單細胞 RNA 測序能夠以單細胞為單位進行轉(zhuǎn)錄組學分析，這項研究可以讓我們進一步了解一些稀有且貴重的細胞群。盡管單細胞RNA測序技術(shù)的使用越來越廣泛，但這項技術(shù)的成本仍然相當昂貴。除了測序平臺和每次單獨運行的成本外，文庫制備步驟既昂貴又費力。然而，把文庫制備步驟進行自動化可以有效減少實驗結(jié)果的變異性，同時節(jié)約研究人員的寶貴時間，解放他們的雙手，讓科研人員能有更多時間用來來設計實驗或分析數(shù)據(jù)。
目前，市面上能實現(xiàn)單細胞RNA測序的自動化文庫制備成本高達 260,000 美元，昂貴的成本已經(jīng)超出了市面上大部分小型研究實驗室的預算。  
為了向更多實驗室提供這項自動化技術(shù)，Retro Biosciences 成功“破解”了 Opentrons 的 OT-2 自動化移液平臺，使其能夠?qū)崿F(xiàn)自動化文庫制備功能，同時成本僅為 26,000 美元！節(jié)約了10倍的啟動成本。
今天本期我們將為大家?guī)�來我們的客戶合作案例：Retro Biosciences 在OT-2上進行單細胞RNA測序自動化文庫制備。  
專訪客戶介紹
Retro Biosciences 是一家位于加州的生物醫(yī)藥公司，專注于血漿療法、細胞重編程和細胞自噬研究。 問：請簡單介紹一下Retro Biosciences 公司？
答：Retro Biosciences 的成立最初是一家臨床治療藥物研發(fā)公司，后來主要業(yè)務是開發(fā)預防性藥物來解決細胞衰老問題。
大多數(shù)研究衰老的生物學公司都專注于單一的衰老機制，而 Retro Biosciences 是一家多項目公司，我們努力探索的三種療法有：細胞重編程、自噬和血漿啟發(fā)療法。
我們了解到醫(yī)院接待的病人中有 80% 以上的疾病負擔源自于衰老機制，因此我們希望找到能直接解決這些問題的療法，幫助更多病人。
 
問：自動化如何幫助您實現(xiàn)目標？
答：機器自動化是不知疲倦的，可以持續(xù)性工作，同時自動化的效率顯著超越人工。
我們正在探索未知的生物學，其中一些探索涉及到的參數(shù)以及參數(shù)組合非常廣泛，如果繼續(xù)讓科研人員使用手動的方式進行實驗，我認為這是對研究者科學頭腦的一種浪費。
 
問：您為自動化單細胞RNA測序的文庫制備創(chuàng)建了一個非常酷且非常實惠的解決方案。請告訴我們您創(chuàng)造這個方案的初衷，以及您是如何做到的？
答：文庫制備對我們來說是一個入門項目。自動化的最大優(yōu)勢是你可以將那些固有的、大量重復的、最不希望出錯的環(huán)節(jié)自動運作起來，節(jié)約時間，減少人工失誤。
我們在這里做了很多單細胞RNA測序。每一次測序我們需要面臨的分析和研究任務都很重，因此我們必須開發(fā)新的軟件功能（例如液位特定移液）和硬件功能（例如改進的磁珠分離系統(tǒng)），它使我們能夠直觀地審查協(xié)議中的所有步驟，以發(fā)現(xiàn)錯誤并驗證質(zhì)量。
 
問：您在 Github 上發(fā)表了這項工作，引發(fā)了不錯的反響， 您為什么決定公開這項工作？
答：對我們來說，在廣泛的生物學研究中降低科研成本對社會的好處，遠遠超過了我們對同行的競爭關(guān)系的狹隘擔憂。我們希望有更多從事同類研究的科研者可以從自動化中獲益。
 
總結(jié)：
Retro Biosciences 通過展示Opentrons開源自動化移液系統(tǒng)創(chuàng)造了屬于自己的單細胞測序文庫制備自動化流程，幫助了更多研究單細胞測序的實驗室能夠啟動自動化，提升他們的研究效率。
我們的開源自動化程序可以通過編程來完成研究人員需要的任何事情，同時把成本控制在較低的范圍內(nèi)。我們被 Retro Biosciences 引領(lǐng)的創(chuàng)新所震撼，期待他們未來的持續(xù)創(chuàng)新。