今年5月,比利時 Diagenode 公司 Bioruptor Pico 核酸剪切儀試用活動再傳捷報,本次試用單位上海伯豪生物使用Bioruptor Pico 進(jìn)行了多項實驗均獲得了品質(zhì)優(yōu)良的樣品,實驗效果理想。
試用日期:2017年5月
試用單位:上海伯豪生物
試用詳情:
Sample volume: 100 µl
Tubes: 0.65 ml Bioruptor® Microtubes (Cat. No. C30010013)
Tube holder: 0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes
DNA concentration: 0.1-10 ng/µl
Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0
Target size:150-1000bp
Sonication cycles: 按照廠家參考循環(huán)數(shù)
儀器已經(jīng)預(yù)冷,陳老師準(zhǔn)備樣品
結(jié)果分析:
DNA concentration: 1ng/µl
Target size:150bp
Sonication cycles: 30 cycles (30 sec ON/OFF)
試用結(jié)果:樣品品質(zhì)良好,超聲效果理想。三個樣品由于實際濃度有差別,所以波峰有高低?傮w上波峰稍稍拖后。Pico儀器是市面上唯一一款60KHz的超聲波破碎儀,片段極限在70bp。熟悉DNA打斷實驗的都知道,目的片段越小、濃度越高越難處理。之前在新培晶試用時,由于濃度太高(50 ng/µl),導(dǎo)致超聲時間過長,效果一般。鏈接:http://www.boyibio.cn/news/html/?89.html
DNA concentration: 紅1 ng/µl和藍(lán)20ng/ul兩個樣品
Target size:250bp
Sonication cycles: 8 cycles (30 sec ON/90 sec OFF)
試用結(jié)果:樣品品質(zhì)良好,超聲效果理想。廠家推薦濃度是(1-20ng/ul),在此范圍內(nèi)超聲效果基本上是不變的。
DNA concentration: 2ng/µl
Target size:300bp
Sonication cycles: 6 cycles (30 sec ON/OFF)
試用結(jié)果:樣品品質(zhì)良好,超聲效果理想。
DNA concentration: 紅2ng/µl(有誤),藍(lán)10ng/µl,綠2ng/µl,青0.2ng/µl
Target size:400bp
Sonication cycles: 6 cycles (15 sec ON/90sec OFF)
試用結(jié)果:樣品品質(zhì)良好,超聲效果理想。濃度方面應(yīng)該有誤,不影響分析,總的來說,超聲重復(fù)性理想,青0.2ng/µl濃度太低沒有檢測到。
DNA concentration: 紅1ng/µl,藍(lán)9ng/µl
Target size:1000bp
Sonication cycles: 8 cycles (5sec ON/90sec OFF)
試用結(jié)果:樣品品質(zhì)良好,超聲效果理想。波峰明顯小于1kb,超聲循環(huán)數(shù)需要減少1-2個循環(huán)。