病毒是一種遺傳物質(zhì)包裹在蛋白質(zhì)外殼中的亞微觀寄生顆粒。為了生存,病毒必須感染宿主細(xì)胞并利用它們的過程進(jìn)行復(fù)制。病毒復(fù)制周期可導(dǎo)致宿主細(xì)胞發(fā)生顯著的生化和結(jié)構(gòu)變化,從而導(dǎo)致細(xì)胞損傷。大多數(shù)影響人類的病毒都會(huì)引起急性感染,并在相對較短的時(shí)間內(nèi)疾病會(huì)迅速恢復(fù)(流感、麻疹、水痘、Covid-19)。另一方面,一些病毒會(huì)導(dǎo)致持續(xù)感染,在宿主的整個(gè)生命周期中,病毒會(huì)持續(xù)存在于體內(nèi)。例如在HIV和HPV感染后,病毒顆粒會(huì)在很長一段時(shí)間內(nèi)緩慢增加,最終導(dǎo)致與嚴(yán)重免疫抑制或癌癥相關(guān)的明顯癥狀。研究還表明,病毒可以部分或完全整合于宿主基因組,從而影響物種的進(jìn)化;谶@些原因,對病毒的研究顯得尤為重要,這不僅有助于我們加深對動(dòng)物和植物生命的了解,更有助于我們學(xué)習(xí)如何通過疫苗和抗病毒治療來對抗病毒感染的危險(xiǎn)影響。
抗病毒藥物和疫苗的研發(fā)都始于高通量篩選階段。因此,病毒研究工作流程需要設(shè)計(jì)成能夠同時(shí)處理大量樣本,同時(shí)又能保持病毒完整性并限制分析偏差。研磨是大多數(shù)病毒提取工作流程的第一步。為了獲得可重復(fù)的結(jié)果,病毒感染樣本的適當(dāng)研磨至關(guān)重要。使用研磨珠進(jìn)行機(jī)械裂解是標(biāo)準(zhǔn)化研磨方法的金標(biāo)準(zhǔn)。法國Bertin Precellys和Minilys生物樣品研磨器采用3D振蕩技術(shù),是評估不同組織中病毒RNA和病毒滴度的理想儀器。
法國Bertin整理了一份關(guān)于Bertin生物樣品研磨器病毒研究白皮書,在這篇白皮書中,從實(shí)例出發(fā)提出了一些病毒研究的優(yōu)化建議,從而實(shí)現(xiàn)高通量和可重復(fù)的病毒學(xué)分析。
排泄物樣品中病毒基因組學(xué)研究優(yōu)化
從感染組織中提取病毒RNA
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