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第一屆多組學(xué)論壇成功開幕:中科生信云平臺首發(fā)亮相

瀏覽次數(shù):28622 發(fā)布日期:2019-8-10  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
2019年8月8日,本站訊——首屆全國多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇在滬成功舉行,本屆論壇由上海中科新生命生物科技有限公司主辦,中國生物器材網(wǎng)作為合作媒體全程參與了此次活動。據(jù)悉,隨著科學(xué)實驗技術(shù)的全面發(fā)展,獲取穩(wěn)定可靠、數(shù)據(jù)量大的基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組和代謝組等高通量組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)變得越來越普遍,而對這些組學(xué)數(shù)據(jù)的深入分析和解釋則變得越來越重要,尤其是利用大數(shù)據(jù)和人工智能的方法對不同生物分子層次數(shù)據(jù)的整合分析成為未來發(fā)展的趨勢。此次高端論壇吸引了來自不同領(lǐng)域的研究員,教授,及其它科研人員近200人共同探討多組學(xué)的新技術(shù)和新思路,以及大數(shù)據(jù)背景下的組學(xué)發(fā)展方向和未來。
首屆全國多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇現(xiàn)場
 
論壇特邀嘉賓中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院副院長廖侃研究員在開幕辭中回顧了中科新生命15年來的成長發(fā)展歷程,從不足十人的小團隊壯大到現(xiàn)今近三百人的精英隊伍,已建立科技服務(wù)(多組學(xué)應(yīng)用) 、生物醫(yī)藥表征確證和精準醫(yī)療三大服務(wù)平臺,年銷售額過億。廖侃研究員在致辭中提到:“我們一步步見證了中科新生命的蓬勃發(fā)展,可喜可賀。我預(yù)祝本次全國多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇順利召開,并取得圓滿成功,各參會人員都能有所收獲。”
中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院副院長廖侃研究員
 
“隨著系統(tǒng)生物學(xué)與多組學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,恰逢中科新生命成立15周年之際,特別舉辦本次多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇暨中科新生命生信培訓(xùn)班,旨在為各領(lǐng)域的行業(yè)專家提供一個交流平臺。最后,預(yù)祝本次大會能圓滿成功,祝前來參加的各位老師能有所思、有所獲、有所感。”中科新生命副總經(jīng)理謝永明博士在隨后的致辭中對與會的各位領(lǐng)導(dǎo)、專家和其它同仁們表示了熱烈的歡迎并預(yù)祝此次活動圓滿成功。
 
 中科新生命副總經(jīng)理謝永明博士

北美華人質(zhì)譜學(xué)會主席、普渡大學(xué)終身教授陶緯國博士首先為帶來了題為《Functional Proteomics:from Lab to Clinic》的現(xiàn)場報告。陶教授的課題組以磷酸化組學(xué)結(jié)合生物學(xué)信息技術(shù)為核心,研究方向橫跨植物和臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的重要課題,開拓性的研發(fā)了以番茄為模式生物的植物磷酸化分析、蛋白質(zhì)富集方法技術(shù),以及將磷酸化組學(xué)檢測和外泌體研究相結(jié)合,在基于外泌體中蛋白質(zhì)磷酸化組變化的腫瘤生物標志物的檢測和分析方向取得突破性進展。
 
“與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相同,代謝組學(xué)在生物醫(yī)學(xué)研究中主要應(yīng)用于生物標志物的發(fā)現(xiàn)和提供相關(guān)病理研究的分子機制。” 來自中國科學(xué)院上海營養(yǎng)健康研究院博士生導(dǎo)師尹慧勇研究員在其題為《代謝組學(xué)與心血管疾病》的報告指出,“而不同于其它組學(xué),代謝組學(xué)闡明的我們身體內(nèi)已經(jīng)發(fā)生的故事,所研究的代謝物的化學(xué)結(jié)構(gòu)千差萬別,同時甚至有高達10個數(shù)量級的代謝物豐度差異。” 在此基礎(chǔ)上,尹慧勇研究員介紹了課題組在血漿膽固醇脂氧化產(chǎn)物的靶向脂質(zhì)組學(xué)和心血管相關(guān)其它代謝類疾病的分子機制探索等方向上的進展。
 
中國科學(xué)院上海營養(yǎng)健康研究院博士生導(dǎo)師尹慧勇研究員

鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院肝病研究中心的高潔博士報告的主題為《蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)聯(lián)合分析肝癌發(fā)生發(fā)展機制》。高博士首先從課題研究背景入手,介紹了原發(fā)性肝癌主要指肝細胞癌,是常見的惡性腫瘤之一,具有惡性度高、進展快、侵襲性強、預(yù)后差和死亡率高等特點。肝癌的致病原因多樣,目前針對肝癌有多種治療手段,但療效提高有限,受制于未能全面認識肝癌。隨著理論及檢測手段的快速發(fā)展,在基因組學(xué)基礎(chǔ)上衍生的多種組學(xué)的聯(lián)合研究使更深層次地認識、理解多種疾病的發(fā)生、發(fā)展乃至生物進化成為可能。高潔博士課題組發(fā)現(xiàn)了同型半胱氨酸在細胞內(nèi)的代謝途徑中的關(guān)鍵性BHMT蛋白與基因表觀遺傳學(xué)上的甲基化改變乃至腫瘤的形成高度相關(guān)。
 
“出生缺陷是導(dǎo)致全世界范圍內(nèi)產(chǎn)兒和嬰幼兒死亡和兒童殘疾的主要原因,而我國的新生兒出生缺陷近年來有上升趨勢,其中有80%為發(fā)育畸形,需要終生治療。產(chǎn)前早期診斷在新生兒出生缺陷的防治方面具有重要意義。” 盛京醫(yī)院衛(wèi)生部先天畸形重點實驗室博士生導(dǎo)師袁正偉教授在其題為《多組學(xué)技術(shù)在出生缺陷早期診斷分子標志物篩查的應(yīng)用》的報告中指出。袁教授接著介紹了無創(chuàng)產(chǎn)前診斷DNA、RNA和蛋白質(zhì)分子標志物進行篩查的案例,并展望了產(chǎn)前診斷分子標志物研究領(lǐng)域的未來發(fā)展趨勢在于各種組學(xué)技術(shù)系統(tǒng)篩選不同層次分子標志物,生物信息學(xué)技術(shù)對各種組學(xué)檢測結(jié)果進行貫通交互分析;在大規(guī)模、多中心的隊列中能驗證分子標志物,利用人工智能技術(shù)可對分子標志物優(yōu)化、篩選并建立計算機預(yù)警與診斷模型三個主要發(fā)展方向。
 
隨后在與會的各位組學(xué)研究的專家和領(lǐng)導(dǎo)的共同見證下,隆重舉行了“中科新生命云平臺”正式發(fā)布會,將整場活動的氛圍推向了一個小的高潮。該平臺解決方案通過豐富的分析工具接入與精心打磨的交互式分析界面,有效降低科研項目生物信息學(xué)分析的難度,提升科研效率,助力研究項目進度穩(wěn)定推進。
“中科新生命云平臺”正式發(fā)布現(xiàn)場

伴隨著基因組學(xué)、蛋白組學(xué)等多組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的爆炸式數(shù)據(jù)量增長,中科生信云平臺的產(chǎn)生滿足了研究者們的高通量生物信息學(xué)數(shù)據(jù)挖掘和分析,安全智能的大數(shù)據(jù)管理,界面友好簡單易用的操作模式三大方面的需求。中科新生命生物信息學(xué)平臺負責(zé)人尚婧女士在現(xiàn)場演示“中科生物信息學(xué)云分析平臺”時介紹道,“整個平臺的操作過程只需通過選擇方法、上傳數(shù)據(jù)和配置參數(shù)三個步驟,即可返回運算結(jié)果。”平臺現(xiàn)階段覆蓋了火山圖、層次聚類熱圖、相關(guān)性熱圖、箱線圖等主流工具。展望未來,中科生信云平臺將從生物信息數(shù)據(jù)分析工具、多組學(xué)分析流程、多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘和開源式用戶自定義分析流程四大方向著力提升科研效率。
 
中科新生命生物信息學(xué)平臺負責(zé)人 尚婧

下午的報告開始前,所有與會者共同見證了中科新生命聯(lián)合揚州大學(xué)農(nóng)學(xué)院小麥遺傳及分子育種實驗室舉行戰(zhàn)略合作簽約儀式。此次協(xié)議的簽署將作為一個新起點,雙方將在小麥分子遺傳育種方向上利用基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)及代謝組學(xué)等定制化多組學(xué)技術(shù)進行更深入的戰(zhàn)略性合作及創(chuàng)新。
 
隨后,來自福建農(nóng)林大學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心主任的陳偉教授在其主旨演講《A multilevel investigation to reveal the mechanism of salt tolerance in mangrove Kandelia candel》中指出,作為一種重要的海岸線植物,秋茄的耐鹽機制以往一直停留在生理生化水平,而陳教授課題組的研究從通過從基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)多層次上探索和揭示紅樹林秋茄(Kandelia candel)耐鹽機制。
福建農(nóng)林大學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心主任 陳偉教授
 
中科新生命產(chǎn)品部經(jīng)理嚴峻博士帶來題為《組學(xué)技術(shù)梳理與應(yīng)用推薦》的精彩報告。作為國內(nèi)最早的蛋白質(zhì)組分析與服務(wù)平臺,嚴峻博士梳理了15年來平臺實驗技術(shù)發(fā)展歷程,從經(jīng)典的蛋白質(zhì)二維電泳,到同位素標記和非標記蛋白質(zhì)組學(xué),非靶向代謝組、靶向代謝組、脂質(zhì)組學(xué)、多組學(xué)聯(lián)合分析,直到最新的DIA全掃描定量蛋白質(zhì)組分析和質(zhì)譜組學(xué)。從應(yīng)用層面,嚴峻博士描述了多組學(xué)技術(shù)在植物轉(zhuǎn)錄組結(jié)合代謝組或修飾組乃至多組學(xué)聯(lián)合,在臨床領(lǐng)域的標志物篩選或疾病的分型及機理研究,在碳循環(huán)能量代謝中的調(diào)控機理或代謝類型,在神經(jīng)科學(xué)方向的磷酸化組或脂質(zhì)組,以及腸道微生物的多組學(xué)聯(lián)合等領(lǐng)域的深入應(yīng)用。
 
中科新生命產(chǎn)品部經(jīng)理 嚴峻博士

揚州大學(xué)農(nóng)學(xué)院的博士生導(dǎo)師李韜教授在他的題為《轉(zhuǎn)錄和蛋白組學(xué)在小麥抗病遺傳中的應(yīng)用》提出了混池轉(zhuǎn)錄組學(xué)的概念及其在小麥光譜抗性基因定位中的應(yīng)用,該研究綜合應(yīng)用混池轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序(BSR-Seq),SNP芯片以及參考基因組信息,提高圖位克隆的效率,為候選基因的分析和功能研究奠定了基礎(chǔ)。另外,在與被稱為“小麥的癌癥”赤霉病的研究課題中,李教授團隊首次利用組學(xué)技術(shù)應(yīng)用于小麥-赤霉菌相互作用,并利用Label-free技術(shù)篩選小麥抗赤霉病相關(guān)基因。

最后一場報告為重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院精神科主治醫(yī)師周新雨副研究員帶來的《代謝組學(xué)在抑郁癥研究中的應(yīng)用》。抑郁癥是一種嚴重影響公共健康的重大精神疾病,截止到2017年,抑郁障礙已成為全球第一疾病負擔(dān),全球有3.22億患者。抑郁癥診斷與治療存在診斷困難,缺乏客觀指標,機制不明、病因不清,無法尋找新的治療靶點等難點。而新興的代謝組學(xué)是繼基因組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué)之后,從整體的角度,通過研究生物體、器官或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在環(huán)境因素影響及隨時間變化規(guī)律的一門學(xué)科。代謝組學(xué)應(yīng)用在抑郁癥研究方面,主要在于尋找診斷抑郁癥的客觀診斷標志物、尋找抑郁癥治療的新靶點和揭示抑郁癥發(fā)生發(fā)展的生物學(xué)機制。通過構(gòu)建抑郁模式動物的構(gòu)建,并進行成年抑郁癥患者血漿聯(lián)合神經(jīng)遞質(zhì)靶向代謝組研究發(fā)現(xiàn)有四種代謝產(chǎn)物組成的生物標志物組,為疾病的診斷和預(yù)后試驗奠定基礎(chǔ)。
 
 
重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院精神科主治醫(yī)師 周新雨副研究員
相關(guān)公司:上海中科新生命生物科技有限公司
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