各有關單位：
蛋白質(zhì)通常被稱為生命的基石，它們幾乎參與了細胞內(nèi)的每一個過程，包括生長、分裂和修復。蛋白質(zhì)是生命活動的體現(xiàn)者，其結構決定著功能。由線性氨基酸組成的蛋白質(zhì)需要折疊成特定的空間結構才具有相應的生理活性和生物學功能。解析蛋白質(zhì)的空間結構可以更準確地認識蛋白質(zhì)的功能、功能的執(zhí)行、及生物大分子間的相互作用。然而，隨著人工智能及大數(shù)據(jù)的快速發(fā)展，蛋白質(zhì)可以通過人工智能設計從而解鎖更多的功能，這在食品學、醫(yī)學和藥學的發(fā)展(如多肽、酶、藥物靶點的設計等）具有重要意義。因此，為了進一步挖掘蛋白質(zhì)新功能與充分發(fā)揮人工智能在醫(yī)藥及生物領域的快速發(fā)展，協(xié)會決定于2024年12月27-29日在線上（小鵝通平臺）舉辦“第二期基于AI的蛋白質(zhì)結構解析與智能設計專題培訓班。”屆時將邀請行業(yè)內(nèi)知名專家針對相關內(nèi)容進行講解與探討。參會名額有限，望各有關單位積極轉發(fā)或組織相關人員盡快報名參加�，F(xiàn)將有關事項通知如下：

一、會議安排：
直播平臺：小鵝通在線直播平臺
12月27日：下午15：00-15：30平臺網(wǎng)絡及設備測試
12月28日-29日：上午9：00-12：00，下午14：00-17：00培訓課程（詳情參考附件一）
二、培訓形式
理論講解，實例分析，專題講授，互動答疑
三、組織機構
主辦單位：中國化工企業(yè)管理協(xié)會醫(yī)藥化工專業(yè)委員會
承辦單位：中科凱晟化工技術研究院/藥成材在線直播平臺
四、培訓課程及專家情況（詳情參考附件一）
五、培訓對象
1.蛋白質(zhì)工程領域科研單位專家及學者；
2.醫(yī)學、藥學及食品學院校及企業(yè)蛋白質(zhì)功能開發(fā)負責人；
3.生物及化工工程領域從業(yè)工作者。
六、會議費用
4000元/單位，可投屏全員觀看（含5個直播鏈接、2本資料、1個月有效期回放）
七、問題及報告征集（截止到12月20日）：
請在回執(zhí)表問題征集欄填寫您所關注及遇到的問題，我們會及時與講師溝通，以便講師在備課時更具備針對性。
八、聯(lián)系方式：
電    話：13001080157（同微信）         
聯(lián) 系 人：趙老師               
電子郵箱：zghg2012@126.com
 
附件一：會議課程安排表
附件二：參會報名表    

12月27日下午15：00-15：30線上測試

（第一天）12月28日，  上午9:00-12:00;  下午14:00-17:00

《結合AI的蛋白質(zhì)結構解析與預測》 1、蛋白質(zhì)結構的重要性、結合AI的蛋白質(zhì)結構解析方法與實踐（3h）； 1.1 蛋白質(zhì)結構AI預測軟件介紹，優(yōu)缺點、精度、適用條件(陳榮昌 30min)。 1.2 AI時代的結構解析特點和流程( SPA、結晶、NMR技術方案選擇依據(jù)，AI帶來的便利性,基本流程介紹)--楊銀龍 60min 1.3  AI時代服務于結構解析的蛋白樣品制備(程洪金 60min) 1.3.1表達方案制定依據(jù)、表達體系選擇、質(zhì)粒標簽選擇。 1.3.2經(jīng)典案例。 2、結合AI的蛋白質(zhì)結構預測、優(yōu)化途徑與實踐（3h）。 2.1 AI模型對于結構解析的幫助，帶來的好處。AI蛋白質(zhì)預測軟件使用 alphafold2 ,alphafold3使用。 2.2 AI模型用于結構解析案例實際操作（晶體 prfaH） 2.3 AI模型用于結構解析案例實際操作（SPA 煙草花葉病毒） 2.4晶體結構質(zhì)量的評價指標、PDB數(shù)據(jù)提交等數(shù)據(jù)發(fā)表 楊老師，山東第一醫(yī)科大學碩士研究生，在蛋白表達純化，晶體培養(yǎng)和結構解析方面擁有豐富科研經(jīng)驗，目前在青云瑞晶擔任項目經(jīng)理一職。曾參與多個國家基金項目的申請和開展，學習期間主要從事細菌和病毒致病蛋白的結構和功能研究，后續(xù)在清華大學藥學院學習藥物功能研究和真核蛋白表達純化。先后參與發(fā)表Cell Reprot論文2篇，Cancer Immunology Research論文1篇，Nucleic Acids Research論文1篇。 程老師，碩士畢業(yè)于天津科技大學制藥工程專業(yè)。曾就職于濰坊制藥廠、青島漢唐生物科技有限公司。全面負責蘇州青云瑞晶表達純化部門工作，主要從事重組蛋白的表達與純化工作，掌握大腸桿菌、昆蟲細胞、哺乳動物細胞、酵母細胞等多種表達系統(tǒng)蛋白的表達，熟練掌握各種純化方式(親和純化、離子柱及分子篩純化)。熟悉整個靶標蛋白的獲得及制備流程，從基因到蛋白表達純化，再到晶體結構功能研究，整個領域不僅掌握了相關的致病機理，還從微觀原子結構進行解釋。累計完成150余個靶點蛋白的評估方案制定及制備，為下游結構解析提供支持。累計交付蛋白CRO客戶100+以上。熟 練 使 用 SnapGene ，Geneious，Pymol 等分子結構相關軟件。 熟練使用Origin，office，PS，Ai 等作圖辦公軟件。 傅老師，畢業(yè)于美國東北大學。曾就職于默克集團，上海維亞生物公司�，F(xiàn)于青云瑞晶全面負責X-ray晶體學結構解析工作，有豐富的蛋白質(zhì)結構解析經(jīng)驗,每年處理大分子晶體數(shù)據(jù)2000+，交付精修大分子晶體結構500+，精通用計算機腳本搭建結構解析管線，精通結構解析相關軟件phenix、coot、 CCP4、XDS、 CrysAlisPro、DIALS及pymol。精通aphlafold2、aphlafold3、schrodinger、MOE等軟件的使用。在處理多晶、孿晶、tNCS等數(shù)據(jù)積累了豐富的經(jīng)驗。精通特殊模型搭建(共價修飾)及PDB數(shù)據(jù)提交，成功幫助客戶提交PDB結晶50+。精通Cryosparc、relion軟件。 陳老師，博士，蘇州青云瑞晶生物科技有限公司，結構生物學負責人。畢業(yè)于中國科學院生物物理研究所結構生物學專業(yè)，師從葉克窮教授從事RNA蛋白質(zhì)復合物的結構生物學研究。從2009年開始蛋白質(zhì)RNA復合物的結構生物學研究，有10年以上的蛋白質(zhì)表達純化及結構解析經(jīng)驗。在Elife、Nature Communication、Angewandte、Nucleic Acids Research等雜志發(fā)表多篇文章。在北京大學深圳研究生院、北京生命科學研究所和北京大學化學與分子工程學院均進行過研究工作。在北京大學化學與分子工程學院博士后工作期間，解析了重要疾病靶點和小分子的結構，積累了豐富經(jīng)驗。

（第二天）12月29日，  上午9:00-12:00;   下午14:00-15:30

《數(shù)據(jù)驅(qū)動的功能蛋白挖掘與工程化》1.3h 9：00-10：10 1.數(shù)據(jù)驅(qū)動的合成生物學技術。 2.基因編輯工具的介紹。 3.工具酶的挖掘與改造。 4.蛋白材料的設計與改造。 姚老師，浙江大學杭州國際科創(chuàng)中心“百人計劃”研究員，合成生物學研究所副所長。聚焦數(shù)據(jù)驅(qū)動的基因編輯技術、蛋白設計與進化技術，基于遺傳多樣性的暗物質(zhì)挖掘與進化技術，并應用于生物醫(yī)藥和化學工程等領域。共主持科研項目13項（包括國家重點研發(fā)計劃課題，國家自然科學基金項目等6項國家級項目），共發(fā)表SCI論文50篇。近5年，以通訊作者在Nature Chemical Biology, Advanced Functional Materials等期刊發(fā)表SCI論文30篇。申請國家發(fā)明專利10件。聯(lián)合國內(nèi)醫(yī)藥上市公司和領軍企業(yè)實現(xiàn)技術產(chǎn)業(yè)化1項。擔任Science合作期刊BioDesign Research編委等學術職務。 《人工智能在酶蛋白設計中的應用》1.7h 10：20-12：00 1.開場 (10分鐘)：概述課程涵蓋的工具及其在蛋白質(zhì)工程中的重要性 2.工具概覽及安裝 (15分鐘) （1）介紹將使用的工具：簡要介紹ESM模型、ProteinMPNN、MutCompute、MLDE、CLADE等 （2）工具的獲取與安裝：如何下載和安裝這些工具、基本的系統(tǒng)要求和配置注意事項 3.使用蛋白質(zhì)語言模型 (20分鐘) （1）ESM模型使用基礎：如何配置和啟動ESM模型、輸入數(shù)據(jù)的格式和準備 （2）實作演示：演示如何用ESM預測蛋白質(zhì)結構 4.基于結構優(yōu)化算法的設計 (20分鐘) （1）ProteinMPNN和MutCompute：基本工作流程和使用場景 （2）實作演示：通過案例展示如何用ProteinMPNN進行蛋白質(zhì)設計、運用MutCompute優(yōu)化酶的活性和穩(wěn)定性 5.監(jiān)督學習算法在酶工程中的應用 (20分鐘) （1）MLDE和CLADE概述：講解核心原理、應用范圍、基本工作流程 （2）實作演示：演示如何通過MLDE進行酶功能優(yōu)化、CLADE的實際使用案例 6.結尾與問答環(huán)節(jié) (15分鐘) （1）總結工具使用技巧 歸納不同工具的最佳使用場景和優(yōu)劣勢 （2）互動問答 解答學員在工具使用過程中的常見問題。 于老師，男，浙江大學“百人計劃”研究員，博士生導師，浙大杭州國際科創(chuàng)中心合成生物學研究所副所長。本科、碩士畢業(yè)于天津大學，博士畢業(yè)于英國倫敦大學學院。主要研究方向包括蛋白質(zhì)工程、酶分子智能設計等，在PNAS，Angew Chem Int Edit等期刊發(fā)表40余篇論文，授權發(fā)明專利5項，主持及承擔國家自然科學基金項目、國家重點研發(fā)計劃“合成生物學”重點專項、浙江省尖兵領雁項目等。擔任英國皇家化學學會會員，中國生物工程學會合成生物學分會青年工作組委員等，兼任BioDesign Research期刊青年編委，Science Advances, Nature Communications, ACS Catalysis等雜志審稿人。

《基于AI的酶蛋白元件之改造與設計》1.5h 14:00-15:30 1.無監(jiān)督蛋白改造及案例解析； 2.基于小樣本的蛋白改造及案例解析； 3.蛋白從頭設計及案例解析； 廖老師，中國科學院天津工業(yè)生物技術研究所研究員。主要圍繞工業(yè)生物大數(shù)據(jù)智能分析展開研究，開發(fā)核心的數(shù)據(jù)庫、算法和工具。構建糖基轉移酶數(shù)據(jù)庫pUGTdb、大腸桿菌代謝調(diào)控圖譜ERMer等系列數(shù)據(jù)庫；發(fā)展新一代蛋白功能預測算法HDMLF、酶挖掘與評估工具REME等系列AI算法。近年來在Nucleic Acids Research、Science Advances、Molecular Plant、Research等國內(nèi)外高水平期刊發(fā)表文章50余篇，引用2000余次。主持基金委交叉重點專項、中國科學院戰(zhàn)略性先導專項課題等多項國家級、省部級項目.