Illumina收購Enancio,降低基因組儲存空間及傳輸成本
瀏覽次數(shù):3524 發(fā)布日期:2020-7-17
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因美納收購壓縮軟件公司Enancio
持續(xù)降低海量基因組數(shù)據(jù)所需的存儲空間以及傳輸成本
2019年,因美納在全球投入使用的15,000多個測序系統(tǒng)所生成的基因組數(shù)據(jù)量同比增長50%以上,總計高達150PB,相當于連續(xù)錄制500年高清視頻所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量。如此海量的數(shù)據(jù)反映了基因測序技術(shù)的日益完善,尤其體現(xiàn)在測序成本降低產(chǎn)生的影響和基于測序技術(shù)的研究及臨床應(yīng)用的激增,這些都有助于改善生命健康。
因美納一直以來致力于提供最具創(chuàng)新性和靈活性的測序技術(shù)。而許多人并不了解,因美納同樣致力于幫助客戶管理不斷增長的輸出數(shù)據(jù),以降低研究基因組信息的成本和時間。
繼2018年5月收購Edico公司、2020年6月收購云軟件公司BlueBee之后,因美納又迎來了位于法國瑟松塞維涅(Cesson-Sévigné)的基因組數(shù)據(jù)壓縮軟件公司Enancio。Enancio的無損壓縮技術(shù)能將因美納測序儀的輸出數(shù)據(jù)從50GB壓縮到10GB,使數(shù)據(jù)存儲成本降低5倍。收購完成后,Enancio的技術(shù)將直接集成到云數(shù)據(jù)交換平臺DRAGEN上,以及因美納的云存儲平臺服務(wù)中。
因美納全球產(chǎn)品開發(fā)高級副總裁Susan Tousi表示:“熱烈歡迎Enancio加入因美納大家庭,我們將繼續(xù)系統(tǒng)性地為用戶解決基因測序平臺海量數(shù)據(jù)所帶來的存儲瓶頸問題。因美納可擴展的云數(shù)據(jù)交換平臺DRAGEN目前擁有業(yè)內(nèi)最先進、最獨特的二級分析工具,該平臺采用因美納分析平臺(IAP)和BlueBee的技術(shù),為客戶提供高效、快速、簡單的工作流程。Enancio和BlueBee加入后,因美納現(xiàn)在擁有了卓越的數(shù)據(jù)云服務(wù)。”
Enancio基于云的準商用壓縮技術(shù),可以在降低數(shù)據(jù)存儲成本的同時保持數(shù)據(jù)的完整性。Enancio壓縮是一個無損、可參照的基因組數(shù)據(jù)壓縮器。它采取“參照式”(reference-based)的壓縮算法壓縮DNA序列,用一種專為壓縮設(shè)計的超快映射方法,將讀取內(nèi)容映射到參考基因組上。應(yīng)用緊湊的二進制格式來將讀取信息編碼為位置和差異列表,再采用熵編碼器。最終,用適合不同類型質(zhì)量方案的距離編碼器和背景模型,以無損方式對質(zhì)量分數(shù)進行編碼。
Enancio的技術(shù)為基因組數(shù)據(jù)的壓縮和解壓縮提供了最快速、最高效的解決方案,并且對因美納的其它信息解決方案也進行了很好的補充。
Enancio首席執(zhí)行官Jennifer Del Giudice表示:“很榮幸能夠加入因美納的大家庭,我們將共同應(yīng)對這場把研究人員和臨床醫(yī)生推向數(shù)字時代的‘數(shù)據(jù)海嘯’。這場信息海嘯影響深遠,并且非常復雜,但其中同樣蘊藏著科學發(fā)展的無限可能。在與因美納的云數(shù)據(jù)交換平臺DRAGEN集成后,我們將使數(shù)據(jù)的存儲和傳輸更加高效,對用戶更加友好。”
因美納最近進行的一系列與基因組數(shù)據(jù)分析相關(guān)的收購打破了海量數(shù)據(jù)所帶來的挑戰(zhàn)。因美納致力于改善客戶端到端的基因組測序工作流體驗。因美納強大、富有創(chuàng)新性的信息學技術(shù)發(fā)揮了關(guān)鍵作用。未來,因美納將繼續(xù)提高基因組數(shù)據(jù)的利用率,并加快基因組數(shù)據(jù)在臨床中的應(yīng)用。
關(guān)于因美納 (Illumina)
因美納公司致力于推動和激發(fā)基因組學的發(fā)展而不斷改善人類健康。專注創(chuàng)新使我們成為全球基因測序和芯片技術(shù)的領(lǐng)導者,并為全球范圍的科研、臨床和應(yīng)用市場客戶提供專業(yè)服務(wù)。我們的產(chǎn)品廣泛應(yīng)用于生命科學、腫瘤學、生殖保健、農(nóng)業(yè)及其他新興領(lǐng)域。欲了解更多信息,請訪問
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