2022年7月14日,湖南省益陽市資陽區(qū)對集中隔離醫(yī)學(xué)觀察點隔離人員例行正常核酸檢測時,發(fā)現(xiàn)省外涉疫地區(qū)返資人員一例核酸檢測初篩陽性。
7月15日中午,市委市政府向華大智造發(fā)出對核酸檢測陽性樣本進行新冠溯源分析的邀請。受領(lǐng)任務(wù)后,華大智造緊急調(diào)運最新款DNBSEQ-E5測序儀、新冠溯源ATOPlex建庫試劑和技術(shù)支持人員馳援益陽市疾控中心。
基因測序設(shè)備于7月15日夜間運抵市疾控中心,技術(shù)支持人員現(xiàn)場裝機、連夜奮戰(zhàn),市疾控中心檢測檢驗人員于當(dāng)日22時開始對資陽區(qū)疾控中心在7月15日早晨采集的樣本進行處理、建庫、上機測序,7月16日11時許獲得測序結(jié)果。病毒序列全長覆蓋率99.5%,確定分型為BA.2.2毒株。
圖1:益陽市疾控裝機的DNBSEQ-E5首次新冠病毒測序過程
此前,國家發(fā)改委等四部門聯(lián)合印發(fā)了《“十四五”優(yōu)質(zhì)高效醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)體系建設(shè)實施方案》,方案中指出,國家和重點區(qū)域疾病預(yù)防控制機構(gòu)需具備新發(fā)傳染病病原體、健康危害因素“一錘定音”檢測能力和重特大公共衛(wèi)生事件處置能力。
此次益陽市疾控中心在華大智造基因測序設(shè)備加持下,快速準(zhǔn)確完成新冠溯源分析,標(biāo)志著益陽市疾控中心初步具備了對新冠病毒進行基因測序的能力,為益陽市新冠肺炎疫情以及其他傳染病的病原體鑒定溯源、應(yīng)急處置提供了強大的技術(shù)支撐。
華大智造基于DNBSEQ技術(shù)的新冠病毒靶向測序產(chǎn)品組合,已幫助全國十余省近百家疾控中心進行新冠溯源病毒,為疫情防控工作提供有效依據(jù),全面助力各地新冠病毒鑒定與溯源工作。而采用了微流控測序載片和集成信號采集模塊的DNBSEQ-E5快速測序儀,攜同ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1緊急響應(yīng),已連續(xù)部署至超過10個新冠疫情熱點地區(qū),測序結(jié)果表現(xiàn)優(yōu)異,高效完成新冠溯源。
圖2:華大智造DNBSEQ-E5助力多地新冠溯源工作
目前,基于全新優(yōu)化加速的DNBSEQ-E5及其快速測序試劑進行SE100測序,最快可在3.5小時內(nèi)完成從DNB加載至FASTQ文件輸出的全流程。測序完成10分鐘內(nèi)輸出新冠病毒變異位點基因注釋、變異支系鑒別、全長序列,支持移動部署,能夠即時響應(yīng)特殊樣本的緊急測序需求,適用于一線海關(guān)、疾控等機構(gòu)。
作為生命科技核心工具締造者的華大智造,一直深知公共衛(wèi)生、精準(zhǔn)醫(yī)療等多個應(yīng)用領(lǐng)域?qū)τ诳s短樣本周轉(zhuǎn)時間的期待。我們將持續(xù)致力于打造更快、更便捷的基因測序儀等生命科學(xué)核心設(shè)備,為應(yīng)對快速發(fā)現(xiàn)、準(zhǔn)確變異跟蹤的疫情防控需求提供硬核支撐保障。