浙江大學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)專題研習(xí)班(第7期)招生簡(jiǎn)章
各高校及相關(guān)科研單位:
蛋白質(zhì)組學(xué)研究是生命科學(xué)的新興前沿領(lǐng)域,是生命科學(xué)進(jìn)入后基因組時(shí)代的標(biāo)志之一。近年來,隨著蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)與質(zhì)譜分析技術(shù)的快速發(fā)展,誕生了一系列與蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫資源及生物信息學(xué)分析工具,在研究蛋白質(zhì)的鑒定、結(jié)構(gòu)分析與模擬、蛋白與核酸相互作用、與蛋白-蛋白相互作用、分子對(duì)接,乃至分子相互作用網(wǎng)絡(luò)等各個(gè)層面為科學(xué)研究提供助力。
為進(jìn)一步幫助廣大科研工作者快速掌握提升蛋白質(zhì)組學(xué)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能,浙江大學(xué)歷經(jīng)20年的“基因組科學(xué)研習(xí)班”品牌項(xiàng)目原班人馬聯(lián)合浙江大學(xué)多位長期從事蛋白質(zhì)組學(xué)研究的老師及景杰生物資深生信專家傾情推出“
蛋白質(zhì)組學(xué)專題研習(xí)班”,通過理論授課與上機(jī)實(shí)踐相結(jié)合的方式,每人一臺(tái)PC機(jī),緊隨大屏幕演示“跟我學(xué)”操作。
培訓(xùn)內(nèi)容:蛋白質(zhì)組學(xué)背景介紹、質(zhì)譜分析基礎(chǔ)、蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)與思路、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)處理、MaxQuant蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)處理(上機(jī)實(shí)踐)、蛋白組組學(xué)生物信息學(xué)分析、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析及可視化(上機(jī)實(shí)踐)、蛋白質(zhì)組學(xué)功能數(shù)據(jù)的挖掘(上機(jī)實(shí)踐)、蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例說明等。
培訓(xùn)時(shí)間:2023年12月18-22日(18日為報(bào)到日,19日起上課)。
培訓(xùn)對(duì)象:從事生命科學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域科研工作者和高校教師及研究生。
培訓(xùn)地點(diǎn):杭州 浙江大學(xué)
注冊(cè)方式:
(1)培訓(xùn)費(fèi):4200元/人(包含注冊(cè)費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)實(shí)踐費(fèi))。
培訓(xùn)期間食宿自理,會(huì)務(wù)組可幫助預(yù)定。
(2)繳費(fèi)方式(指定賬號(hào))
賬戶名稱:浙江大學(xué)
賬戶號(hào)(開戶行):19042201040000014(農(nóng)行杭州市浙大支行紫金港分理處)
匯款用途處寫明:姓名+上機(jī)號(hào)(由會(huì)務(wù)組在回執(zhí)確認(rèn)函中提供)
(3)會(huì)務(wù)組聯(lián)系方式:
余老師 19116332108 沈老師 13958194424
會(huì)務(wù)組郵箱:
genetrain@sina.com、
genetrain@zju.edu.cn
填寫報(bào)名表并于報(bào)到前發(fā)送至?xí)⻊?wù)組郵箱,上機(jī)實(shí)踐主辦方配備電腦。如有其它要求,請(qǐng)?jiān)趥渥⒅姓f明。
(4)非匯款學(xué)員可現(xiàn)場(chǎng)刷卡(含公務(wù)卡)或現(xiàn)金交納
(5)研習(xí)班期間食宿費(fèi)用自理,會(huì)務(wù)組可以代為預(yù)定住宿,您也可自行安排住宿。
a,漢庭酒店(浙大紫金港店),浙江省杭州市西湖區(qū)紫荊花北路188號(hào)(近浙江大學(xué)紫金港校區(qū))。標(biāo)準(zhǔn)間房價(jià):260元/間/天(含早);
b,紫金港國際飯店,浙江省杭州市西湖區(qū)申花路796號(hào)(近浙江大學(xué)紫金港校區(qū))。標(biāo)準(zhǔn)間房價(jià):398元/間/天(含早);
證書發(fā)放:
浙江大學(xué)第7期蛋白質(zhì)組學(xué)專題研習(xí)班課程安排
日 期 |
時(shí) 間 |
內(nèi) 容 安 排 |
12月18日(2023年) |
全 天 |
杭州 浙江大學(xué)紫金港校區(qū)報(bào)到(詳見報(bào)到通知) |
19日
(周二) |
08:30~11:30 |
蛋白質(zhì)組學(xué)背景介紹
系統(tǒng)生物學(xué)與蛋白組學(xué)發(fā)展史
蛋白組的復(fù)雜性與動(dòng)態(tài)變化特征
蛋白組學(xué)研究展望 |
14:00~17:00 |
質(zhì)譜分析基礎(chǔ)
質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展與常見質(zhì)譜類型簡(jiǎn)介
質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集與譜圖解析
多肽的質(zhì)譜定性定量分析 |
20日
(周三) |
08:30~11:30 |
蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)與思路
常見比較蛋白組學(xué)流程與設(shè)計(jì)思路
常見樣本處理流程
特殊樣本的處理流程
標(biāo)記與非標(biāo)記策略
多肽的分級(jí)與分離
其他樣本前處理策略 |
14:00~17:00 |
MaxQuant蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)處理(上機(jī)實(shí)踐)
MaxQuant軟件及數(shù)據(jù)處理流程介紹
LFQ、iBAQ、譜圖計(jì)數(shù)法非標(biāo)定量
SILAC標(biāo)記定量
TMT標(biāo)記定量
結(jié)果查看與導(dǎo)出
Persues統(tǒng)計(jì)處理與可視化 |
21日
(周四) |
08:30~11:30 |
蛋白質(zhì)組學(xué)功能數(shù)據(jù)的挖掘(上機(jī)實(shí)踐)
R語言基礎(chǔ)
GO與KEGG通路分析
基于String數(shù)據(jù)庫的蛋白互作分析
基于Cytoscape的互相作用可視化 |
14:00~17:00 |
蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析及可視化(上機(jī)實(shí)踐)
GSEA功能富集分析
磷酸化激酶預(yù)測(cè)分析
泛素化E3連接酶預(yù)測(cè)分析
藥物靶預(yù)測(cè)分析
蛋白三維結(jié)構(gòu)與口袋預(yù)測(cè) |
22日
(周五) |
08:30~11:30 |
蛋白組組學(xué)生物信息學(xué)分析
蛋白質(zhì)功能注釋
蛋白質(zhì)組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)分析
蛋白質(zhì)組學(xué)臨床應(yīng)用
蛋白修飾組學(xué)分析
多組學(xué)聯(lián)合分析 |
14:00~17:00 |
蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例說明
從科學(xué)問題到研究閉環(huán)
臨床大樣本與分子分型-以大隊(duì)列研究為例
翻譯后修飾與腫瘤代謝-以新型;揎棡槔
蛋白質(zhì)組未來應(yīng)用展望 |
本課表僅供參考,課程順序以報(bào)到當(dāng)天發(fā)放課表為準(zhǔn)。
培訓(xùn)班主要師資簡(jiǎn)介
鐘伯雄 教授 博士生導(dǎo)師
浙江大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院教授,開展了家蠶絲腺蛋白質(zhì)組、以及與野蠶后部絲腺的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)蠶繭優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)主要是核糖體蛋白代謝通路提高;(2)開展了蛋白翻譯后修飾研究,明確了與蠶繭優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)相關(guān)的蛋白質(zhì)磷酸化特征;(3)建立了高效轉(zhuǎn)基因方法,采用TALEN技術(shù)在家蠶胚胎時(shí)期成功獲得基因定點(diǎn)插入研究結(jié)果、采用CRISPR-Cas9技術(shù)成功突變家蠶重要功能基因,獲得穩(wěn)定遺傳突變品種(4)開展了micRNA研究工作,揭示了家蠶絲腺micRNA表達(dá)特征。(5)開展了家蠶生物反應(yīng)器研究,獲得了機(jī)械性能優(yōu)良的家蠶蜘蛛復(fù)合絲新材料。在JPR、BMC Genomics、IBMB、遺傳學(xué)報(bào)、蠶業(yè)科學(xué)等國內(nèi)外雜志發(fā)表相關(guān)論文160多篇。
郭 成 副研究員 碩士生導(dǎo)師。
以第一作者/通訊作者在Analytical Chemistry, Analytica Chimica Acta等期刊上發(fā)表SCI論文28篇,以合作作者身份在Nature,JACS等期刊上發(fā)表SCI論文多篇。ACS等出版社十余種SCI期刊審稿人。承擔(dān)國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、青年基金、浙江省自然科學(xué)基金等科研項(xiàng)目多項(xiàng),作為科研骨干參與國家自然科學(xué)基金杰出青年基金、重點(diǎn)項(xiàng)目等。
趙祖相嵐 博士
哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)碩士,博士畢業(yè)于澳門大學(xué)生物醫(yī)學(xué)專業(yè),研究方向?yàn)槿橄侔﹩渭?xì)胞測(cè)序分析,蛋白因子調(diào)控與激素作用機(jī)制。具有多年組學(xué)分析經(jīng)驗(yàn),擅長課題方案設(shè)計(jì)、生物信息學(xué)分析思路規(guī)劃。目前主要從事臨床腫瘤大樣本蛋白基因組、翻譯后修飾調(diào)控、多種修飾crosstalk等方向的研究。在多組學(xué)聯(lián)合分析、蛋白基因組建庫、生信算法整合、分析流程搭建、數(shù)據(jù)挖掘與機(jī)制探索等方面具有豐富的理論基礎(chǔ)與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。數(shù)據(jù)分析與方法學(xué)論文主要發(fā)表在Cell reports, EMBO reports, BMC bioinformatics, Nuclear Acid Research, Oncogene等雜志。
孫強(qiáng)強(qiáng) 博士
博士畢業(yè)于武漢大學(xué),博士期間從事感染免疫、抗感染治療機(jī)制研究。在蛋白組學(xué)、空間組學(xué)、多組學(xué)及蛋白質(zhì)翻譯后修飾等領(lǐng)域有豐富的研究及項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。闡明了迄今為止發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)同時(shí)調(diào)節(jié)病原體乳酸代謝及免疫逃逸的轉(zhuǎn)錄因子,并解釋了代謝途徑調(diào)節(jié)模式如何根據(jù)不同宿主生態(tài)位演變,對(duì)預(yù)防和治療感染提供了重要的理論和醫(yī)療意義,并為新型藥物開發(fā)提供了潛在的靶點(diǎn)。目前,學(xué)術(shù)論文在Nature Communications, eLife, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Molecular Microbiology等發(fā)表。
張佳輝 高級(jí)工程師
福建醫(yī)科大學(xué)獲得生物信息學(xué)碩士學(xué)位。主要課題利用基因表達(dá)相對(duì)穩(wěn)定的秩序關(guān)系尋找消化道腫瘤早期診斷、預(yù)后相關(guān)的biomarker。累計(jì)參與大型分析項(xiàng)目30余個(gè),學(xué)術(shù)論文共同作者15余篇。從事多組學(xué)相關(guān)的生信工作近5年,具有大量多組學(xué)數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),涉及多癌型、單一癌型不同亞型、多器官、不同生理發(fā)育階段等。對(duì)數(shù)據(jù)挖掘及作圖可視化有豐富實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn),合作文章產(chǎn)出累計(jì)影響因子達(dá)80+。
趙二杰 高級(jí)工程師
畢業(yè)于哈爾濱醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)七年制,主攻生物信息學(xué)方向,擅長大樣本多組學(xué)數(shù)據(jù)分析和R語言開發(fā)。主導(dǎo)生信算法模塊的研發(fā)與落地,完成搭建多個(gè)新型修飾類算法模塊與分析流程,涉及分析內(nèi)容包含機(jī)器學(xué)習(xí)識(shí)別臨床生物標(biāo)志物、蛋白基因組整合分子分型分析、新型修飾數(shù)據(jù)挖掘、調(diào)控酶關(guān)聯(lián)分析等方向。具有豐富的臨床多組學(xué)大隊(duì)列項(xiàng)目分析經(jīng)驗(yàn)與修飾組學(xué)研發(fā)經(jīng)歷,申報(bào)修飾類分析專利多項(xiàng)。
金鑫 高級(jí)工程師
碩士畢業(yè)于東北林業(yè)大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)專業(yè),從事植物蛋白質(zhì)組學(xué)方向研究,主要內(nèi)容為植物逆境脅迫的蛋白質(zhì)組學(xué)與生理學(xué)分析,揭示植物抗逆的分子機(jī)制。主要從事樣品制備相關(guān)工作,負(fù)責(zé)樣品制備流程的搭建,制備方法的開發(fā)與優(yōu)化,樣品制備自動(dòng)化體系的建立等內(nèi)容。對(duì)各類樣本的制備路線及技術(shù)流程具有非常豐富的經(jīng)驗(yàn),曾對(duì)多種不同類型樣本進(jìn)行方法開發(fā)和流程優(yōu)化等工作。
參考附件:報(bào)名回執(zhí)表