賽默飛HRMS1-DIA方案亮相蛋白質(zhì)組學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)！
高通量、高準(zhǔn)確 | 賽默飛HRMS1-DIA方案驚艷亮相臨床蛋白質(zhì)組學(xué)和糖組學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)！
5月26日，CNHUPO|臨床蛋白質(zhì)組學(xué)和糖組學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)于上海勝利閉幕。此次研討會(huì)，諸多蛋白組學(xué)和糖組學(xué)專家闡述了組學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)/臨床研究中的應(yīng)用，為未來(lái)從研究到臨床轉(zhuǎn)化探討了新的思路，開拓了更加廣闊的應(yīng)用前景。
北京生命科學(xué)研究院邵峰院士
報(bào)告題目：Innate immunity to cytosolic LPS：Pyroptosis and beyond
報(bào)告主要內(nèi)容：
大會(huì)由復(fù)旦大學(xué)陸豪杰教授致開幕詞，北京生命科學(xué)研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS：Pyroptosis and beyond”的報(bào)告，明晰了細(xì)胞焦亡與傳統(tǒng)細(xì)胞凋亡的區(qū)別，闡述了分子免疫機(jī)制：Caspase-4/5/11作為胞內(nèi)LPS的受體，識(shí)別LPS的Lipid A部分，進(jìn)而發(fā)生寡聚化而激活。這些細(xì)菌免疫受體活化后，均通過(guò)誘導(dǎo)組裝炎癥小體復(fù)合物進(jìn)而激活膜打孔蛋白GSDMD，誘發(fā)細(xì)胞焦亡。
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院副院長(zhǎng)楊芃原教授
報(bào)告題目：疾病糖蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜
報(bào)告主要內(nèi)容：
從質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展歷史，到質(zhì)譜如何幫助蛋白組學(xué)研究，再到質(zhì)譜技術(shù)未來(lái)向臨床發(fā)展的展望：以MRM為基礎(chǔ)的質(zhì)譜ELISA技術(shù)可以在臨床檢驗(yàn)中逐步部分取代現(xiàn)有傳統(tǒng)ELISA，特別是檢驗(yàn)具有群和網(wǎng)絡(luò)特征的關(guān)鍵蛋白。同時(shí)，運(yùn)用Orbitrap技術(shù)的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。
國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京秦鈞主任
報(bào)告題目：胃癌的臨床蛋白組學(xué)研究
報(bào)告主要內(nèi)容：
從蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用于臨床所面臨的問(wèn)題，到未來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)走向臨床的前景，秦鈞教授通過(guò)一些臨床研究實(shí)例，講述了如何在實(shí)踐中逐步克服臨床生物樣本、檢測(cè)手段等方面的局限性，描繪了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)化臨床的可行性。尤其是惡性腫瘤化療藥物靶點(diǎn)、免疫治療標(biāo)志物、治療響應(yīng)性標(biāo)志物等，有望應(yīng)用于臨床伴隨診斷。無(wú)論是在探索分子病理方面，抑或是實(shí)現(xiàn)臨床早診、治療領(lǐng)域，蛋白質(zhì)組學(xué)都發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用。蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)的精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代（Proteomics-driven precision medicine）已經(jīng)被開啟。
同濟(jì)大學(xué)田志新教授
報(bào)告題目：基于糖蛋白質(zhì)組學(xué)的癌癥和癌癥干細(xì)胞生物標(biāo)志物的分析
報(bào)告主要內(nèi)容：
同濟(jì)大學(xué)田志新教授，做了在肝癌、乳腺癌研究中發(fā)現(xiàn)N-糖蛋白質(zhì)標(biāo)志物的報(bào)告，結(jié)合ZIC-HILIC富集、同位素二甲基標(biāo)記、pentaHILIC-nESI-MS/MS（HCD，stepped NCEs）、GPseeker定性、GPseekerQuan定量，對(duì)HCC HepG2細(xì)胞中差異表達(dá)N-糖基化在完整水平上進(jìn)行大規(guī)模位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)特異性的分離、鑒定和定量。
西湖大學(xué)郭天南教授
西湖大學(xué)的郭天南教授介紹了運(yùn)用DIA技術(shù)結(jié)合PCT快速樣品前處理技術(shù)在臨床大隊(duì)列樣本研究中的應(yīng)用，以及使用Orbitrap技術(shù)平臺(tái)建立人類多個(gè)組織蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，為DIA和PRM分析提供便利。
賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關(guān)注
大會(huì)報(bào)告中賽默飛應(yīng)用經(jīng)理周岳，帶來(lái)HRMS1-DIA技術(shù)在臨床大樣本蛋白質(zhì)組學(xué)分析中的可行性評(píng)價(jià)：
經(jīng)過(guò)來(lái)自9個(gè)國(guó)家和地區(qū)的11個(gè)實(shí)驗(yàn)室，連續(xù)7天24小時(shí)運(yùn)行，基于HRMS1-DIA工作流表現(xiàn)出長(zhǎng)期運(yùn)行中保持極高的穩(wěn)定性，在不同儀器及實(shí)驗(yàn)室間產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也有極佳的重現(xiàn)性以及提供蛋白質(zhì)組學(xué)準(zhǔn)確定量結(jié)果。HRMS1-DIA工作流可對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究中的大隊(duì)列生物樣品進(jìn)行高通量和深度的蛋白質(zhì)組定量。
HRMS1-DIA方案優(yōu)勢(shì)：
1、相對(duì)傳統(tǒng)DIA的二級(jí)碎片離子定量，基于超高分辨一級(jí)全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數(shù)量和準(zhǔn)確性都有顯著提高（蛋白鑒定數(shù)目提高10%，CV<10%）
2、在HRMS1-DIA工作流正常運(yùn)行的狀態(tài)下，全部11個(gè)實(shí)驗(yàn)室，平均可以鑒定到超過(guò)8000個(gè)蛋白（1% protein FDR），定量超過(guò)6000個(gè)蛋白。
3、在定量準(zhǔn)確性方面，在1小時(shí)定量6000個(gè)蛋白，50000個(gè)肽段的超高通量下，HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準(zhǔn)確性。
4、超高80%的蛋白可以在每天、每個(gè)實(shí)驗(yàn)室定量。
賽默飛HRMS1-DIA方案對(duì)于蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床轉(zhuǎn)化具有極為廣泛的參考價(jià)值，超高的穩(wěn)定性、日間重復(fù)性成為臨床研究領(lǐng)域用戶最值得期待的技術(shù)。
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