單細胞實驗做完了,數(shù)據(jù)分析太復雜?我是生信小白,代碼啥跟啥?又或者看著別人分析好像懂了,自己一動手就“我又學廢了”?金秋十月,在這最美的豐收時節(jié),由怡美通德主辦的2021年首期10x Genomics單細胞生信培訓班成功舉辦,小班教學,包教包會,學員們感覺干貨多多,收獲滿滿~
為了讓學員們都能真正做到“眼看會了,手也會了”,我們特意安排了線下培訓班,采用理論與實操相結(jié)合的形式,讓生信零基礎的小伙伴也能做到現(xiàn)學現(xiàn)用,數(shù)據(jù)分析不再愁,這種形式也受到了學員的一致好評。
首先,由怡美通德數(shù)據(jù)分析主管殷汝雷為大家介紹北鯤云分析平臺的功能及使用方法,我們?yōu)槊總學員都開通了免費且可獨立操作的賬號,無需服務器,在電腦網(wǎng)頁端登錄賬號即可進行操作,簡單好上手。接下來,汝雷介紹了10x Genomics的開源數(shù)據(jù)分析軟件Cell Ranger的 pipeline,演示了ount、aggr及 reanalyze三大主要功能,從軟件下載、運行到到如何拆分數(shù)據(jù)、得到表達矩陣、合并樣本等。然后,汝雷又詳細講解并演示了10x Genomics 的開源數(shù)據(jù)可視化軟件Loupe Browser的安裝使用,如何根據(jù)已知細胞類型的marker基因?qū)毎M行注釋和圈選、聚類,如何進行差異分析,得到直觀的細胞聚類圖、小提琴圖等,并帶著學員們進行實操和答疑。最后,由百奧智匯的技術(shù)支持李曉敏為大家介紹了第三方分析軟件-由百奧智匯自主研發(fā)的單細胞數(shù)據(jù)分析軟件OmniAnalyzer,使用普通電腦即可運行,提供從原始數(shù)據(jù)處理到終端數(shù)據(jù)分析的一站式解決方案。
一天的培訓班圓滿收官,緊湊而充實的課程安排,讓學員們受益匪淺。通過敲擊鍵盤輸入一些簡單的命令即可得到想要的結(jié)果,大家紛紛表示原來生信分析也不是那么遙不可及,感受到了生信分析的魅力。小編也預祝所有參加培訓班的學員都能取得理想的分析結(jié)果,早日發(fā)表高分文章!
錯過本次培訓班怎么辦,不用擔心,我們會根據(jù)此次培訓班學員的反饋對課程進行調(diào)整和優(yōu)化,舉辦更多更精彩的培訓班,敬請期待!
怡美通德現(xiàn)與北鯤云、百奧智匯達成戰(zhàn)略合作,旨在為不具備專業(yè)單細胞軟件分析工具和服務器等軟硬件條件的科研人員,提供簡單好上手的單細胞生信分析軟件及工具,對單細胞測序數(shù)據(jù)進行完整的生信分析。