診斷新策略。
04
福建醫(yī)科大學(xué)孟超肝膽醫(yī)院副研究員邢曉華博士分享了基于蛋白質(zhì)組學(xué)的肝癌精準(zhǔn)診療方案,介紹了基于自有平臺(tái)搭建的肝癌蛋白質(zhì)組及翻譯后修飾組學(xué)完善技術(shù)體系,建立腫瘤早期診斷新技術(shù)、新方法與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)方面的基礎(chǔ)與臨床轉(zhuǎn)化研究的最新進(jìn)展。
05
復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院張旭敏研究員分享了超高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究新方案和數(shù)據(jù)分析的挑戰(zhàn),其團(tuán)隊(duì)開發(fā)的102-plex標(biāo)記定量方法突破了傳統(tǒng)兩步標(biāo)記法的限制,解決了定量干擾問(wèn)題,使得等重同位素標(biāo)記定量方法邁入了新高度。
06
Bioinformatics Solutions Inc. CEO單寶珍博士從PEAKS AB單抗從頭測(cè)序到PolySeq.AI的多抗從頭測(cè)序方法切入,分享基于質(zhì)譜的抗體發(fā)現(xiàn)方法。基于PEAKS® AB的單抗從頭測(cè)序技術(shù),通過(guò)多酶解的Bottom up數(shù)據(jù)和Intact 完整分子量的相互驗(yàn)證,自動(dòng)化組裝抗體蛋白的序列,而在多抗從頭測(cè)序方法介紹中,多抗樣品的復(fù)雜度急劇增加,如何通過(guò)多維度液相結(jié)合多維度質(zhì)譜方法通過(guò)AI數(shù)據(jù)處理實(shí)現(xiàn)天然抗體的發(fā)現(xiàn)工作是PolySeq.AI技術(shù)平臺(tái)的核心。
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作為生物信息學(xué)的領(lǐng)軍企業(yè),BSI專注于蛋白質(zhì)組學(xué)和生物藥領(lǐng)域,通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)和先進(jìn)算法提供世界領(lǐng)先的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件和蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)解決方案,以推進(jìn)生物學(xué)研究和藥物發(fā)現(xiàn)。我們通過(guò)基于AI的計(jì)算方案,為您提供對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)、基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數(shù)千家學(xué)術(shù)和工業(yè)用戶,包括:PEAKS®️ Studio,PEAKS®️ Online,PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB,DeepImmu®️免疫肽組發(fā)現(xiàn)服務(wù)和PEAKS®️ AB抗體綜合表征服務(wù)等。
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