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大樣本數(shù)據(jù)共享視角下對新冠病毒論文的理解

瀏覽次數(shù):742 發(fā)布日期:2020-2-13  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
2020 年 2 月 9 日,中國工程院院士、新型冠狀病毒肺炎疫情聯(lián)防聯(lián)控工作機制科研攻關(guān)專家組組長鐘南山院士團隊、李蘭娟院士團隊、武漢市金銀潭醫(yī)院、武漢市中心醫(yī)院、黃岡市主要醫(yī)院、浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院、香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)與治療學(xué)系等一線臨床醫(yī)院和研究機構(gòu)聯(lián)合在預(yù)印本平臺 medRxiv 發(fā)表了題為Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China 的文章。研究匯總了全國 31 個省市,共 552 家醫(yī)院的 NCP 患者病例資料,納入了從發(fā)病到 1 月 29 號共計 1099 例確診的 2019-nCoV 感染 NCP 患者。(文章地址https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.06.20020974v1.full.pdf
一線的研究數(shù)據(jù)、高水平的研究團隊、大規(guī)模的共享樣本數(shù)據(jù)分析、及時的信息披露等等,無論從哪個角度來看,這篇論文都具有極高的科研價值。本篇論文得出以下結(jié)論:潛伏期最長可達 24 天,尿液、糞便中都能找到新型冠狀病毒,初診時僅有 43.8% 的病人有發(fā)熱癥狀……
 
 
通過對鐘院士文章的理解,我們可以發(fā)現(xiàn)在本次研究過程中,大樣本數(shù)據(jù)共享和建立數(shù)據(jù)集在進行疫情精準防控分析中起到重要作用。樣本數(shù)據(jù)共享的價值在于:通過不同機構(gòu)之間進行樣本數(shù)據(jù)共享,集中形成大樣本數(shù)據(jù)。對大樣本數(shù)據(jù)從不同維度進行數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn)新冠病毒的統(tǒng)計性信息特點,為公眾提供完整、連續(xù)、準確、及時的防疫策略,為醫(yī)護人員提供追溯疾病源頭的方法,為決策者提供傳染病發(fā)展的有效數(shù)據(jù)和依據(jù)。
 
本論文為回顧性研究,為什么要做回顧性研究?分析可以分為以下兩點:①單一機構(gòu)樣本數(shù)據(jù)量不足,不能支撐研究需要,所以幾家單位聯(lián)合研究;②無可用數(shù)據(jù)集,導(dǎo)致數(shù)據(jù)分析緩慢,結(jié)果難匯總;谝陨蟽牲c,做了回顧性研究。當然,如果有一個平臺,能夠?qū)崿F(xiàn)數(shù)據(jù)實時共享,那么研究者還可以進行大樣本數(shù)據(jù)的階段性實時研究,為疫情防控工作提供指導(dǎo)。
 
(來源:科技部官方網(wǎng)站)
 
日前,科技部也做出了明確指示:要求科技人員大力弘揚科學(xué)家精神,樹立大局觀念,增強社會責(zé)任感,以“功成不必在我”的胸襟,發(fā)揮集智攻關(guān)、團結(jié)協(xié)作的優(yōu)良傳統(tǒng),加強有關(guān)實驗數(shù)據(jù)、臨床病例、流行病學(xué)統(tǒng)計等數(shù)據(jù)、成果的開放共享,共同做好防控新型冠狀病毒肺炎的科技應(yīng)對工作。
 
2019年9月4日,中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)分會-2019(CTS2019)在湖北武漢召開,鐘南山院士在全體大會上做了《大數(shù)據(jù)視角下的呼吸疾病防控》的報告。
 
2020年1月29日的新聞發(fā)布會上,世界衛(wèi)生組織傳染病流行病學(xué)家Maria Van Kerkhove也表示:“共享病毒至關(guān)重要!
 
2020年2月5日,《自然》雜志在評論欄目發(fā)表官方聲明,呼吁全球的研究者們聯(lián)合起來,將與疫情相關(guān)的所有數(shù)據(jù)和研究成果及時公開,并承諾將發(fā)表的相關(guān)研究立即與世界衛(wèi)生組織共享。
 
既然大樣本的數(shù)據(jù)共享對科研價值如此之大,大樣本數(shù)據(jù)共享平臺也就顯得尤為重要。作為生物樣本庫行業(yè)耕耘已久且青島市首家科創(chuàng)板上市的物聯(lián)網(wǎng)生物科技公司,海爾生物醫(yī)療生物樣本庫團隊,結(jié)合近十余年來全國700余座生物樣本庫建設(shè)運營的實際經(jīng)驗,為解決各生物樣本庫“信息孤島”的行業(yè)痛點,結(jié)合科研工作者的實際需求,迭代了BIMS系統(tǒng)(海爾生物樣本信息管理系統(tǒng)),同時基于區(qū)塊鏈技術(shù),采用數(shù)據(jù)驅(qū)動、智能合約保障的模式,打造了具有五大特色的“生物樣本信息共享生態(tài)服務(wù)平臺”(以下簡稱“平臺”,官方網(wǎng)址http://ubiobank.haierbiomedical.com/#/home):
 
 
一、平臺通過區(qū)塊鏈技術(shù)強化數(shù)據(jù)校驗,避免低效數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)共享。例如,平臺通過不同技術(shù)手段對樣本共享數(shù)據(jù)進行多方數(shù)據(jù)校驗,從樣本源上切實保障數(shù)據(jù)質(zhì)量,為后續(xù)的數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)應(yīng)用奠定良好基礎(chǔ);
二、平臺利用區(qū)塊鏈技術(shù),切實加強數(shù)據(jù)安全和質(zhì)量保護,提升保護樣本源隱私,加強安全規(guī)范。堅守兩個原則:“脫敏原則”,發(fā)布內(nèi)容要“經(jīng)過特殊算法處理,脫敏私密信息”,“非必要不公開原則”;
三、平臺打破樣本數(shù)據(jù)“孤島”,高效運轉(zhuǎn)數(shù)據(jù),加強合作機構(gòu)之間交流互動,加速數(shù)據(jù)整合,提升科研產(chǎn)出效率;
四、平臺擁有樣本、數(shù)據(jù)、物流、檢驗等多種服務(wù)資源,面向醫(yī)療、生物、制藥、科研、醫(yī)學(xué)教育等領(lǐng)域的用戶,提供項目合作及生態(tài)服務(wù)(樣本存儲、樣本轉(zhuǎn)運、樣本檢測、設(shè)備租賃、科研項目合作等),在科學(xué)研究、技術(shù)轉(zhuǎn)化和成果應(yīng)用領(lǐng)域提供完整的線上線下支持,打造生物科研領(lǐng)域的生態(tài)體系。
五、平臺提供上億份級樣本資源供廣大科研工作者檢索,整合國內(nèi)樣本庫資源,提供精準檢索服務(wù),為科研合作方搭建快速合作橋梁,發(fā)揮生物樣本資源的科研價值、社會價值。
 
另外還有科研資訊專欄、明星生物樣本庫展示、權(quán)威專家直播、行業(yè)通知公告、技術(shù)標準展示等功能;平臺線下定期舉辦科研學(xué)術(shù)沙龍活動,共同探討生物樣本科研應(yīng)用新方向,加強科學(xué)家之間的合作交流。
 
面對這場席卷全國疫情風(fēng)暴,平臺將強化跨單位、跨學(xué)科的樣本數(shù)據(jù)共享,提升樣本數(shù)據(jù)資源的整合效率,加快樣本數(shù)據(jù)集成分析的速度,形成數(shù)據(jù)、模型及數(shù)據(jù)集三維一體化,切實實現(xiàn)數(shù)據(jù)共享、科研共享、成果共享,為科研加油提速,為人類大健康貢獻力量。
 
附1:共享平臺官網(wǎng)注冊地址:http://ubiobank.haierbiomedical.com/#/home
附2:APP下載:應(yīng)用商店搜索“樣本管家”
附3:公眾號二維碼
 
附4:BIMS及樣本庫示例
 
 
相關(guān)公司:青島海爾生物醫(yī)療股份有限公司
聯(lián)系電話:18562557958
E-mail:tingting.liu@haierbiomedical.com


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