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代謝組學(xué)及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究技術(shù)與實踐培訓(xùn)班通知

瀏覽次數(shù):1184 發(fā)布日期:2023-7-5  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

代謝組學(xué)是近年發(fā)展快速的一門學(xué)科,目前在醫(yī)學(xué)、植物學(xué)、微生物學(xué)、毒理學(xué)、藥物研發(fā)等多個領(lǐng)域中得到了廣泛的應(yīng)用。如何從復(fù)雜的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)中提取出有價值的信息,篩選出潛在的生物標(biāo)志物成為近年來代謝組學(xué)研究的熱點和難點。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能夠通過計算機(jī)模擬算法、運(yùn)用組學(xué)、高通量篩選及網(wǎng)絡(luò)分析等技術(shù)揭露藥物-靶點-疾病之間復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)信號關(guān)系,已經(jīng)成為揭示生物系統(tǒng)復(fù)雜功能和行為的有力工具。
 
課程特點:

實操干貨,實際一線工作者的經(jīng)驗分享,在較短時間全面了解網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與代謝組學(xué)技術(shù)相結(jié)合的概念,熟悉相關(guān)操作流程,明確流程中的關(guān)鍵點和易出錯點,避免觸碰雷區(qū)或走入誤區(qū),提供詳實的方法資料,借助較流行的在線數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件(無需編程),對網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)進(jìn)行系統(tǒng)性學(xué)習(xí)(數(shù)據(jù)獲取,網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,通路分析)及個性化問題解決,同時結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,實現(xiàn)多技術(shù)交叉和多數(shù)據(jù)融合的高級數(shù)據(jù)解析思路和方案。
 
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課程安排:
 
日期 時間 授課題目 授課內(nèi)容
7月8日 9:00-12:00 代謝組學(xué)研究技術(shù)與實踐 1、代謝組學(xué)研究思路和流程,全局了解代謝領(lǐng)域新方向
1.1 代謝組學(xué)概述
1.2 代謝組學(xué)樣本的采集、保存與制備的注意事宜
1.2 代謝組學(xué)的應(yīng)用
2、代謝組學(xué)數(shù)據(jù)采集與預(yù)處理,決定數(shù)據(jù)統(tǒng)計結(jié)果的準(zhǔn)確性
2.1 代謝組學(xué)相關(guān)平臺介紹
2.2 常用軟件和數(shù)據(jù)庫介紹(數(shù)據(jù)采集、數(shù)據(jù)預(yù)處理、代謝物鑒定)
2.3 數(shù)據(jù)預(yù)處理與分析
3、基于SIMCA-P軟件的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)多元統(tǒng)計分析與實操
3.1 樣本分類(PCA、PLS-DA、OPLS-DA)
3.2 差異變量篩選(S-plot、S+V-plot、VIP等)
3.3 常見圖形結(jié)果解讀
12:00-14:00 午間休息
14:00-17:00 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究技術(shù)與實踐 4、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究思路和流程
5、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)分析與實操
5.1 化學(xué)成分的獲取與篩選(Pubchem、TCMSP數(shù)據(jù)庫、TCMID數(shù)據(jù)庫、Swiss ADME數(shù)據(jù)庫等)
5.2 中藥化學(xué)成分靶點獲取(TCMSP數(shù)據(jù)庫、BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫、Similarity Ensemble Approach (SEA)數(shù)據(jù)庫、Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫、HIT2.0、HERB等)
5.3 疾病靶點富集數(shù)據(jù)庫(DisGeNET數(shù)據(jù)庫、GeneCards數(shù)據(jù)庫、OMIM數(shù)據(jù)庫等)
5.4 化合物與疾病靶點映射(韋恩圖)
5.5 PPI網(wǎng)絡(luò)分析(PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、網(wǎng)絡(luò)拓?fù)涮卣鞯挠嬎、網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲笜?biāo)的含義、重要節(jié)點識別)
5.6 富集分析(DAVID數(shù)據(jù)庫、Metascape數(shù)據(jù)庫、KOBAS數(shù)據(jù)庫)
5.7 通路可視化分析工具(氣泡圖、柱狀圖)
5.8 靶點組織定位分析
5.9 網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建—Cytoscape(數(shù)據(jù)導(dǎo)入、節(jié)點關(guān)系的建立、節(jié)點屬性計算、調(diào)整網(wǎng)絡(luò)樣式、篩選及過濾、網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)出)
5.10 分子對接 
7月9日 9:00-12:00 代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合研究技術(shù)與實踐 6、為什么要在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)中結(jié)合中藥代謝組?
7、代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合研究思路
8、代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合分析技術(shù)
8.1 代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲。℉MDB數(shù)據(jù)庫、成分靶點獲取、疾病靶點富集數(shù)據(jù)庫、 代謝專屬數(shù)據(jù)庫)
8.2 代謝組學(xué)功能分析(富集分析、通路分析等)
8.3 代謝小分子網(wǎng)絡(luò)關(guān)聯(lián)分析(Metscape軟件、OmicsNet數(shù)據(jù)庫)
8.4 代謝物-代謝物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析
8.5 代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)功能層次關(guān)聯(lián)分析
12:00-14:00 午間休息
14:00-17:00 文獻(xiàn)解讀及實例解析 9、文獻(xiàn)解讀:代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合的文章分析流程和套路
9.1 中藥化學(xué)成分靶點與代謝小分子網(wǎng)絡(luò)分析實例(Food Res Int.2020,136:109503)
創(chuàng)新點:采用Metscape軟件對代謝組學(xué)發(fā)現(xiàn)的差異代謝物和中藥成分的藥物靶點關(guān)聯(lián),聚焦關(guān)鍵蛋白。
9.2 代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)功能層次關(guān)聯(lián)分析實例(JEthnopharmacol.2021,264:113281. )
創(chuàng)新點:采用功能富集工具分別對網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián),聚焦關(guān)鍵通路。
9.3代謝組學(xué)和網(wǎng)絡(luò)藥理關(guān)聯(lián)分析實例(Comput Struct Biotechnol J.2021,19:1002-1013)
創(chuàng)新點:整合代謝組學(xué)和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),從代謝小分子網(wǎng)絡(luò)和代謝組學(xué)功能分析出發(fā),多維度聚焦關(guān)鍵通路和關(guān)鍵蛋白。
10、實例解析與練習(xí)
11、代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合文章寫作規(guī)范
12、《網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評價方法指南》解讀
13、代謝組學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合項目設(shè)計解析
 
 
主講專家:

本次課程由工作在科研一線的老師(講師)擔(dān)任主講,在國內(nèi)外學(xué)術(shù)期刊發(fā)表研究論文57篇,其中SCI收錄16篇。近幾年主持/參與國家自然科學(xué)基金和省自然科學(xué)基金多項。從事代謝組學(xué)和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù)研究近十年,熟練相關(guān)技術(shù)流程和操作方法,研究方向為中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及中藥代謝組學(xué)。

會議費(fèi)用:
會議費(fèi)3000元/人,同一單位3人以上參會優(yōu)惠至2800元/人。此次課程為線上直播教學(xué)模式,開課前統(tǒng)一提供配套電子版培訓(xùn)資料。參加培訓(xùn)的學(xué)員課后可通過微信群繼續(xù)和授課講師交流,長期獲得指導(dǎo)機(jī)會。
 
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會議咨詢:
章老師 13121195178(微信同號)
E-mail:info@huasitai.com
 
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