在Bioinformatics Solutions Inc. (BSI)，我們秉承的使命是通過深度學(xué)習(xí)軟件解決方案和世界領(lǐng)先的質(zhì)譜技術(shù)服務(wù)來推進(jìn)蛋白質(zhì)組學(xué)和糖蛋白組學(xué)的研究。在今年的ASMS上，我們很高興為大家介紹最新版本的PEAKS^®️ Studio和PEAKS^®️ Online，并介紹我們實(shí)驗(yàn)服務(wù)的新項(xiàng)目，如DeepImmu^®️免疫肽組學(xué)發(fā)現(xiàn)服務(wù)和PEAKS^®️ AB多克隆抗體測(cè)序服務(wù)等。您可以通過郵件（peaks@bioinfor.com）與PEAKS團(tuán)隊(duì)成員預(yù)約會(huì)議，或直接到#302展位交流。

PEAKS 用戶會(huì)
時(shí)間: 6月2日，星期日，12:00 pm – 4:30 pm PDT
地點(diǎn)：Sheraton Park Hotel at the Anaheim Resort, 1855 S Harbor Blvd, Anaheim, CA 92802, United States
PEAKS用戶會(huì)注冊(cè)鏈接：https://www.bioinfor.com/peaks-users-meeting-2024/

BSI很榮幸地邀請(qǐng)到了Andy Qi Ph.D. (NIH)，Darshit Shah MSc.（美國(guó)再生元制藥公司)，Richard Kay Ph.D. (劍橋大學(xué))和John Muchena Ph.D. (雅培公司)來分享他們?nèi)绾问褂肞EAKS^®️軟件完成實(shí)驗(yàn)研究。在用戶會(huì)期間，PEAKS團(tuán)隊(duì)還將展示PEAKS^®️ 12的最新功能以及我們的實(shí)驗(yàn)室提供的最新服務(wù)項(xiàng)目。演講結(jié)束后，PEAKS將在露臺(tái)舉辦交流活動(dòng)，為大家提供精美食物和飲料！

PEAKS 展會(huì)信息

• 展位號(hào)： #302

• 時(shí)間：
  June 2: 7:45 pm – 9:00 pm
  June 3–5: 9:00 am – 5:00 pm
  June 6: 9:00 am – 2:30 pm

• 展會(huì)地點(diǎn)：Anaheim Convention Center, 800 W Katella Ave, Anaheim, CA 92802, United States

軟件亮點(diǎn)
在今年ASMS上，大家將了解到我們?nèi)绾卧?/span>PEAKS^®️ Studio和PEAKS^®️ Online中推進(jìn)深度學(xué)習(xí)的應(yīng)用。在PEAKS^®️ 12中，我們整合了人工智能算法來提升多肽從頭測(cè)序，PEAKS DB, PEAKS DIA和用于免疫肽組學(xué)的DeepNovo ^®️ Peptidome。

1. 在新版本的PEAKS^®️軟件中，用戶將體驗(yàn)到最準(zhǔn)確和最快的多肽從頭測(cè)序。多年來，PEAKS一直被業(yè)內(nèi)看作是自動(dòng)多肽從頭測(cè)序的黃金標(biāo)準(zhǔn)，隨著GPU加持的“DeepNovo”推出，PEAKS中的從頭測(cè)序也達(dá)到了有史以來的最高水平。
2. 深度學(xué)習(xí)已應(yīng)用于我們的DIA分析工作流，包括譜圖庫搜索、直接數(shù)據(jù)庫搜索和從頭測(cè)序。在新版本中，用戶可以體驗(yàn)到更快的DIA數(shù)據(jù)分析，更高的靈敏度和準(zhǔn)確性，以及更好的短梯度數(shù)據(jù)支持。
3. DeepNovo^®️ Peptidome workflow支持DDA和DIA數(shù)據(jù)的免疫肽組分析。新版中，我們整合了最先進(jìn)的DeepNovo算法，實(shí)現(xiàn)了更快的速度，提供更全面的肽段信息，包括翻譯后修飾、序列變異和新生肽段。
4. PEAKS DB search提供了一種獨(dú)特的de novo輔助的數(shù)據(jù)庫搜索方法，以提高靈敏度和準(zhǔn)確性。用戶可以選擇通過深度學(xué)習(xí)提升MS2評(píng)分，并將鑒定數(shù)量提高約10%。

我們的免疫肽組學(xué)服務(wù)包括細(xì)胞裂解、組織和血漿樣品處理、MHC多肽純化、LC-MS/MS數(shù)據(jù)采集、多肽鑒定、序列MOTIF分析、結(jié)合親和力和免疫原性預(yù)測(cè)。此外，還包括質(zhì)控測(cè)試，以確保結(jié)果的準(zhǔn)確性。我們先進(jìn)的軟件算法和PEAKS DeepNovo Peptidome工作流程為免疫肽的定性和定量提供準(zhǔn)確、靈敏和可重復(fù)的結(jié)果。

TP 566 
Title：An AI-driven, proteogenomics-based and complete workflow for novel neoantigen discovery
Authors: Qing Zhang [1], Kyle Hoffman [1], Sahar Rabinoviz [1], Peng Chao [2], Haibo Bian [1], Wenting Li [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China

ThP 058 
Title：A Bayesian model for estimating the posterior error probability and the false discovery rate of de novo peptide sequencing
Authors: Hieu Tran [1], Rui Qiao [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON

WP 047 
Title：Revolutionizing Proteomics: Ultra-Fast, High-Accuracy Peptide Sequencing with Enhanced GraphNovo Algorithm
Authors: Zeping Mao [1], Lei Xin[1], Shengying Pan [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON

WP 704 
Title：Combining Top-Down and Bottom-Up Mass Spectrometry Paves the Way for High Throughput Polyclonal Antibody Sequencing
Authors: Lei Xin [1], Peng Chao [2], Jun Ma [2], Peng Chao [1], Shuyang Zhang [1], Zihao Wang [1], Wenting Li [1], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China

MP 451 
Title：Confident identification of proteome-wide low-level mutations using PEAKS 11.5
Authors: Kyle Hoffman [1], Julie Genereaux [2], Lei Xin [1], Zia Rahman [1], Christopher J Brandl [2], Patrick O’Donoghue [2], Baozhen Shan [1]

[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Wester University, London, ON
 

-掃碼關(guān)注-
www.bioinfor.com (EN)
www.deepproteomics.cn（CN）

作為生物信息學(xué)的領(lǐng)軍企業(yè)，BSI專注于蛋白質(zhì)組學(xué)和生物藥領(lǐng)域，通過機(jī)器學(xué)習(xí)和先進(jìn)算法提供世界領(lǐng)先的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件和蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)解決方案，以推進(jìn)生物學(xué)研究和藥物發(fā)現(xiàn)。我們通過基于AI的計(jì)算方案，為您提供對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)、基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)的卓越洞見。旗下著名的PEAKS^®️系列軟件在全世界擁有數(shù)千家學(xué)術(shù)和工業(yè)用戶，包括：PEAKS^®️ Studio，PEAKS^®️ Online，PEAKS^®️ GlycanFinder, PEAKS^®️ AB及抗體綜合表征服務(wù)等。

聯(lián)系方式：021-60919891；sales-china@bioinfor.com