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2024年P(guān)EAKS中國第二屆用戶會完美閉幕

瀏覽次數(shù):1963 發(fā)布日期:2024-7-26  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
會議回顧

2024 年 7 月 18 日,Bioinformatics Solutions Inc. 在上海成功舉辦了“PEAKS®中國第二屆用戶會”。此次會議邀請了國內(nèi)資深用戶分享運用 PEAKS®軟件進行各類研究的綜合數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,包括高通量蛋白組、糖蛋白組學、免疫肽組學和臨床研究等。

PEAKS®系列軟件作為業(yè)界知名的一站式蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析平臺,一直引領(lǐng)質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展前沿,不斷優(yōu)化算法、迭代產(chǎn)品,以滿足相關(guān)研究領(lǐng)域工作者的各類分析需求。PEAKS®將深度學習算法全面應用在各數(shù)據(jù)分析流程中,包括PEAKS®特有的DeepNovo和免疫肽組工作流;整合譜圖庫搜索,直接序列數(shù)據(jù)庫搜索和從頭測序的DIA數(shù)據(jù)分析工作流;同時深度學習也賦能DDA數(shù)據(jù)的分析。不斷優(yōu)化的算法,使靈敏度和準確度都有進一步的提高,特別DIA數(shù)據(jù),在PEAKS®12 中更是提升約20%以上。

7 月 19 日,BSI 聯(lián)合上海醫(yī)學院公共技術(shù)平臺舉辦了“PEAKS®第七屆蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析及應用培訓班”。培訓班展示了 PEAKS®12 的最新功能及應用方向,為相關(guān)科研人員提供了交流學習的平臺,促進了質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學、生物制藥等領(lǐng)域的研究與發(fā)展,受到了廣大參與者的熱烈歡迎和積極評價。
 
 
 
 

本次用戶會首先由 Bioinformatics Solutions Inc. 的 CEO 單寶珍博士致開幕詞。單博士在開幕詞中介紹并感謝了特邀嘉賓的到來,感謝所有用戶對我們PEAKS軟件產(chǎn)品的支持,同時為大家介紹了BSI公司的背景和發(fā)展歷程,我們聚焦在提供質(zhì)譜技術(shù)與數(shù)據(jù)方案,通過發(fā)現(xiàn)和靶向蛋白質(zhì)組學的研究,幫助用戶揭示蛋白質(zhì)的奧秘。BSI團隊從數(shù)據(jù)層到知識庫,落地在抗體和免疫多肽等免疫治療的應用領(lǐng)域。

01
復旦大學生物醫(yī)學研究院的張瑩研究員分享了通過一種全新的OPA-S-S-alkyne化學探針,有效且選擇性地靶向標記活細胞表面的賴氨酸,結(jié)合后續(xù)的點擊化學和生物素標簽富集,用于發(fā)現(xiàn)和識別出許多新的細胞表面高反應性氨基酸的整體方法,這對于理解細胞表面蛋白質(zhì)的功能和藥物開發(fā)具有重要意義。4月8日,陸豪杰/張瑩團隊聯(lián)合在線發(fā)表的相關(guān)研究成果中,質(zhì)譜數(shù)據(jù)的定性定量即使用PEAKS® Online完成。

02
復旦大學化學系/生物醫(yī)學研究院喬亮研究員分享了基于深度學習和數(shù)據(jù)非依賴采集的糖蛋白質(zhì)組學分析新方法,主要介紹了針對完整糖肽的DDA和DIA數(shù)據(jù)分別進行譜圖解析的思路,并對比了不同質(zhì)譜儀、不同的糖譜解析軟件的對糖基化修飾鑒定的表現(xiàn)。其中,PEAKS® GlycanFinder對DDA糖肽、糖基化位點的鑒定深度均超過其他軟件。

03
復旦大學生物醫(yī)學研究院的申華莉研究員分享了標志物發(fā)現(xiàn)和疾病診斷新方法的研究進展,從蛋白質(zhì)組學方法和臨床診斷要求間的差距出發(fā),在不同的人群隊列中結(jié)合發(fā)現(xiàn)和靶向質(zhì)譜方法,篩選蛋白標志物,以期建立基于蛋白質(zhì)組學的多癌診斷新策略。

04
 
福建醫(yī)科大學孟超肝膽醫(yī)院副研究員邢曉華博士分享了基于蛋白質(zhì)組學的肝癌精準診療方案,介紹了基于自有平臺搭建的肝癌蛋白質(zhì)組及翻譯后修飾組學完善技術(shù)體系,建立腫瘤早期診斷新技術(shù)、新方法與精準醫(yī)學方面的基礎與臨床轉(zhuǎn)化研究的最新進展。

05
復旦大學生命科學學院張旭敏研究員分享了超高通量蛋白質(zhì)組學研究新方案和數(shù)據(jù)分析的挑戰(zhàn),其團隊開發(fā)的102-plex標記定量方法突破了傳統(tǒng)兩步標記法的限制,解決了定量干擾問題,使得等重同位素標記定量方法邁入了新高度。
 

06
Bioinformatics Solutions Inc. CEO單寶珍博士
從PEAKS AB單抗從頭測序到PolySeq.AI的多抗從頭測序方法切入,分享基于質(zhì)譜的抗體發(fā)現(xiàn)方法;赑EAKS® AB的單抗從頭測序技術(shù),通過多酶解的Bottom up數(shù)據(jù)和Intact 完整分子量的相互驗證,自動化組裝抗體蛋白的序列,而在多抗從頭測序方法介紹中,多抗樣品的復雜度急劇增加,如何通過多維度液相結(jié)合多維度質(zhì)譜方法通過AI數(shù)據(jù)處理實現(xiàn)天然抗體的發(fā)現(xiàn)工作是PolySeq.AI技術(shù)平臺的核心。

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作為生物信息學的領(lǐng)軍企業(yè),BSI專注于蛋白質(zhì)組學和生物藥領(lǐng)域,通過機器學習和先進算法提供世界領(lǐng)先的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件和蛋白質(zhì)組學服務解決方案,以推進生物學研究和藥物發(fā)現(xiàn)。我們通過基于AI的計算方案,為您提供對蛋白質(zhì)組學、基因組學和醫(yī)學的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數(shù)千家學術(shù)和工業(yè)用戶,包括:PEAKS®️ Studio,PEAKS®️ Online,PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB,DeepImmu®️免疫肽組發(fā)現(xiàn)服務和PEAKS®️ AB抗體綜合表征服務等。
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