最近的大流行提高了醫(yī)療環(huán)境中潛在病原體的空氣傳播對員工和患者的風險。需要監(jiān)測傳染性氣溶膠的存在,從而降低風險。但是傳統(tǒng)的基于培養(yǎng)基的空氣采樣技術(shù)非常耗時,并且在能夠檢測到的微生物范圍內(nèi)受到限制。
Bertin Technologies的Coriolis空氣采樣器系列為這些問題提供了一個很好的解決方案,無論目標生物是細菌、真菌還是病毒。以下對Floriane Cohen博士(Bertin Technologies的現(xiàn)場應用科學家)的獨家采訪中,了解Coriolis系列為難培養(yǎng)的生物檢測帶來的好處,幫助解決病原體在臨床環(huán)境中造成的潛在空氣傳播風險。
Q:監(jiān)測醫(yī)療環(huán)境空氣中的病原體——這是一個新概念,還是新冠肺炎突出了傳播風險?
Floriane:了解呼吸道病毒在空氣中的傳播行為一直是管理疫情和為醫(yī)護人員和患者設計適當預防和控制措施的關鍵步驟。Covid-19大流行突出表明迫切需要改進醫(yī)療環(huán)境中生物氣溶膠的現(xiàn)有監(jiān)測方法。
Q:為什么 Coriolis非常適合這種應用?
Floriane:Coriolis空氣采樣器是檢測醫(yī)療環(huán)境中微生物的理想儀器。收集攜帶病毒的氣溶膠采樣帶來許多挑戰(zhàn)。因為病毒在空氣中的濃度非常低,必須收集大量空氣才能獲得可靠的結(jié)果。這可能是一個極其耗時的過程,有時需花費長達一周的時間來收集。
Coriolis μ空氣采樣器的流速高達300L/min,因此可以在幾小時內(nèi)收集到足夠的空氣樣本,用于檢測空氣中的病毒。通過其獨特的液體旋流技術(shù),它可以在特定的收集液中收集病毒顆粒。Coriolis μ樣品與所有快速微生物學技術(shù)兼容,如qPCR或微陣列,也可用于NGS分析。在收集的空氣樣本中可以檢測到低至100個基因組拷貝/立方米的病毒濃度。
空氣病毒監(jiān)測的主要挑戰(zhàn)之一是如何獲得足夠濃縮的樣本。憑借干式采樣技術(shù),Coriolis Compact成為檢測醫(yī)療環(huán)境中空氣病毒的理想儀器。每次采集后,用戶可以選擇他們希望重新溶解樣品的溶液體積。此外,還可以選擇能夠保護樣本中核酸的溶液。例如,在收集諸如SARS-CoV-2等RNA病毒的情況下,用戶可以選擇立即在Trizol中重懸樣本,以保護RNA免受降解。
Q:在醫(yī)療環(huán)境中開始空氣監(jiān)測計劃之前,應考慮哪些問題?
Floriane:在醫(yī)療環(huán)境中設計采樣策略時,需要考慮以下幾個方面。
例如,根據(jù)房間布局和空氣中的病毒濃度,Coriolisμ的定位可能有多種采樣策略。對于醫(yī)療保健設置,設備的最佳位置是距離患者床約1米,與患者頭部高度大致相同。如果在患者房間的多個點收集空氣樣本,則最好從離患者最遠的位置開始,逐步靠近。為了實現(xiàn)最佳顆粒收集,設備應始終放置在房間氣流的軌跡上。
Q:SARS-CoV-2是目前備受關注的病原體,如何使用Coriolis檢測SARS-CoV-2和其他呼吸道病毒?
Floriane:由于病毒在空氣中的濃度通常非常低,因此仔細設計采樣策略和樣本分析方案非常重要。
流速高于200L/min的采樣器在收集期間可能會發(fā)生RNA病毒降解。因此,我們建議使用200L/min或以下的氣流速度。
如有可能,最好采用更高的采樣持續(xù)時間,以盡可能收集最大體積的空氣,理想情況下,以200L/min的速度采集20至30分鐘。我們建議為所有專門用于病毒檢測的實驗收集至少3m3的空氣。Coriolisμ電池續(xù)航收集空氣長達一小時,通過主電源的長時間監(jiān)測選項可收集空氣長達6小時。Coriolis緊湊型電池以50L/min的速度可工作8小時。
由于用Coriolisμ獲得的樣品是液體形式,所以它們與所有快速微生物學技術(shù)兼容,如qPCR、RT-qPCR和微陣列。樣品也可以通過病毒活性測定進行分析。研究表明,與干式空氣采樣器相比,液體空氣采樣劑在采樣過程中對病毒的傷害較小,這意味著它們更適合病毒生存能力研究。關于DNA/RNA提取步驟,我們建議使用陽性對照來驗證提取方案。
Q:真菌生長緩慢是出了名的,如何能更快地產(chǎn)生真菌研究效果?
Floriane:Coriolis采樣樣品與所有快速微生物學技術(shù)兼容,包括PCR。對于真菌,研究人員可以在幾個小時內(nèi)通過PCR獲得結(jié)果,而不是等待數(shù)周的真菌培養(yǎng)結(jié)果。
Q:自從新冠肺炎以來,越來越多的機構(gòu)推出了空氣凈化解決方案,Coriolis在監(jiān)測這種方法的有效性方面是否有用?
Floriane:我們的Coriolis空氣采樣器系列已被證明是空氣監(jiān)測(病毒、細菌和真菌檢測)和評估去污方案效率的有用工具。
Q:進行監(jiān)測空氣傳播病原體風險困難嗎?Bertin是否能夠提供技術(shù)支持?
Floriane:如果您正在啟動一項新的計劃來監(jiān)測空氣傳播病原體的風險,Bertin的支持團隊很樂意通過文獻、采樣策略建議等方式來評估您的監(jiān)測需求,為您提供幫助。
Q:Coriolis用戶的反饋是什么?
Floriane:我們的用戶對Coriolis空氣采樣器的易用性和實驗之間的消毒評估表示贊賞。
Q:說說這個應用指南——對負責醫(yī)院感染監(jiān)控的人能從中學到什么?
Floriane:本應用指南介紹了監(jiān)測醫(yī)療環(huán)境中生物氣溶膠的技巧。我們還舉例說明了專家如何使用Bertin的Coriolis空氣采樣器檢測醫(yī)院中多種類型的空氣傳播病原體,包括細菌、真菌和病毒,并進行可行性研究。
Floriane Cohen博士是Bertin Technologies的現(xiàn)場應用科學家。她于2018年畢業(yè)于巴黎索邦大學,獲得生物物理學博士學位。
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