隨著國家藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)了一批 AAV 制劑的臨床試驗申請,越來越多的 AAV 制劑進(jìn)入大眾視野。AAV 制劑中病毒滴度的準(zhǔn)確定量,是影響療效的關(guān)鍵因素。因此建立準(zhǔn)確、穩(wěn)定的檢測流程對于細(xì)胞和基因治療企業(yè)來說尤為重要。數(shù)字 PCR 作為新一代的核酸定量工具,以其絕對定量與精準(zhǔn)性高等特點,被細(xì)胞和基因治療行業(yè)快速接納并應(yīng)用。
腺相關(guān)病毒(AAV)的介紹
腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus,AAV)是一類單鏈線狀 DNA 缺陷型病毒,需要輔助病毒(如腺病毒、單純皰疹病毒、痘苗病毒)存在時,才能進(jìn)行復(fù)制。在基因治療的研究中,通常使用不需輔助病毒的重組 AAV 病毒(rAAV)將目的基因序列插入 rAAV 表達(dá)質(zhì)粒中,包裝病毒,然后直接使用 rAAV 感染細(xì)胞就能完成目的基因的插入操作。rAAV 作為基因療法載體有以下優(yōu)勢:安全性高、免疫原性低;宿主細(xì)胞范圍廣;擴(kuò)散能力強(qiáng);體內(nèi)表達(dá)基因時間長;適用種類多樣等。
腺相關(guān)病毒 AAV 的檢測
AAV 制劑的滴度檢測是生物企業(yè)中重要的環(huán)節(jié),穩(wěn)定及精確的檢測結(jié)果是臨床給藥的基礎(chǔ)保障。根據(jù)現(xiàn)有的檢測手段及原理,可以將其分為物理滴度及感染滴度兩大類型。物理滴度主要是指病毒顆粒滴度及基因組滴度,感染滴度主要指目的基因的轉(zhuǎn)導(dǎo)滴度。
物理滴度目前的主流方法是熒光定量法(qPCR),但 qPCR 往往由于其本身的技術(shù)原因,不同批次試劑中不同的標(biāo)準(zhǔn)曲線會影響其對最終濃度的計算,導(dǎo)致最終的滴度計算有所偏差。
達(dá)普生物提供一種更精準(zhǔn)的檢測方案 —— 微滴式數(shù)字 PCR,可以直接量化 DNA 拷貝數(shù)。這種方法具有以下特點:
1. 絕對定量:無需標(biāo)準(zhǔn)曲線,直接定量目的序列,減少實驗復(fù)孔及標(biāo)準(zhǔn)曲線帶來的額外操作和實驗誤差。
2. 更加準(zhǔn)確:與 qPCR 相比,數(shù)字 PCR 可以消除不同 PCR 反應(yīng)擴(kuò)增效率的不同引入的定量偏差。
3. 更加精確:實驗重復(fù)性好,實際樣品測試結(jié)果 CV<15%;且不受人為因素影響,在不同實驗人員操作的情況下,結(jié)果均顯示較小差異。
qPCR vs 數(shù)字 PCR
|
qPCR |
數(shù)字 PCR |
定量能力 |
依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線,相對定量 |
絕對定量 |
精準(zhǔn)度 |
好 |
極佳 |
重復(fù)性 |
好 |
極佳 |
抑制劑耐受情況 |
一般 |
較好 |
數(shù)據(jù)分析 |
人工劃定閾值 |
儀器自動分析 |
正是由于以上優(yōu)點,美國藥典章節(jié) “US Pharmacopeia Standards for Cell and Gene Therapy” 中,對 AAV 制劑的滴度測定推薦了數(shù)字 PCR 方法用于替代 qPCR 方法。
達(dá)普生物 AAV 病毒核酸滴度檢測套裝
為推動 AAV 病毒滴度更加精準(zhǔn)定量,助力 AAV 制劑療法的深入研究。近日,達(dá)普生物基于星云數(shù)字 PCR 平臺,自主設(shè)計開發(fā)了 “腺相關(guān)病毒(AAV)滴度檢測試劑盒(數(shù)字PCR法)”。達(dá)普生物的星云數(shù)字 PCR 平臺搭配本試劑盒,為客戶提供從病毒制品準(zhǔn)備到結(jié)果導(dǎo)出的完整解決方案,可應(yīng)用于 AAV 生產(chǎn)制造中的質(zhì)量控制。
達(dá)普生物-腺相關(guān)病毒(AAV)滴度檢測試劑盒優(yōu)勢:
- 操作簡便:無需標(biāo)準(zhǔn)曲線,試劑盒利用率高。
- 兼容性好:適合多種血清型檢測。
- 準(zhǔn)確性好:具有較好的靈敏度、特異性,不受部分序列二級結(jié)構(gòu)影響。
- 性價比高:數(shù)字 PCR 方法與 qPCR 方法實際耗材成本相似。
- 優(yōu)化流程:部分制品可使用免提取策略直接檢測培養(yǎng)物中的病毒滴度。
線性關(guān)系展示
實驗流程優(yōu)勢:數(shù)字 PCR vs qPCR
數(shù)字 PCR 實驗排布
數(shù)字 PCR 定量檢測無需標(biāo)準(zhǔn)曲線
● 低濃度重復(fù)性較好
qPCR 實驗排布
qPCR 定量檢測需要標(biāo)準(zhǔn)曲線
● 多批次,樣品少的檢測環(huán)境需要重復(fù)多次標(biāo)準(zhǔn)曲線
● 標(biāo)準(zhǔn)品需要稀釋,操作要求較高,重復(fù)性(尤其是低濃度)欠佳
達(dá)普生物數(shù)字 PCR 系統(tǒng)軟件合規(guī)性
為滿足企業(yè)客戶需求,達(dá)普生物數(shù)字 PCR 分析軟件 - Astrolabe 合規(guī)版軟件系統(tǒng)功能符合 FDA 21 CFR Part 11 法規(guī),經(jīng)檢測保留的數(shù)據(jù)可作為檢驗后追溯的有效數(shù)據(jù)來源,確保生物醫(yī)藥企業(yè)生產(chǎn)、質(zhì)控中數(shù)據(jù)記錄的合規(guī)性。
參考文獻(xiàn):
1. Adeno-associated virus vector as a platform for gene therapy delivery;Nat Rev Drug Discov. 2019 May ; 18(5): 358–378. doi:10.1038/s41573-019-0012-9.
2. Absolute determination of single-stranded and self-complementary adeno-associated viral vector genome titers by droplet digital PCR;Hum Gene Ther Methods. 2014 Apr 1; 25(2): 115–125.Published online 2013 Dec 12. doi: 10.1089/hgtb.2013.131
3. https://en.wikipedia.org/wiki/
關(guān)于達(dá)普
達(dá)普生物科技有限公司孵化于香港科技大學(xué),于 2018 年由多位海歸博士共同創(chuàng)立。在深圳、嘉興、香港三地設(shè)有研發(fā)中心,研發(fā)團(tuán)隊近百人,建立了集微流控芯片、儀器及試劑生產(chǎn)為一體的 GMP 廠房。
公司專注于將液滴微流控技術(shù)應(yīng)用于精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,致力于成為集微流控芯片、儀器、試劑的研發(fā)和生產(chǎn)于一體的完整解決方案提供商。公司自主研發(fā)、生產(chǎn)三大技術(shù)平臺:高通量篩選系統(tǒng)、數(shù)字 PCR 系統(tǒng)和單細(xì)胞組學(xué)系統(tǒng),應(yīng)用于高通量藥物質(zhì)檢、抗體篩選、生物制品質(zhì)檢、癌癥研究、癌癥早期篩查、靶向治療、無創(chuàng)產(chǎn)前診斷和病毒定量檢測等領(lǐng)域。
更多產(chǎn)品
●彗星高通量篩選系統(tǒng)
1. 基于熒光標(biāo)記及電介泳效應(yīng)推動分選,無損傷;
2. 接駁星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng),提高建庫質(zhì)量并降低測序成本;
3. 接駁星云數(shù)字 PCR 系統(tǒng),篩選陽性液滴,富集微量靶標(biāo) ,降低測序成本;
4. 快速單克隆抗體細(xì)胞株或轉(zhuǎn)染陽性單細(xì)胞篩選。
●星云全自動數(shù)字PCR系統(tǒng)
1. 專利壓力不敏感液滴生成技術(shù):液滴生成大小均一,擴(kuò)增更穩(wěn)定;
2. 3.5 分鐘內(nèi)可同時處理 1-32 個樣本:上樣靈活,滿足高通量需求;
3. 液滴可回收,接駁彗星高通量篩選系統(tǒng),后續(xù)用于測序或目標(biāo)基因檢測。
●星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng)
1. 采用獨家開發(fā)的水凝膠編碼微球和液滴微流控技術(shù),性能優(yōu)越;
2. 針對不同細(xì)胞數(shù)、種類及上樣量,1-4 通道,靈活調(diào)整,使用更加方便;
3. 流程靈活,可以接駁下游流程。
達(dá)普生物ThunderBio
達(dá)普生物科技有限公司致力于成為集微流控芯片、儀器、試劑、耗材研發(fā)生產(chǎn)一體的完整解決方案提供商。自主研發(fā)生產(chǎn)的兩大技術(shù)平臺:數(shù)字PCR和單細(xì)胞組學(xué)系統(tǒng)。產(chǎn)品適用于癌癥早期篩查、靶向治療、無創(chuàng)產(chǎn)前診斷、病毒定量檢測、高通量藥物和抗體篩選等領(lǐng)域。