“DNA甲基化與表觀遺傳數(shù)據(jù)分析”培訓(xùn)報(bào)名通知
瀏覽次數(shù):5352 發(fā)布日期:2017-4-28
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關(guān)于舉辦“DNA甲基化與表觀遺傳數(shù)據(jù)分析”培訓(xùn)的通知
各有關(guān)單位:
表觀遺傳學(xué)是研究基因在核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因表達(dá)可遺傳變化的一門遺傳學(xué)分支學(xué)科。目前,已知的表觀遺傳現(xiàn)象有DNA甲基化基因組印記母體效基因沉默RNA編輯等。DNA(主要是CpG的)甲基化是其遺傳機(jī)制和表型效應(yīng)最為明確的表觀遺傳性機(jī)制。表觀遺傳學(xué)的研究已成為基因組測(cè)序后的人類基因組重大研究方向之一。這一飛速發(fā)展的科學(xué)領(lǐng)域從分子水平揭示了復(fù)雜的生物學(xué)現(xiàn)象,為解開人類和其他生物的生命奧秘、造福人類健康帶來了新希望。為了提高從業(yè)人員的技術(shù)水平,應(yīng)廣大行業(yè)工作者的要求,中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)和中國(guó)科學(xué)院微生物研究所網(wǎng)絡(luò)信息中心聯(lián)合舉辦“生物信息最新技術(shù)--DNA甲基化與表觀遺傳數(shù)據(jù)分析,由北京中科潤(rùn)開生物科技有限公司具體承辦。培訓(xùn)班采用理論和演示相結(jié)合的教學(xué)形式,同時(shí)學(xué)員與授課專家進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)交流與咨詢,探討學(xué)員在平時(shí)工作、研究中的瓶頸問題。與同行交流以拓寬自己的研究思路,共同探討和挖掘表觀遺傳學(xué)資源的科學(xué)研究?jī)r(jià)值和應(yīng)用前景。
一、培訓(xùn)特色:
主題明確,針對(duì)性強(qiáng),理論和實(shí)踐結(jié)合,主講與學(xué)員研討的方式進(jìn)行
講師擁有豐富的微生物數(shù)據(jù)分析和項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)
課下主講老師為您所遇到的問題提供個(gè)性化解答
配合研究中所需的要點(diǎn),圍繞實(shí)際研究中常用的軟件展開;
學(xué)員通過與專家直接交流,能夠分享到頂尖學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究經(jīng)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路。
二、培訓(xùn)對(duì)象:
大中專院校生物信息、生物計(jì)算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)對(duì)生物信息有一定了解的
在校教師,研究生、博士生及科研單位從事該領(lǐng)域的研究人員
三、時(shí)間地點(diǎn):2017年5月19日——5月23日 中科院微生物研究所
(時(shí)間安排:第1天報(bào)到,授課4天)
四、培訓(xùn)內(nèi)容
一、表觀遺傳學(xué)研究現(xiàn)狀及未來發(fā)展
二、表觀遺傳學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)介紹與使用
三、高通量測(cè)序技術(shù)概述
四、常用生物數(shù)據(jù)文件類型介紹與格式轉(zhuǎn)換
五、代測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控、比對(duì)分析與可視化
六、常用在線工具和數(shù)據(jù)庫(kù)使用操作 |
一、DNA甲基化原理、應(yīng)用及研究方法、微生物基因組
1甲基化特異性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)
2亞硫酸氫鹽測(cè)序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)
3 高分辨率熔解曲線法(High Resolution Melting,HRM)
4.比較各項(xiàng)甲基化研究方法存在的優(yōu)缺點(diǎn)等
二、DNA甲基化數(shù)據(jù)分析策略
1 WGBS分析:利用fastqc和perl腳本對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控
2 之后用bismark進(jìn)行mapping和beta值計(jì)算
3 R的methylKit包篩選差異甲基化位點(diǎn)并用pheatmap包和ggplot2包進(jìn)行可視化
4 PeakAnnotator對(duì) 這些位點(diǎn)進(jìn)行功能域和基因注釋,最后用DAVID進(jìn)行GO和 KEGG通路注釋
DNA甲基化調(diào)控案例講解
DNA甲基化測(cè)序數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)戰(zhàn)
三、DNA甲基化芯片數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)戰(zhàn)
1芯片DNA甲基化分析
2利用R的IMA包進(jìn)行差異甲基化位點(diǎn)鑒定并用pheatmap包和ggplot2包進(jìn)行可視化,用DAVID進(jìn)行GO和KEGG通路注釋 |
一、染色質(zhì)可及性測(cè)序技術(shù)
二、組蛋白修飾原理與分子功能
三、組蛋白修飾功能
四、核小體定位圖譜分析實(shí)戰(zhàn)練習(xí)
五、組蛋白修飾數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)練習(xí)一
六、組蛋白修飾數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)練習(xí)二 |
一、還原真實(shí)染色,質(zhì)構(gòu)象--HiC技術(shù)
二、TCGA與ICGC,數(shù)據(jù)庫(kù)介紹與使用
三、干細(xì)胞的表觀遺傳學(xué)研究
四、轉(zhuǎn)錄因子ChIP-seq數(shù)據(jù)分析
五、生存曲線分析 |
五、主講專家:
主講專家來自中科院等科研機(jī)構(gòu)的高級(jí)專家,擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗(yàn),長(zhǎng)期從事生物信息領(lǐng)域項(xiàng)目研究,具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專業(yè)背景。
六、頒發(fā)證書:
學(xué)員經(jīng)培訓(xùn)考試合格后可以獲得:
由中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)頒發(fā)的《生物信息工程師》培訓(xùn)證書。
注:請(qǐng)學(xué)員帶兩寸彩照2張(背面注明姓名)、身份證復(fù)印件一張。
七、報(bào)名辦法及費(fèi)用:
每人¥4500元(含報(bào)名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)等相關(guān)費(fèi)用),食宿可統(tǒng)一安排,費(fèi)用自理。請(qǐng)各有關(guān)部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報(bào)名參加培訓(xùn),各單位也可直接報(bào)名參加,報(bào)名回執(zhí)表請(qǐng)郵件發(fā)送至?xí)⻊?wù)處。
八、聯(lián)系方式:
監(jiān)督電話:010-64807385-8012 (中國(guó)科學(xué)院微生物所網(wǎng)絡(luò)信息中心)