【課程內(nèi)容】
1.零基礎(chǔ)全面掌握生信核心知識(shí)點(diǎn)；
2.零基礎(chǔ)學(xué)會(huì)SCI模塊化寫作思路和修稿策略；
3.極速寫一篇SCI論文的核心思維和實(shí)操步驟；
4.零基礎(chǔ)極速掌握R語言核心知識(shí)點(diǎn)。
5.百分百的售后，一次授課，終生答疑。
【授課老師】
百川，百川科研公眾號(hào)創(chuàng)建者，211/985大學(xué)教授，發(fā)表SCI文章50余篇，數(shù)家SCI雜志審稿人，資深職業(yè)寫手，擅長(zhǎng)SCI文章撰寫與修稿，具有多年生信培訓(xùn)經(jīng)驗(yàn)，學(xué)員反響熱烈。本次將傾情奉獻(xiàn)，從構(gòu)文思路、到實(shí)操步驟、到寫作指導(dǎo)、到投稿修稿，提供一站式指導(dǎo)，課程緊緊圍繞差異分析、泛癌分析、多組學(xué)分析、多芯片聯(lián)合分析、批量生存分析、信號(hào)通路的篩選、蛋白互作、免疫微環(huán)境、ceRNA網(wǎng)絡(luò)、單細(xì)胞測(cè)序、實(shí)驗(yàn)關(guān)鍵基因的篩選、基因Signature的篩選、預(yù)測(cè)模型的建立、預(yù)測(cè)模型的評(píng)價(jià)、LASSO回歸、Nomogram諾模圖、ROC曲線、以及最新的熱點(diǎn)（課上內(nèi)容）等等進(jìn)行抽吸剝繭的精講，現(xiàn)場(chǎng)指導(dǎo)寫作，課程結(jié)束當(dāng)天能夠?qū)懗勺约旱奈恼鲁醺濉?br /> 【課程目標(biāo)】
（1）沒有課題時(shí)，自己找到課題；沒有機(jī)制時(shí)，自己找到機(jī)制；
（2）讓自己SCI文章或國自然項(xiàng)目?jī)?nèi)容更夯實(shí)，思路邏輯更完美；
（3）思路缺乏創(chuàng)新性，怎么辦？老師給你最新的生信分析熱點(diǎn)；
（4）掌握R語言的核心技能，掌握批量分析方法，掌握頂層計(jì)算機(jī)思維體系；
（5）掌握生信SCI寫作思路和修稿思路；
（6）掌握生信分析的獨(dú)家套路（5個(gè)套路供你選擇）；
【課程內(nèi)生信核心內(nèi)容】
（1）配對(duì)/多組差異分析；（2）蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò);(3) 免疫微環(huán)境；（4）ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建；（5）細(xì)胞焦亡的分析流程；（6）批量生存分析;(7)預(yù)測(cè)模型的建立及評(píng)價(jià)；（8）Cytoscape軟件精講；（9）實(shí)驗(yàn)基因的尋找與生信驗(yàn)證；（10）單基因泛癌分析；（11）多組學(xué)分析；（12）多芯片聯(lián)合分析；（13）實(shí)驗(yàn)信號(hào)通路的篩選；（14）基因Signature的構(gòu)建；（15）生信預(yù)測(cè)模型的建立；（16）預(yù)測(cè)模型的評(píng)價(jià)；（17）Cox回歸；（18）LASSO回歸；（19）Nomogram諾模圖（20）ROC曲線；（21）單細(xì)胞測(cè)序核心知識(shí)點(diǎn)；（22）單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的整理；（23）單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)控；（24）降維分析；（25）聚類分析；（26）單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞亞群的區(qū)分；（27）單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的差異分析；（28）單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞群的注釋；（29）新的細(xì)胞亞群的鑒定；（30）如何結(jié)合生信熱點(diǎn)發(fā)前沿文章。
【課程安排】

日期	課程主要內(nèi)容
第1天 19:30-22:30	R語言基礎(chǔ)知識(shí)介紹；R語言讀入及讀出； R包的多種安裝模式； R包及bioconductor資源的使用； R語言數(shù)據(jù)框的操作； R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)及循環(huán)控制（向量、因子、矩陣、數(shù)據(jù)庫、列表、for循環(huán)、if控制）； DIY自己的人生第一個(gè)批量處理函數(shù)； R語言繪圖原理及體系；R語言基本繪圖和高級(jí)繪圖精講及實(shí)操； GEO數(shù)據(jù)庫介紹、下載、清洗和探針注釋；TCGA數(shù)據(jù)的下載、清洗、不同類型數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換
第2天 19:30-22:30	多個(gè)GEO芯片聯(lián)合分析的多種思路； GEO芯片的probe探針的轉(zhuǎn)化方法匯總 差異分析精講（從表達(dá)矩陣的整理、歸一化、標(biāo)準(zhǔn)化到差異分析、多組差異分析、配對(duì)差異分析） 差異基因的呈現(xiàn)（精美火山圖、熱圖、PCA圖、小提琴圖） GEO數(shù)據(jù)的處理流程演示及學(xué)員實(shí)戰(zhàn)（數(shù)據(jù)清洗、熱圖、火山圖、GO分析、KEGG分析、共表達(dá)分析） R語言實(shí)現(xiàn)生存分析、功能注釋（精美生存曲線圖） GSEA講解及結(jié)果解讀（精美GSEA圖）
第3天 19:30-22:30	GSEA分析的全套流程講解及結(jié)果的詮釋（精美GSEA圖） 兩個(gè)基因相關(guān)性分析； 單基因生存分析 多基因生存分析 任意癌癥任意基因在癌和癌旁的表達(dá)分析； 同一癌癥不同亞型和不同分期的表達(dá)分析； 單基因在多個(gè)正常組織中的表達(dá)分析； 單基因在多個(gè)癌組織中的表達(dá)分析； 單基因在多個(gè)癌和癌旁中的表達(dá)分析； 預(yù)后模型類思路和實(shí)操精講：基因Signature的構(gòu)建；生信預(yù)測(cè)模型的建立；預(yù)測(cè)模型的評(píng)價(jià)； Cox回歸； LASSO回歸； Nomogram諾模圖；ROC曲線。
第4天 19:30-22:30	蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、cytoscape的實(shí)操使用，MCODE的實(shí)操； cytoHubba實(shí)操選取Hub genes(精美蛋白互作圖) 多個(gè)GEO數(shù)據(jù)的分析思維及實(shí)操 ceRNA的理論講解 mRNA incRNA miRNA的獲取。ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建，ceRNA網(wǎng)絡(luò)的驗(yàn)證 ceRNA網(wǎng)絡(luò)的展示（發(fā)表極分子網(wǎng)絡(luò)） 免疫微環(huán)境的理論講解，免疫浸潤(rùn)實(shí)操：自己測(cè)序樣本中免疫浸潤(rùn) 細(xì)胞豐度的計(jì)算；單基因表達(dá)與免疫細(xì)胞的影響、單基因突變與免疫細(xì)胞的影響、單基因拷貝數(shù)對(duì)免疫細(xì)胞的影響，免疫浸潤(rùn)細(xì)胞與臨床因素的關(guān)系 單基因泛癌分析、泛癌表達(dá)量分析、泛癌生存分析 泛癌基因突變 泛癌免疫分析； 多組學(xué)分析；
第5天 19:30-22:30	單細(xì)胞測(cè)序的分析思路及操作流程(單細(xì)胞測(cè)序核心知識(shí)點(diǎn)；單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的整理；單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)控；降維分析；聚類分析；單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞亞群的區(qū)分；單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的差異分析；單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞群的注釋；新的細(xì)胞亞群的鑒定) 生信的其他應(yīng)用(怎么利用TCGA/GEO數(shù)據(jù)庫中找課題?怎么利用TCGA/GEO挖掘下游機(jī)制？如何利用TCGA/GEO數(shù)據(jù)庫申請(qǐng)國自然？如何利用TCGA/GEO數(shù)據(jù)庫發(fā)表文章？) 最新熱點(diǎn)的分析思路指導(dǎo)(如何結(jié)合生信熱點(diǎn)發(fā)前沿文章) SCI文章模塊化寫作精講和修稿策略，實(shí)例講解：審稿人讓補(bǔ)充實(shí)驗(yàn)，如何不做實(shí)驗(yàn)也能讓審稿人滿意。 實(shí)戰(zhàn)環(huán)節(jié)：每個(gè)分析步驟的一步一步，“我在講，你在做，不懂你就問”的DIY環(huán)節(jié)；

 【涉及的31個(gè)議題】
1，沒有課題時(shí)，如何找課題、找線索、找機(jī)制？
2，后續(xù)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)，如何精準(zhǔn)找到下游作用通路或因子？
3，花錢測(cè)序回來的一堆結(jié)果，亂七八糟，怎么梳理、再分析成一篇SCI論文？
4，gene signature類文章的一些禁忌，哪些是評(píng)審專家特別看重，一票否決的點(diǎn)？
5，當(dāng)下熱門的免疫微環(huán)境是怎么回事，怎么利用自己的數(shù)據(jù)進(jìn)行操作?
6，審稿人說只有生信分析，沒有實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，怎么辦？,
7, TCGA數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)，怎么下載，需要進(jìn)行哪些數(shù)據(jù)清洗？
8，文章寫好了，怎么選刊，避免踩雷？
9，WGCNA是什么東西，為什么是生信分析的神器？
10，生存分析有幾種方案？怎么進(jìn)行批量操作？
11，免疫浸潤(rùn)的計(jì)算方法有多少種，怎么多種方法批量分析？
12，目前有什么熱點(diǎn)，怎么結(jié)合熱點(diǎn)，發(fā)出不一樣的生信文章？
13，單基因生信分析，能做到什么程度?
14，兩個(gè)基因，能進(jìn)行什么生信分析，產(chǎn)生多少結(jié)果用于SCI文章中？
15，一群基因，能進(jìn)行什么生信分析，產(chǎn)生多少結(jié)果用于SCI文章中？
16，如何利用生信挖掘，沒有試驗(yàn)前期，也能寫課題中標(biāo)書？
17，差異表達(dá)分析怎么做、配對(duì)樣本怎么做，多組樣本怎么做，小樣本怎么做，大樣本怎么做？
18，GSEA基因集富集分析，優(yōu)點(diǎn)是什么，缺點(diǎn)是什么，怎么做？CNS的大牛文章中到底是怎么用GSEA的？怎么在文章或課題里利用GSEA加分？
19，ceRNA網(wǎng)絡(luò)怎么構(gòu)建? 對(duì)于mRNA，miRNA，lncRNA，cirRNA，我們應(yīng)該做些什么？
20，GE0芯片數(shù)據(jù)，除了熱圖、火山圖，還能做什么？
21，那么多GEO平臺(tái)，如何以不變應(yīng)萬變的進(jìn)行探針I(yè)D轉(zhuǎn)換？
22，GEO多芯片數(shù)據(jù)，如何進(jìn)行批次效應(yīng)的處理？
23，ssGSEA算是批次效應(yīng)的終結(jié)者嗎？批次效應(yīng)的終結(jié)者到底是什么？
24，如何對(duì)長(zhǎng)鏈非編碼RNA、假基因等一網(wǎng)打盡的注釋？
25，單基因GSEA怎么做？有什么用途？跑出的結(jié)果怎么挑選和分析？
26，TCGA數(shù)據(jù)的正常和癌組織怎么分組，轉(zhuǎn)移和未轉(zhuǎn)移怎么分組，配對(duì)樣本怎么挑選？
27，如何從TCGA數(shù)據(jù)中提取出lncRNA？
28，同一基因出現(xiàn)不同的分析結(jié)果，我該信誰？
29，做通路分析時(shí)，肺癌的數(shù)據(jù)聚類出肝癌的通路，這是怎么回事？
30，我想進(jìn)一步學(xué)習(xí)，但害怕四處折騰踩雷，有什么避雷指南?
31，別人生信學(xué)3個(gè)月或?qū)W半年，我怎么學(xué)，才能后來居上，超過他們？
 
【主辦單位】
瑋瑜科研平臺(tái)（上海瑋瑜生物科技有限公司）
【承辦單位】
上�，|瑜生物科技有限公司
上海焦務(wù)科技服務(wù)中心
【培訓(xùn)時(shí)間】
2022年1月3日-7日晚上
【注冊(cè)費(fèi)用】
注冊(cè)費(fèi)用：3200元/人
可開會(huì)務(wù)、注冊(cè)、檢測(cè)、分析服務(wù)等發(fā)票
【繳費(fèi)賬號(hào)】
A：匯款賬戶
戶 名：上海焦務(wù)科技服務(wù)中心  
賬戶號(hào)：9734 0078 8012 0000 0311
開 戶 行：上海浦東發(fā)展銀行大華支行 
B：支付寶轉(zhuǎn)賬
收款人：wybiot@163.com   支付寶戶名:上�，|瑜生物科技有限公司
C：信用卡或公務(wù)卡支付
微信或支付寶掃描二維碼支付，通過信用卡/公務(wù)卡扣款
【聯(lián)系人】
聯(lián)系人：謝老師 13611825136     
報(bào)名郵箱：wybiot@126.com

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