單細胞轉(zhuǎn)錄組測序及生信分析培訓班報名通知

瀏覽次數(shù)：5726　發(fā)布日期：2019-5-23　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

單細胞測序技術(shù)近年屢次被評為生物科研熱點，文獻發(fā)表也呈現(xiàn)迅猛增長趨勢。Nature期刊最近評出2019年最值得期待的7項生物技術(shù)，擴展單細胞生物學（Expand single-cell biology）位列其中之一。SBC引進的10x Genomics Chromium™平臺，基于GemCode™微流控技術(shù)進行單個細胞分選，可一次性獲得大量單細胞的基因表達數(shù)據(jù)，從而達到在單細胞水平進行表達測序的目的。

為幫助科研工作者深入了解單細胞測序技術(shù)，SBC茲定于2019年6月28-29日在上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心舉辦單細胞轉(zhuǎn)錄組測序及生信分析培訓班。希望通過此次培訓讓學員全面了解單細胞測序技術(shù)的實驗原理、應用，并上機模擬操作Demo數(shù)據(jù)的生信分析等。誠邀報名參加，本次培訓班實行小班制（限額20人，報滿截止）。

主辦單位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心

培訓日期：2019年6月28日-29日
培訓地點：上海市浦東新區(qū)張江高科技園區(qū)李冰路151號1號樓

一、日程安排：

時間	主題	課程內(nèi)容
6月28日	單細胞測序技術(shù)介紹	單細胞測序技術(shù)的發(fā)展及10Xgenomic單細胞測序原理介紹
	樣本準備	單細胞樣本準備及常見問題
	樣本準備	Demo實驗
	R語言基礎	R基本概念：向量、數(shù)組和矩陣、函數(shù)；R從文件讀取數(shù)據(jù)、根據(jù)需要編輯、轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)；文件圖表等的生成導出
	10X單細胞轉(zhuǎn)錄組分析流程及原理介紹	Cellranger運行環(huán)境、服務器配置，如何從fastq生成表達矩陣等系列結(jié)果；Seurat的使用、算法解析等
	10X單細胞轉(zhuǎn)錄組分析上機操作	在R交互環(huán)境運行Seurat、向量準備、畫圖函數(shù)使用、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)解剖處理等；R畫圖包括PCA、tSNE、VlnPlot、PCHeatmap等
6月29日	單細胞轉(zhuǎn)錄組結(jié)果報告解讀	單細胞轉(zhuǎn)錄組結(jié)果報告解讀
	10X單細胞ATAC-seq分析流程及原理介紹	cellranger-atac運行、運行過程中使用算法介紹及結(jié)果解讀
	10X單細胞ATAC-seq分析上機操作	Loupe Cell Browser軟件運行、ChIPseeker對peaks結(jié)果注釋、Cicero介紹
	單細胞高級分析	Monocle的原理算法介紹；高分文章案例數(shù)據(jù)集作圖：擬時序、譜系分析等
	單細胞測序技術(shù)的應用與實驗設計思路解析	單細胞測序技術(shù)的應用與實驗設計思路解析