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CosMx™ Human 6K Discovery Panel
單細胞+空間原位+6K基因

在單細胞空間原位對6000個基因的檢測分析，實現(xiàn)單細胞研究的空間組學躍遷，以深入的洞察力開啟前所未有的空間生物學之旅。

技術特點

您是否正在致力于開發(fā)繪制單細胞圖譜？您是否著眼于鑒定細胞狀態(tài)并探索其功能？您是否關注于細胞配體-受體相互作用以研究細胞通訊？您是否致力于解析組織微環(huán)境表型或進行生物標記物發(fā)現(xiàn)？如果是這樣，CosMx™ Human 6K Discovery Panel能讓您在單細胞水平上對幾乎整個生物學通路進行空間分析，所涵蓋的基因靶標經過了充分驗證，并具有簡單的樣本制備流程、直觀易用的儀器操作和可靠穩(wěn)定的系統(tǒng)運行等特點優(yōu)勢，全方位加速您的單細胞空間生物學研究。超多靶標的單細胞空間原位表達信息不僅可以實現(xiàn)精細的細胞分型，繪制單細胞空間圖譜，對于細胞配受體檢測、細胞通訊、細胞狀態(tài)、細胞微環(huán)境表型分析和生物標志物發(fā)現(xiàn)也提供了強大的挖掘潛能。

全面的通路覆蓋和穩(wěn)定可靠的數(shù)據質量

● 超多檢測靶標：在單張載玻片上分析超過6000種RNA靶標，包含超過400對配體-受體，全面剖析幾乎所有生物學通路；

● 超高分辨率：真正意義的單細胞分辨率，甚至亞細胞分辨率；

● 行業(yè)領先的細胞分割算法：實現(xiàn)精確的單細胞邊界識別和界定，保證后續(xù)單細胞原位轉錄組分析的可信度；

● 支持靈活定制方案：可定制添加多達200個額外的RNA靶標；

● 高度可信的數(shù)據質量：設置多重陰性對照，增強您對數(shù)據質量的信心；

利用易用的交互式AtoMx™空間信息平臺 (SIP)開展數(shù)據分析和結果可視化。

應用領域

01 繪制單細胞空間圖譜

使用Allen Human M1 Atlas數(shù)據進行半監(jiān)督細胞分型

02 揭示配體與受體的相互作用

發(fā)現(xiàn)不同類型細胞配體-受體的空間共定位、共表達

在肝癌FFPE樣本中發(fā)現(xiàn)不同類型細胞中配受體的空間共表達模式

03 發(fā)現(xiàn)稀有細胞，實現(xiàn)更精細的細胞分型

配體共定位識別人腦中的罕見細胞類型：Sst Chodl神經元

根據配體相關性矩陣構建的圖譜網絡，識別出具有長程投射的罕見皮層中間神經元。

對配體鄰域表達譜的相關矩陣進行無監(jiān)督聚類，以識別共定位配體群。其中一個配體集群由SST、NPY和CORT這3種配體組成，它們的鄰域表達譜顯示出很強的相關性。這3種配體的共同表達確定了一種罕見的細胞類型：Sst Chodl神經元。

04 發(fā)現(xiàn)新的生物標志物 — Plex Matters!

使用CosMx™ 6K Discovery Panel 可以對差異表達進行更全面的分析，并極大程度提高發(fā)現(xiàn)生物標記物的潛力

如兩幅火山圖所示，與CosMx™ Human Universal Cell Characterization RNA Panel相比，CosMx™ Human 6K Discovery Panel能識別出更多具有統(tǒng)計學意義和生物學意義的腎癌相關基因。

單細胞空間原位6K公共數(shù)據集
CosMx Human Frontal Cortex FFPE Dataset

整個組織切片的空間細胞圖譜和細胞類型UMAP聚類

CosMx 6K數(shù)據集概覽

基于CosMx™ SMI單細胞空間原位分子成像系統(tǒng)，CosMx Human Frontal Cortex FFPE Dataset數(shù)據集對人類額葉皮層FFPE樣本中的6078個基因進行了單細胞分辨率的空間定位和原位表達分析*。該套數(shù)據集展示了CosMx™ SMI在單細胞空間領域領先的數(shù)據表現(xiàn)和性能。超過6000個基因檢測方案，能支持研究人員在單細胞分辨率的空間生物學研究中實現(xiàn)最全面的基因組覆蓋度，獲取全面深入的信息。

CosMx™ SMI 單細胞空間原位成像系統(tǒng)

CosMx™ SMI是一個突破性的單細胞空間原位成像平臺，結合了超高分辨率成像技術和多靶標檢測能力，能夠對組織切片中6000種RNA和64種蛋白質分子進行單細胞和亞細胞分辨率的原位成像，支持研究人員實現(xiàn)精準透徹的生物學解析。

眾所周知，F(xiàn)FPE樣本中的RNA和蛋白質通常質量較低，尤其是RNA往往降解嚴重，使得對于FFPE樣本的分子檢測分析極具挑戰(zhàn)性。CosMx™ SMI系統(tǒng)具有簡單的樣本制備流程和穩(wěn)定的原位雜交化學原理，并能夠兼容多種組織類型（如新鮮冷凍（FF）、福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）、組織芯片（TMA）、類器官等），在單細胞分辨率上實現(xiàn)RNA和蛋白質在組織細胞原位精細的可視化展示和精準的定量分析。

超多靶標的單細胞空間原位表達信息不僅可以實現(xiàn)精細的細胞分型，繪制單細胞空間圖譜，詳細展示細胞鄰域和組織微環(huán)境，同時還支持細胞配受體檢測，在真實的組織空間背景下推進您對細胞間相互作用、細胞通訊和細胞狀態(tài)的深刻洞察。

CosMx™ SMI應用包括：

● 單細胞空間圖譜：發(fā)現(xiàn)不同細胞類型，繪制其組織空間定位；

● 差異表達分析：基于空間背景的單細胞轉錄組差異表達分析；

● 解析細胞狀態(tài)和細胞功能；

● 細胞鄰域分析：組織微環(huán)境的空間表型；

● 細胞通訊：配體-受體相互作用；

● 轉錄本和蛋白的亞細胞定位；

● 生物標志物的發(fā)現(xiàn)和驗證。

SBC先后搭建GeoMx® DSP和CosMx™ SMI兩大空間組學研究平臺，并與NanoString攜手共建DSP空間組學“卓越中心”，搭配10x Visium Cytassist以及LCM+timsTOF Pro 4D非靶向深度空間蛋白組平臺，打造空間生物學全鏈條創(chuàng)新多組學平臺及解決方案，助力科學發(fā)現(xiàn)。