報(bào)告時(shí)間:2022年8月24日 周三 13:00-14:00
報(bào)告主題:基于深度學(xué)習(xí)的生物圖像計(jì)算分析技術(shù)與應(yīng)用
嘉賓介紹:楊戈博士
騰訊會(huì)議:421-297-024
楊戈 博士
1991年于清華大學(xué)獲機(jī)械工程與自動(dòng)控制雙學(xué)士學(xué)位,1998年于中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所獲自動(dòng)控制(機(jī)器人學(xué))碩士學(xué)位,2004年于美國(guó)明尼蘇達(dá)大學(xué)獲機(jī)械工程(機(jī)器人學(xué))博士學(xué)位。2004-2008年在美國(guó)加州斯克里普斯研究所完成計(jì)算細(xì)胞生物學(xué)博士后,2009-2018在美國(guó)卡內(nèi)基梅隆大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系和計(jì)算生物學(xué)系任助理教授和副教授。2019年入選中國(guó)科學(xué)院杰出海外人才引進(jìn)計(jì)劃,全職回國(guó)任中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所模式識(shí)別國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員,中國(guó)科學(xué)院大學(xué)人工智能學(xué)院長(zhǎng)聘教授。曾獲美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金青年科學(xué)家(CAREER)獎(jiǎng),國(guó)際生物醫(yī)學(xué)圖像會(huì)議(ISBI)最佳論文獎(jiǎng)等。主要研究方向?yàn)榛谌斯ぶ悄艿纳镝t(yī)學(xué)圖像處理,計(jì)算細(xì)胞生物學(xué)與藥物篩選技術(shù)。目前已在國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊如Nature Cell Biology,Journal of Cell Biology,PNAS, Cell Reports, Bioinformatics和國(guó)際知名學(xué)術(shù)會(huì)議如AAAI, ISBI等發(fā)表論文近90篇。
報(bào)告介紹:現(xiàn)代高性能光學(xué)成像技術(shù)為生命科學(xué)提供了大量高質(zhì)量且信息豐富的圖像數(shù)據(jù),然而在對(duì)于這些圖像的定量分析和信息提取方面目前還存在很多挑戰(zhàn)。深度學(xué)習(xí)是一類采用多層人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)又稱深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的人工智能技術(shù)。近年來(lái),深度學(xué)習(xí)技術(shù)在生物顯微圖像的定量分析和信息提取方面實(shí)現(xiàn)了性能的突破,解決了很多傳統(tǒng)圖像分析技術(shù)長(zhǎng)期無(wú)法解決的問(wèn)題,有力助推了當(dāng)代生命科學(xué)的進(jìn)展。在本次報(bào)告中,我將重點(diǎn)聚焦生物光學(xué)顯微圖像的計(jì)算分析,通過(guò)實(shí)例簡(jiǎn)要介紹相關(guān)的主要技術(shù)及其在回答基礎(chǔ)生命科學(xué)問(wèn)題,提升生物光學(xué)成像性能,以及輔助藥物研發(fā)中的一些代表性應(yīng)用。報(bào)告的最后我將對(duì)于未來(lái)幾年相關(guān)深度學(xué)習(xí)技術(shù)的發(fā)展做出展望。
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锘海學(xué)術(shù)沙龍背景:
借助組織透明化技術(shù)和光片熒光顯微技術(shù)的發(fā)展,研究者對(duì)生物組織內(nèi)部的結(jié)構(gòu)及生理、病理特征的觀察和分析從2D提升到了3D。透明化三維成像技術(shù)利用深部組織可視化和大數(shù)據(jù),引領(lǐng)科學(xué)領(lǐng)域革命性的進(jìn)步。
針對(duì)科學(xué)研究中組織三維成像中的重點(diǎn)和難點(diǎn),锘海自主搭建一站式科研平臺(tái),提供從“組織透明化/染色”→“平鋪光片顯微鏡3D成像”→“數(shù)據(jù)采集分析處理及存儲(chǔ)”整體解決方案。同時(shí),大力推廣組織透明化及平鋪光片顯微鏡三維成像技術(shù)和應(yīng)用。2022锘海學(xué)術(shù)沙龍系列講座,將邀請(qǐng)國(guó)內(nèi)該領(lǐng)域知名專家學(xué)者做特邀學(xué)術(shù)報(bào)告,借此為致力于組織三維成像研究者提供一個(gè)共享科研成果和前沿技術(shù),了解學(xué)術(shù)發(fā)展趨勢(shì),拓寬研究思路的機(jī)會(huì)。
2022學(xué)術(shù)沙龍系列講座由锘海生物科學(xué)儀器(上海)有限公司主辦,锘海專注于高速高分辨率3D熒光顯微成像系統(tǒng)的研發(fā)、生產(chǎn)和服務(wù),廣泛應(yīng)用于腦科學(xué)、腫瘤學(xué)、藥物研發(fā)、干細(xì)胞研究、組織胚胎學(xué)等各個(gè)研究領(lǐng)域。目前已與國(guó)內(nèi)外多家高水平實(shí)驗(yàn)室開展合作研究,并獲得高質(zhì)量的成像數(shù)據(jù)。
锘海LS18平鋪光片顯微鏡
專為透明化樣品設(shè)計(jì)的高速高分辨三維熒光顯微鏡成像系統(tǒng)
針對(duì)透明化樣品的3D熒光成像,采用與西湖大學(xué)高亮(平鋪光片技術(shù)發(fā)明人)實(shí)驗(yàn)室共同研制的光片顯微鏡Nuohai LS 18,其運(yùn)用創(chuàng)新的平鋪光片技術(shù),克服了傳統(tǒng)光片顯微鏡中空間分辨率、光學(xué)層析能力和成像視野大小之間的矛盾,從而獲得均勻高分辨率的3D熒光圖像,廣泛應(yīng)用于腦科學(xué)、腫瘤學(xué)、藥物研發(fā)、干細(xì)胞研究、組織胚胎學(xué)、組織病理診斷等各個(gè)領(lǐng)域。
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锘海組織透明化試劑盒
Cat#:NH210701
锘海自主研發(fā)的組織透明化試劑盒依托測(cè)樣服務(wù)中積累到的豐富而寶貴的經(jīng)驗(yàn),對(duì)各種透明化方法進(jìn)行測(cè)試和比較后對(duì)試劑配方進(jìn)行了精心優(yōu)化,使其在組織熒光保護(hù)、樣本形態(tài)維持、降低自發(fā)熒光等方面表現(xiàn)出非常優(yōu)異的性能。能夠輕松實(shí)現(xiàn)小鼠腦、心、肝、脾、肺、腎、胃、腸、睪丸、淋巴、胎盤、卵巢等各類組織器官的透明化,適用范圍廣、操作簡(jiǎn)便、速度快、效率高,是廣大科研工作者的不二之選。
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锘海一站式科研服務(wù)
讓科研變得更簡(jiǎn)單
組織透明化技術(shù)和光片熒光顯微技術(shù)的發(fā)展,使研究者能從宏觀到微觀對(duì)生物組織內(nèi)部的結(jié)構(gòu)及生理、病理特征進(jìn)行觀察和功能性分析。锘海生物科學(xué)儀器(上海)有限公司提供完整器官的組織透明化、組織免疫熒光染色、高分辨3D顯微成像以及大數(shù)據(jù)分析一體化服務(wù),旨在通過(guò)精準(zhǔn)、快速、多樣化的一站式科研服務(wù)為每一位生命科學(xué)工作者提供個(gè)體化/定制化的解決方案。
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SmartBatch+ 批量組織透明化染色一體機(jī)
用于快速主動(dòng)式組織透明化染色系統(tǒng)的新型高通量系統(tǒng)
SmartBatch+主動(dòng)式組織透明化及染色一體機(jī)是基于 Lifecanvas公司新研發(fā)的 Clear+透明化系統(tǒng)迭代設(shè)計(jì)而成,高度融合原有一代主動(dòng)式組織透明化SmartClear系統(tǒng)和主動(dòng)式免疫標(biāo)記SmartLabel系統(tǒng)所有功能,是一臺(tái)功能高度集約、高通量的快速主動(dòng)式透明化染色一體化設(shè)備,F(xiàn)在,
您可以在一天內(nèi)實(shí)現(xiàn)一次性12個(gè)小鼠腦樣本的透明化或免疫標(biāo)記。
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