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專訪:澤泉國際頂尖植物科研服務(wù)平臺AgriPheno

瀏覽次數(shù):23548 發(fā)布日期:2016-4-26  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

導(dǎo)讀:上海澤泉科技股份有限公司,是一家專注于為植物科學(xué)領(lǐng)域提供高端科研設(shè)備、技術(shù)和服務(wù)的高新企業(yè)。自2000年成立以來,公司秉承農(nóng)業(yè)興國、推進(jìn)改善中國生態(tài)環(huán)境的理念,先后為科技部“973”“863”、農(nóng)業(yè)部“948”、水利部“948”等多個國家重點項目提供技術(shù)設(shè)備的支持和服務(wù)。十幾年以來,澤泉科技憑借其先進(jìn)的技術(shù)、高端的儀器設(shè)備等服務(wù),已發(fā)展成為國內(nèi)領(lǐng)先的植物科研服務(wù)供應(yīng)商,但這些驕人的成績并沒有讓澤泉止步不前。20143月,為更好地服務(wù)和推動國內(nèi)植物科學(xué)研究領(lǐng)域的發(fā)展,澤泉在孫橋農(nóng)業(yè)園區(qū)投資建設(shè)了國內(nèi)第一家開放式高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺——AgriPhenoTM。近日,小編終于有幸,隨澤泉科技總經(jīng)理顧群一起,目睹了AgriPhenoTM平臺的芳容。

澤泉AgriPheno™平臺正門

偉壯觀的AgriPhenoTM平臺

412日早晨,細(xì)雨蒙蒙,小編一行驅(qū)車來到了位于上海浦東的孫橋現(xiàn)代農(nóng)業(yè)園區(qū)。剛進(jìn)園區(qū)大門,帶有“AgriPhenoTM”的指示牌便躍入眼簾,順著指示,我們很快來到了此行的目的地——澤泉科技AgriPhenoTM平臺。初見平臺,我便被它深深地吸引。它安靜美麗,在春雨的映襯下,宛若江南雨巷中的少女般,楚楚動人。推門而入,來到平臺內(nèi)部,才發(fā)現(xiàn)原來這里別有洞天。寬敞的走廊兩旁,矗立著一間間高大宏偉的玻璃溫室,透過干凈明亮的玻璃窗,放眼望去,一排排平臺設(shè)施,干凈整齊地陳列于室內(nèi),沒有絲毫的雜亂。平臺工作人員向我們介紹到,眼前的荷蘭現(xiàn)代化溫室、智能化人工氣候室以及加拿大CONVIRON大型步入式培養(yǎng)箱共占地面積4400m2,可以充分滿足客戶樣品栽培所需的各種條件,溫室旁邊還配套有400m2分子生物學(xué)實驗室,用以支撐和保證平臺的科研分析工作。 

  

AgriPheno™平臺溫室

我們從顧群總經(jīng)理處了解到,AgriPheno™平臺于20143月開始建設(shè),總投資8000萬元,是亞洲第一個、全球第四個開放式高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺。AgriPheno™擁有先進(jìn)的德國LemnaTec高通量Scanalyzer 3D、HTS、PL植物表型平臺、植物生理生態(tài)測量平臺、荷蘭Priva溫室精準(zhǔn)灌溉系統(tǒng)和專業(yè)的數(shù)據(jù)庫平臺,以提供植物生長、生理生態(tài)、基因型與表型的全面分析服務(wù)。平臺服務(wù)范圍涵蓋表型服務(wù)、基因型服務(wù)及生理生態(tài)測量,遍及突變株篩選、株型育種、種子純度鑒定、數(shù)量性狀基因挖掘、植物研究等多達(dá)15個領(lǐng)域。

      
            
便攜式植物表型平臺——KeyBox                                       植物培養(yǎng)平臺


植物基因型 - 表型 - 育種平臺——AgriPhenoTM

國際領(lǐng)先的植物表型分析系統(tǒng)

從人工氣候室出來,我們跟隨工作人員來到了澤泉植物表型分析系統(tǒng)平臺。表型分析一直是植物科學(xué)研究中的一個重要環(huán)節(jié),為滿足國內(nèi)科研用戶的需求,澤泉科技特引進(jìn)了德國著名植物表型設(shè)備制造商LemnaTec公司的Scanalyzer植物表型系列設(shè)備。據(jù)悉,該系列產(chǎn)品包括基礎(chǔ)型植物表型成像系統(tǒng)、實驗室高通量型植物表型平臺、溫室型高通量3D植物表型平臺和野外型高通量植物表型平臺,測定范圍全面,包括植株幼苗、小型植株、大型植株和田間植株,是植物表型篩選、遺傳育種、植物生理等領(lǐng)域研究的強(qiáng)大助手。下面,小編就帶領(lǐng)大家一起領(lǐng)略下這些高大上平臺的英姿!

 基礎(chǔ)型植物成像系統(tǒng)——Scanalyzer PL      

Scanalyzer PLScanalyzer系列中最簡單的一個版本,鏡頭只能選擇可見光(VIS)、近紅外(NIR)、紅外(IR)或熒光成像中的一種,攝像頭固定,沒有傳送裝置,必須手工更換樣品,因此不能對植物進(jìn)行高通量成像,且只能測量較小的樣品。不過,你可不要因此就小看了它,因為它的分析軟件與可以進(jìn)行高通量測量的HTS3D系統(tǒng)的軟件完全相同,分析功能非常強(qiáng)大,幾乎超過了目前市場上的所有圖像分析軟件。如果你的研究對象是擬南芥、植物的種子、小型動物等小型實驗材料,那么它絕對是你的最佳選擇!

              

基礎(chǔ)型植物表型成像系統(tǒng)——Scanalyzer PL


實驗室型高通量植物表型平臺——Scanalyzer HTS
Scanalyzer PL相比,Scanalyzer HTS擺脫了手工操作、低通量等操作缺點,它是一套能全自動、高通量對大量小植株進(jìn)行成像的系統(tǒng)。此外在成像選擇上,它也靈活得多,可選擇配置可見光(VIS)成像、近紅外(NIR)成像、紅外(IR)成像、熒光成像或激光掃描3D成像(只適合高度15 cm以下的小植株)中的一種甚至多種。成像系統(tǒng)帶程控移動裝置,可以在X軸和Y軸上進(jìn)行移動,并配有射頻或條形碼讀取器。系統(tǒng)通過軟件控制攝像頭移動到樣品上方(多孔板或小盆)進(jìn)行拍照,照片數(shù)據(jù)與該樣品的電子標(biāo)記(射頻或條形碼)一起存儲。軟件也可控制攝像頭對多孔板上的每個孔進(jìn)行單獨(dú)成像,每個孔的數(shù)據(jù)分布存儲(設(shè)置軟件多孔板類型,然后自動編碼,如A01、A02……),操作十分方便。如果你需要對小型實驗材料進(jìn)行高通量成像分析或需要激光掃描3D成像,那么HTS應(yīng)屬你的不二選擇。



實驗室型高通量植物表型平臺Scanalyzer HTS

溫室型高通量植物表型平臺——Scanalyzer 3D

前面的PLHTS都是針對小型植物進(jìn)行分析的,而Scanalyzer 3D則是一套全自動、可對大量植株進(jìn)行高通量成像的系統(tǒng)。同HTS一樣,它的成像系統(tǒng)光譜選擇也比較廣泛,可以選擇配置可見光(VIS)成像、近紅外(NIR)成像、紅外(IR)成像、熒光成像或根系近紅外成像中的一種或多種,每個成像模塊包括頂部和側(cè)面兩個攝像頭,結(jié)合樣品旋轉(zhuǎn)裝置,可以對植株進(jìn)行3D形態(tài)學(xué)分析。同時,對于15 cm以下的小植株,也可選配激光掃描3D成像。每一種成像模塊都有單獨(dú)的成像區(qū)域(暗房),依次進(jìn)行成像分析。如果你需要對從幼苗到成熟植株各個階段的大量植株進(jìn)行3D成像分析,那么Scanalyzer 3D絕對是你的心意之選。

                   

       小型版 只能自動傳送 10 盆植物,需手動更換花盆       大型定制版(溫室版) 可自動傳送數(shù)百盆植物的系統(tǒng)

野外型高通量植物表型平臺——Field Scanalyzer(在建)
Field Scanalyzer是田間掃描分析儀,它是全球第一套野外型高通量植物表型平臺,該平臺已于201577日,在英國洛桑研究所正式投入運(yùn)行。上海澤泉科技股份有限公司作為LemnaTec在中國區(qū)的戰(zhàn)略合作伙伴,也引進(jìn)了該套設(shè)備。目前該設(shè)備正在籌建中,預(yù)計2016年底可投入運(yùn)行。


野外型高通量植物表型平臺Field Scanalyzer

Field Scanalyzer是迄今為止世界上最大和最為復(fù)雜的對作物生長狀況進(jìn)行自動化監(jiān)測的設(shè)備,該設(shè)備由一個門架裝備多個傳感器的機(jī)動測量平臺構(gòu)成,可對10×110米范圍內(nèi)的作物以高分辨率和再現(xiàn)性進(jìn)行全年24小時自動化監(jiān)視。儀器所載的照明裝置能使數(shù)據(jù)的搜集更便利,傳感器包括多波長成像系統(tǒng)、葉綠素?zé)晒馑プ儎恿W(xué)成像傳感器和三維可視化以及作物高度測定的激光系統(tǒng)。這些傳感器將共同精準(zhǔn)地監(jiān)視作物生理、植物架構(gòu)、作物健康和植物功能,成為糧食安全和可持續(xù)發(fā)展項目的有力助手。

全方位開放式的一體化服務(wù)

20153月,澤泉科技的全方位開放式科研服務(wù)平臺AgriPhenoTM已正式投入應(yīng)用。作為上海張江國家自主創(chuàng)新示范區(qū)專項發(fā)展資金重點項目,自正式投入運(yùn)營以來,平臺先后參與了科技興農(nóng)種業(yè)發(fā)展項目農(nóng)作物分子育種的技術(shù)創(chuàng)新研究小青菜高通量表型圖譜標(biāo)準(zhǔn)的建立及主要性狀分析、科技興農(nóng)重點攻關(guān)項目基于圖像分析及三維建模技術(shù)的黃瓜長勢快速評價方法研究等多個上海市農(nóng)委的科研項目,與上海交通大學(xué)、中科院上海植生所、上海農(nóng)科院、上海師范大學(xué)等科研院所均有合作,并取得了用戶的好評。

(部分項目實驗圖)
     
  
          可見光成像分析擬南芥葉片表面農(nóng)藥殘留                      3D可見光成像分析玉米植株骨架及葉傾角

我們不僅可幫用戶測量分析實驗數(shù)據(jù),還可提供植物栽培-測前實驗分析-表型數(shù)據(jù)測量-數(shù)據(jù)分析的一條龍服務(wù)。我們的AgriPhenoTM是一個完全開放的平臺,如果客戶需要,也可利用我們的溫室平臺,自行設(shè)計開展實驗工作。顧群總經(jīng)理在介紹平臺時如是說。


植物基因型 - 表型 - 育種平臺運(yùn)轉(zhuǎn)流程圖

科學(xué)研究的道路是漫長而艱辛的,由于實驗設(shè)備等硬件條件的限制,使得大量重復(fù)的勞動工作占用了很多寶貴的科研時間,嚴(yán)重阻礙實驗進(jìn)程。希望開放式平臺AgriPhenoTM能夠真正幫助科研工作者掃除前進(jìn)道路上的一些障礙,推動我國植物科學(xué)的研究進(jìn)展。

傳承科研文化的企業(yè)夢想
談及公司的未來,顧總目光堅定地說道:“由于受到科研經(jīng)費(fèi)、人員配置數(shù)量、數(shù)據(jù)分析等因素的限制,使得國內(nèi)植物科學(xué)的發(fā)展嚴(yán)重受阻。雖然我們做的是植物和農(nóng)業(yè)相結(jié)合的最基礎(chǔ)的研究,短期內(nèi)不可能產(chǎn)生效益,但我還是會繼續(xù)做,因為一個國家一定要有一些人來做這些事情!”隨后的交談中,顧總表示,在未來,除了服務(wù)大學(xué)、研究所等科研單位外,澤泉也會投入資金在與農(nóng)業(yè)相關(guān)的科學(xué)研究中。希望澤泉在為國內(nèi)植物科學(xué)和農(nóng)業(yè)研究服務(wù)的同時,可以通過自己的不斷創(chuàng)新,持續(xù)積累,發(fā)展成為一個能夠傳承中國科研文化的企業(yè)!

人因夢想而偉大,企業(yè)因文化而繁榮。我相信,一個擁有遠(yuǎn)見卓識、胸懷國家科學(xué)事業(yè)發(fā)展的領(lǐng)導(dǎo)所帶領(lǐng)的企業(yè),必定會越來越輝煌。



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