生物數(shù)據(jù)分析技能2.0實(shí)訓(xùn)會(huì)通知
瀏覽次數(shù):5652 發(fā)布日期:2019-12-13
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生物醫(yī)學(xué)已進(jìn)入大數(shù)據(jù)時(shí)代,借助生物醫(yī)學(xué)多組學(xué)、多層次的海量數(shù)據(jù),可以從前所未有的廣度和深度來(lái)研究生物體運(yùn)行機(jī)制。由于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)多呈分散復(fù)雜特征,以海量數(shù)據(jù)挖掘與分析為主體內(nèi)容的生物信息學(xué)技能就成為科研必要手段,如疾病的病因?qū)W、臨床診斷標(biāo)志物、治療或作用靶點(diǎn)識(shí)別,關(guān)鍵大分子的發(fā)現(xiàn)與功能預(yù)測(cè),以及遺傳調(diào)控機(jī)制等方面。本課程曾先后用名《基因序列分析技術(shù)》和《功能基因組信息分析技術(shù)》,后將上述兩門(mén)課程整合更名為《生物數(shù)據(jù)分析技能》,此前共計(jì)舉辦了21期。自本期會(huì)議起,會(huì)議升級(jí)為《生物數(shù)據(jù)分析技能2.0》,對(duì)課程內(nèi)容與培訓(xùn)日程進(jìn)行了大幅度調(diào)整,遞進(jìn)式專(zhuān)注講解高通量數(shù)據(jù)解析:表達(dá)數(shù)據(jù)挖掘→共表達(dá)(聚類(lèi)、富集、相互作用)分析→構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以順應(yīng)學(xué)科發(fā)展和滿(mǎn)足學(xué)員實(shí)際需要。授課繼續(xù)沿用主講教師獨(dú)創(chuàng)的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教學(xué)模式,著力于以真實(shí)問(wèn)題為引線,將理論授課與上機(jī)實(shí)踐有機(jī)地融為一體,逐步介紹涉及的各項(xiàng)技能,指導(dǎo)學(xué)員將其融會(huì)貫通并應(yīng)用到課題研究中。TPS教學(xué)模式多年來(lái)在本科、研究生教學(xué)及20余期各類(lèi)培訓(xùn)會(huì)議中取得了極佳的教學(xué)效果,受到廣大學(xué)員的一致好評(píng)和推崇。
時(shí)間地點(diǎn):
2020年1月10日-12日(周五-周日)(周五報(bào)到,周六-周日授課兩天一夜)
合肥伯爵世家酒店(合肥市瑤海區(qū)北二環(huán)雙七路156號(hào))
主辦單位:
北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
培訓(xùn)日程:(所有課程均含上機(jī)實(shí)踐)
日期 |
時(shí)間 |
授課題目 |
授課內(nèi)容 |
1月10日 |
16:00-21:00 |
培訓(xùn)簽到-領(lǐng)取資料 |
|
1月11日 |
08:00-08:30 |
軟件安裝,調(diào)試運(yùn)行 |
|
08:30-10:30 |
表達(dá)譜差異數(shù)據(jù)挖掘 |
差異表達(dá)基因集(DEGs)分析策略。
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)檢索及數(shù)據(jù)集在線分析。
利用GEO2R在線工具篩選獲得差異表達(dá)基因集,并獲得TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)交集結(jié)果。 |
10:30-12:00 |
表達(dá)譜數(shù)據(jù)聚類(lèi)分析 |
利用ArrayTools軟件(設(shè)置各項(xiàng)參數(shù))處理GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載的表達(dá)譜數(shù)據(jù)。
表達(dá)譜數(shù)據(jù)聚類(lèi)分析。
聚類(lèi)圖形優(yōu)化工具。 |
14:00-17:30 |
基因集功能富集分析 |
利用DAVID、Metascape在線工具進(jìn)行基因集功能富集分析(GO MF、GO BP、GO CC;KEGG Pathway)。
繪制或下載基因集功能富集圖。
基因集韋恩圖分析。
基因集ID多元轉(zhuǎn)換。 |
19:00-22:00 |
基因集相互作用分析 |
利用String在線工具(設(shè)置各項(xiàng)參數(shù))獲得基因集相互作用結(jié)果。
mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。 |
1月12日 |
08:30-12:00 |
交互作用數(shù)據(jù)可視化 |
利用Cytoscape軟件進(jìn)行基因注釋、分子間相互作用、基因集差異表達(dá)的可視化分析。
批量修改交互網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)、邊、背景屬性。
利用Cytoscape App進(jìn)行基因集交互網(wǎng)絡(luò)的GO富集分析、文本挖掘、關(guān)鍵/瓶頸基因及核心基因篩選。
高分辨率可視化結(jié)果的保存與輸出。 |
13:30-16:00 |
共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 |
構(gòu)建基因集差異共表達(dá)Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
靶點(diǎn)基因分析策略。 |
具體事宜:
1. 培訓(xùn)期間提供午餐、11日晚餐。住宿統(tǒng)一安排在合肥伯爵世家酒店(合肥站店),主辦單位可為學(xué)員代訂房間,標(biāo)準(zhǔn)間/單人間200元/間(含早餐),費(fèi)用自理;學(xué)員也可自行上網(wǎng)預(yù)訂。住宿費(fèi)發(fā)票在退房時(shí)由酒店開(kāi)具。對(duì)于需要合住的學(xué)員,會(huì)務(wù)組將按報(bào)到先后順序安排,最后出現(xiàn)單人無(wú)法安排的情況,需要自補(bǔ)房間差價(jià)。
2. 上機(jī)實(shí)踐需自帶筆記本電腦(非上網(wǎng)本),會(huì)場(chǎng)將布置充足的電源插座。請(qǐng)確保電腦配置無(wú)線網(wǎng)卡(無(wú)線wifi覆蓋會(huì)場(chǎng))。為提高上網(wǎng)效率,推薦自行攜帶4G無(wú)線上網(wǎng)卡或具有熱點(diǎn)共享功能的手機(jī)。操作系統(tǒng)為Win7/8/10 64位專(zhuān)業(yè)版(非任何商業(yè)版及Mac系統(tǒng)),辦公軟件為Office 2010以上專(zhuān)業(yè)版(非任何商業(yè)版及WPS Office),否則無(wú)法保證全部軟件順利安裝和使用。
3. 授課幻燈、軟件(附安裝指南)及上機(jī)實(shí)踐文檔已上傳至百度網(wǎng)盤(pán),在報(bào)到通知中會(huì)告知鏈接及密碼。軟件請(qǐng)事先下載并安裝,如安裝有問(wèn)題,請(qǐng)咨詢(xún)客服或開(kāi)課當(dāng)天到會(huì)場(chǎng)咨詢(xún)。
4. 嚴(yán)格按照培訓(xùn)日程授課(共計(jì)22標(biāo)準(zhǔn)學(xué)時(shí)),第二天16:00結(jié)課,方便外地學(xué)員返程。
會(huì)議費(fèi)用:
2019年12月20日前報(bào)名并繳費(fèi)3200元/人,12月20日后3400元/人(5人及以上團(tuán)體報(bào)名并實(shí)際報(bào)到另優(yōu)惠300元/人),授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋章)和發(fā)票。
本次會(huì)議費(fèi)委托合肥華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司收取并統(tǒng)一提供會(huì)務(wù)發(fā)票。
1.網(wǎng)上匯款或銀行轉(zhuǎn)賬
戶(hù) 名:合肥華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
開(kāi)戶(hù)行:中國(guó)銀行合肥臨泉路支行
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注:匯款時(shí)請(qǐng)務(wù)必注明“生物數(shù)據(jù)”和學(xué)員姓名,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認(rèn)。
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