培訓(xùn)班介紹

隨著我國精準(zhǔn)醫(yī)療計劃的全面啟動，包括腫瘤、心腦血管、代謝性疾病、免疫性疾病及罕見病等多種高發(fā)重大疾病被列入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的研究范疇，通過對基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組及代謝組等多組學(xué)數(shù)據(jù)的深度整合和深度挖掘，并結(jié)合多種臨床數(shù)據(jù)，希望實現(xiàn)精準(zhǔn)的疾病分類和診斷，制定具有個性化的疾病預(yù)防和診療方案。在邁向精準(zhǔn)醫(yī)療的道路上，蛋白質(zhì)組學(xué)扮演了重要的角色：它是基因組的表型，更接近生命活動的當(dāng)下狀態(tài)，更合適作為一個動態(tài)的生化指標(biāo)，更直接地判斷疾病的發(fā)生和發(fā)展！隨著腫瘤研究領(lǐng)域基因組與蛋白質(zhì)組的深度對接，蛋白質(zhì)組的臨床轉(zhuǎn)化之路在摸索中發(fā)展，在發(fā)展中加速！而高通量質(zhì)譜實驗技術(shù)及數(shù)據(jù)分析方法的不斷成熟與更新，進一步激發(fā)了蛋白質(zhì)組學(xué)在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)力和突破！

為了更好地交流分享基于蛋白質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的新實驗技術(shù)、數(shù)據(jù)分析方法，以及具有代表性的應(yīng)用實例，賽默飛世爾科技與上�？店攀⒐�司以及克里克學(xué)院合作推出了本次培訓(xùn)班，于2016年7月9日-10日、16日-17日、30日-31日，分別于上海、北京和廣州舉辦。培訓(xùn)課程包括基礎(chǔ)課程和應(yīng)用課程兩個部分，邀請了中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)算法專家、賽默飛世爾資深應(yīng)用科學(xué)家、康昱盛公司高級應(yīng)用科學(xué)家，為大家講授從樣品制備、質(zhì)譜實驗到數(shù)據(jù)處理、深度分析以及相關(guān)數(shù)據(jù)庫使用的基礎(chǔ)知識，并有幸邀請到分別來自復(fù)旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、暨南大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院的多位專家教授，為大家介紹前沿的臨床應(yīng)用，分享他們多年沉淀的寶貴科研經(jīng)驗和令人矚目的科研成果！

本次培訓(xùn)班面向?qū)Φ鞍踪|(zhì)組學(xué)感興趣的醫(yī)學(xué)及臨床科研人員，以及參與臨床合作研究的蛋白質(zhì)組學(xué)基礎(chǔ)科研人員以及生物信息學(xué)研究人員，同時歡迎有志于投身臨床蛋白質(zhì)組學(xué)及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究生及本科高年級學(xué)生。為滿足廣大同行的培訓(xùn)需求，同時控制人數(shù)，保證培訓(xùn)質(zhì)量，本次培訓(xùn)班計劃在上海、北京及廣州各辦一場，每場時間為兩天，第一天及第二天下午的課程相同，第二天上午應(yīng)用課程的授課老師和授課內(nèi)容各不相同，請有意報名的學(xué)員注意查看每一場課程安排的詳細情況，以便選擇最合適自己的場次。若有任何問題，歡迎通過電話或郵件等方式聯(lián)系組委會工作人員，我們會竭誠為您服務(wù)，并熱烈期盼您的參加！

 

8:00 – 9:00             注冊

9:00 – 9:15            開班儀式

9:15 – 10:00    臨床蛋白質(zhì)組學(xué)樣品前處理

                 —臨床細胞、組織樣本前處理

                 —臨床體液樣本前處理（血漿、尿液等）

                 —臨床小量樣本前處理（LCM等）

                 —蛋白質(zhì)復(fù)合物免疫沉淀

                 —蛋白質(zhì)酶解、除鹽、分級等

                 —修飾肽段富集（磷酸化、糖基化等）

                 —蛋白質(zhì)組學(xué)定量方法

10:00 – 10:45   臨床蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一

                 —蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析基礎(chǔ)

                 —Oribtrap質(zhì)譜技術(shù)簡介

                 —未知蛋白質(zhì)與后修飾鑒定

10:45 – 11:00            茶歇

11:00 – 12:00   臨床蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析二

                 —表達差異比較與標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)

                 —樣本數(shù)字化與標(biāo)志物驗證

                 —目標(biāo)蛋白定量與臨床檢測

12:00 – 13:30         午餐及午休

13:30 – 14:15   蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)基礎(chǔ)知識

                 —蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)類型及格式

                 —蛋白質(zhì)質(zhì)譜譜圖原理及介紹

                 —蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集策略介紹

14:15 – 15:15   蛋白質(zhì)定性數(shù)據(jù)解析要點

                 —肽譜匹配基本原理 

                 —搜庫參數(shù)設(shè)置優(yōu)化 

                 —譜圖信息的深度解析

15:15 – 15:30           茶歇

15:30 – 16:15   蛋白質(zhì)定量數(shù)據(jù)解析要點

                 —定量技術(shù)介紹  

                 —定量算法及軟件介紹  

                 —精確定量面臨的挑戰(zhàn)

16:15 – 17:00   數(shù)據(jù)解析流程及統(tǒng)計分析 

                 —肽段到蛋白質(zhì)的歸并

                 —顯著性計算及差異表達蛋白質(zhì)

                 —論文中常見的統(tǒng)計描述錯誤及更正方法

17:00 – 17:30          答疑

 

9:00 – 10:20       專題報告：

                    Finding Molecular Mechanisms underlying Tumorigenesis and 
                    Progression from Proteomic Data （北京站）

                

10:20 – 10:40      茶歇

10:40 – 12:00      專題報告：

                    尿液是早期敏感的生物標(biāo)志物來源（北京站）

                

12:00 – 13:30      午餐及午休

13:30 – 14:45      蛋白質(zhì)組學(xué)常用數(shù)據(jù)庫及使用方法

                    —介紹常用的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫的特點，應(yīng)用范圍及操作方法

14:45 – 15:45      蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)的深度注釋與生物通路分析

                    —蛋白功能注釋與生物學(xué)效應(yīng)分析

                    —蛋白質(zhì)的功能異常與疾病的關(guān)聯(lián)

                    —蛋白與蛋白及蛋白與小分子相互作用網(wǎng)絡(luò)

                    —蛋白上游調(diào)節(jié)因子

15:45 – 16:00      茶歇                          

16:00 – 17:00      蛋白質(zhì)組學(xué)與其它組學(xué)數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)分析

                    —蛋白質(zhì)組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)關(guān)聯(lián)分析

                    實例解析

                    —蛋白質(zhì)組學(xué)與代謝組學(xué)關(guān)聯(lián)分析

                    實例解析

17:00 – 17:30      答疑