高通量測序技術(shù),又稱第二代測序技術(shù)(Next Generation Sequencing),使科學(xué)家可在一次實驗中對多個樣本進行多個基因的測序,并已成為現(xiàn)今遺傳基因研究領(lǐng)域中主流的實驗手段,對DNA和RNA樣本提供一個強大的檢測工具。在過去幾年,NGS技術(shù)不斷發(fā)展和改進以增加通量和降低成本。試劑廠家羅氏NimbleGen研發(fā)了SeqCapEZ目標序列捕獲試劑系列,它可以集中豐富人類核酸內(nèi)的所有外顯子組或特定的基因片段,以減省分析數(shù)據(jù)時間和提高實驗效率。然而,這種目標序列捕獲和富集的手段往往需要大量秏時和費勁的樣本建庫預(yù)備,一般來說需要一位經(jīng)驗豐富的技術(shù)人員花上最少4天去完成48個樣本建庫。由于二代測序?qū)颖居泻芨叩囊,建庫過程中需要有經(jīng)驗技術(shù)員高度專注去操作,包括建庫過程中樣本和試劑溫度的控制,孵育時間等等,稍有差池也會影響測序給果。 | |||
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經(jīng)過優(yōu)化后,ACSIA工作站很完美地利用羅氏SeqCapEZ捕獲建庫試劑把整個二代測序的建庫過程自動化,與人手相比,ACSIA自動化平臺省卻了4小時的建庫時間,而且,在Smart Tip的功能下,所使用的槍頭比人手少了3倍,由原來的9盒槍頭減至3盒。在二代測序結(jié)果方面,ACSIA比人手操作帶來更穩(wěn)定和更好的測序效果。ㄒ娤聢D) | |||
二代測序檢測中,ACSIA(藍色)和人手(紅色)預(yù)備樣本中的18個基因組檢測覆蓋深度 | |||
ACSIA多功能工作站是全面的開放式平臺,系統(tǒng)已內(nèi)置對各大試劑盒的優(yōu)化程序,如Illumina、Roche、Aligent、Kapa Biosystems,等。除了二代測序樣本制備外,ACSIA還可能進行移液分液、核酸提取及純化、PCR樣品制備、質(zhì)譜樣本前處理、單針挑樣等實驗,實在是一臺多功能的自動化平臺! | |||
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