【課程簡介】
學(xué)生信一次報班從此以后再也不用東拼西湊反復(fù)報名各類培訓(xùn)班，
系統(tǒng)學(xué)生信，一次學(xué)到位，包教包會。
二個月從零基礎(chǔ)開始，精細化講解 將生信內(nèi)容全部學(xué)懂（理解）、學(xué)會（會敲代碼分析）、學(xué)透徹（站在頂層設(shè)計角度理解）、學(xué)以致用（用到自己的標(biāo)書申請和文章發(fā)表中）
學(xué)不會一直學(xué)，直到學(xué)會才畢業(yè)
【授課老師】
華哥：中山大學(xué)博士 指導(dǎo)過多篇CNS文章生信分析 參與多項國自然重點、國家重大專項、孔雀計劃等項目申報 有多年生信教學(xué)經(jīng)驗，學(xué)員遍布協(xié)和、華西、湘雅、瑞金、中山醫(yī)等著名醫(yī)院
【課程安排】每周二四六晚上每節(jié)課三個多小時
第一節(jié)課：r語言基礎(chǔ)學(xué)習(xí) 包括r和rstudio的安裝、環(huán)境配置、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)等基礎(chǔ)內(nèi)容學(xué)習(xí)
第二節(jié)課：在實戰(zhàn)中進一步提升對r語言的學(xué)習(xí)，主要以geo的芯片數(shù)據(jù)下載、整理、分析為主。
第三節(jié)課：芯片數(shù)據(jù)分析（主要系統(tǒng)指導(dǎo)如何使用geo數(shù)據(jù)庫畫生存曲線，以及無進展、無疾病、多分組的的生存曲線畫圖，包括熱圖 火山圖 箱線圖 小提琴圖 ）
第四節(jié)課：rnaseq數(shù)據(jù)分析（包括系統(tǒng)講解主流的Deseq2、Edger、limma-voom三種差異分析的方法）
第五節(jié)課：基因集富集分析 gsva gsea kegg go富集 包括自定義基因集的富集分析以兩篇nature子刊文章為例，系統(tǒng)講解如何進行參數(shù)調(diào)整得到符合文章趨勢的富集結(jié)果
第六節(jié)課：tcga 數(shù)據(jù)下載 整理 差異分析 結(jié)果畫圖展示
第七節(jié)課：非監(jiān)督共識聚類算法系統(tǒng)講解以兩篇cell文章為例 通路分組的生存曲線 轉(zhuǎn)錄因子富集
第八節(jié)課：wgcna算法系統(tǒng)講解以nature文章為例，系統(tǒng)講解三種免疫浸潤的算法，以及三種算法的具體應(yīng)用場景和區(qū)別以及參數(shù)調(diào)整技巧
第九節(jié)課 ：單細胞數(shù)據(jù)讀取以nature文章為例，創(chuàng)建seurat對象 質(zhì)控 s4對象的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)講解
第十節(jié)課:繼續(xù)以nature文章為例系統(tǒng)闡釋降維、聚類等概念，細胞亞群注釋三種方法
第十一節(jié)課：多個樣本整合的單細胞數(shù)據(jù)分析 包括錨定和harmony兩種主流的單細胞數(shù)據(jù)整合算法，同時講解多線程運算原理和實操。
第十二節(jié)課：單細胞差異分析 metadata理解 分組添加 可視化畫圖 熱圖 氣泡圖
第十三節(jié)課：以nature文章為例系統(tǒng)auc算法計算通路活性，單細胞差異基因的富集分析 gsea 亞群的gsva  auc 轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測
第十四節(jié)課：系統(tǒng)講解擬時間分析 包括monocle2 和monocle3 做3d擬時間
第十五節(jié)課：系統(tǒng)講解scenic算法 轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
第十六節(jié)課：系統(tǒng)講解cellphonedb、cellchat、italk三種主流分析細胞互作的軟件
第十七節(jié)課：infercnv和以cell文章為例的自定義算法的染色體拷貝數(shù)變異
第十八節(jié)課：單細胞非負矩陣 cnn降維 非共識聚類 以及單細胞的wgcna
第十九節(jié)課：以cell文章為例 系統(tǒng)講解單細胞的RNA velocity應(yīng)用
第二十節(jié)課：系統(tǒng)學(xué)習(xí)linux操作系統(tǒng) chipseq全流程分析以nature文章為例 包括質(zhì)控 上數(shù)據(jù)比對 、MACS2、IGV進行可視化
第二十一節(jié)課：chipseq下游的motif富集 不同處理直接的峰值overlap韋恩圖 差異paek尋找 peak注釋 以cell文章為例超級增強子尋找
第二十二節(jié)課：Atacpseq全流程分析包括MappingQC、多個重復(fù)樣本合并、Peakcalling、bedGraphToBigWig、TSS Enrichment、bedtools計算overlap、IDR評估、可視化。
第二十三節(jié)課：WES分析、gatk使用、VCF下游分析、annovar注釋
第二十四節(jié)課： 單細胞空間轉(zhuǎn)錄組的注釋以及可視化
第二十五節(jié)課：以優(yōu)秀標(biāo)書為例，講解如何將所學(xué)生信分析應(yīng)用于國自然標(biāo)書申請+課程大總結(jié)
 
【主辦單位】
瑋瑜科研平臺（上�，|瑜生物科技有限公司）
【承辦單位】
上�，|瑜生物科技有限公司
上海焦務(wù)科技服務(wù)中心
【培訓(xùn)時間】
2022年1月4日開始
【注冊費用】
注冊費用：8800元/人
可開會務(wù)、注冊、檢測、分析服務(wù)等發(fā)票
【繳費賬號】
A：匯款賬戶
戶 名：上海焦務(wù)科技服務(wù)中心  賬戶號：9734 0078 8012 0000 0311
開 戶 行：上海浦東發(fā)展銀行大華支行 
B：支付寶轉(zhuǎn)賬
收款人：[email protected]   支付寶戶名:上海瑋瑜生物科技有限公司
C：信用卡或公務(wù)卡支付
微信或支付寶掃描二維碼支付，通過信用卡/公務(wù)卡扣款
【聯(lián)系人】
聯(lián)系人：謝老師 13611825136     
報名郵箱： [email protected]

參考附件：報名回執(zhí)表