上海市生物信息學(xué)會（Shanghai Society for Bioinformatics，縮寫SSBI）成立于2005年6月，是上海市科學(xué)技術(shù)協(xié)會下屬的地方性學(xué)術(shù)團體，依托單位為上海生物信息技術(shù)研究中心。

 

上海生物信息技術(shù)研究中心在系統(tǒng)建模、定量組學(xué)數(shù)據(jù)獲取、分析、數(shù)據(jù)整合及其相互作用網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)平臺建設(shè)方面取得了一系列國內(nèi)外矚目的研究成果。在此基礎(chǔ)上，近年來又建立了新一代測序技術(shù)平臺，以及依托Thermo Q Exactive、AB QTRAP 4000等儀器的質(zhì)譜技術(shù)平臺，能夠開展基因組、甲基化組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組等不同層次的一站式高通量檢測及數(shù)據(jù)分析。

 

上海市藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心成立于2014年，致力于發(fā)展高效、低毒、個性化腫瘤治療方案和藥物研發(fā)技術(shù)體系，推動轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的發(fā)展。

 

主辦單位：上海市生物信息學(xué)會

協(xié)辦單位：上海藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心 上海生物信息技術(shù)研究中心 蘇州貝斯派生物科技有限公司 上海麥其知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所

 

會議地點：上海浦東新區(qū)科苑路1300號浦東國際人才城2樓智音廳（曙光醫(yī)院對面）

 

開班時間：11月12日（周四）-11月14日（周六）

 

 

日期	課程名稱	課程內(nèi)容	時間
11月12日 （星期四）	報道-開班儀式	生物信息中心介紹	8:30-9:00
	蛋白質(zhì)組學(xué)實驗設(shè)計及數(shù)據(jù)分析	蛋白質(zhì)組學(xué)—樣本處理和實驗方法 蛋白質(zhì)組學(xué)的方法和進展 蛋白質(zhì)組學(xué)—搜庫及差異蛋白篩選 （Maxquant上機操作）	9:00-12:00
	代謝組學(xué)實驗設(shè)計及數(shù)據(jù)分析	代謝組學(xué)實驗設(shè)計及樣本處理 代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理－多維統(tǒng)計分析（SIMCA-P上機操作）	13:30-17:00
11月13日 （星期五）	轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析	有referecnce轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 無reference轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 轉(zhuǎn)錄組高級數(shù)據(jù)分析（聚類、網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建等）	9:00-12:00
	蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析	蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測與變異分析 分子對接與虛擬篩選	13:30-15:00
	多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析	多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析案例	15:45-16:30
	參觀、合影	參觀上海生物信息技術(shù)研究中心	16:30-17:00
11月14日 （星期六）	組學(xué)分析常用軟件上機練習(xí)	GO和KEGG注釋分析,熱圖繪制與聚類分析、ROC分析等常用方法Cytoscape、Mev、 HemI、STRING、DAVID、KOBAS等軟件使用	9:00-12:00
	科研工作中的專利挖掘和專利保護		13:30-16:00

注：1.課程具體安排以報名當(dāng)天的課程表為準；

2.因需上機練習(xí)，請自帶筆記本電腦，默認是windows系統(tǒng)，若安裝的是linux或蘋果iOS請自行下載上機軟件。

 

1.      吳謙博士，副研究員，上海生物信息技術(shù)研究中心質(zhì)譜實驗室負責(zé)人。本科、碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系，博士畢業(yè)于上海交通大學(xué)藥學(xué)院。從事質(zhì)譜研究與開發(fā)十余年，曾在某知名上市藥企從事新藥研發(fā)工作，參與十余個一類新藥項目及部分重組蛋白藥物研發(fā)。主要研究方向為蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及質(zhì)譜定量分析新方法開發(fā)，發(fā)表論文10余篇，在基于LC-MS技術(shù)的代謝組學(xué)特別是脂質(zhì)組學(xué)檢測實驗與分析方面具有豐富經(jīng)驗。

 

2.      庫鑫博士，上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院講師。本科畢業(yè)于華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院，碩士畢業(yè)于中科院上海藥物研究所，博士畢業(yè)于德國慕尼黑工業(yè)大學(xué)（Technische Universität München）生物分析與蛋白質(zhì)組學(xué)研究所（Prof. Bernhard Kuster）。長期從事腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)的相關(guān)研究，在國際期刊上發(fā)表過多篇相關(guān)論文。目前研究方向為腫瘤相關(guān)生物標志物的發(fā)現(xiàn)和蛋白質(zhì)糖基化修飾。

 

3.      李君一博士，中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院系統(tǒng)生物學(xué)國家重點實驗室博士后。本科畢業(yè)于北京大學(xué)物理學(xué)院，碩士畢業(yè)于美國新澤西州立羅格斯大學(xué)統(tǒng)計學(xué)系，博士畢業(yè)于羅格斯大學(xué)生物物理專業(yè)。隨后在羅格斯大學(xué)進行生物信息學(xué)博士后研究。2013年起在中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院系統(tǒng)生物學(xué)國家重點實驗室繼續(xù)生物信息學(xué)博士后工作。研究方向為運用統(tǒng)計算法及數(shù)理模型，從高通量數(shù)據(jù)出發(fā)，解決遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)問題。近幾年專注于復(fù)雜疾�。ㄈ绨┌Y、糖尿病等）相關(guān)的高通量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析。

 

4.      戴文韜博士，上海生物信息技術(shù)研究中心轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)平臺生物信息負責(zé)人。本科畢業(yè)于華東師范大學(xué)生命科學(xué)院，博士畢業(yè)于中科院生物物理所。從事生物信息學(xué)研究多年，利用數(shù)據(jù)挖掘和機器學(xué)習(xí)方法從事生物大分子模擬分析，組學(xué)數(shù)據(jù)分析挖掘等工作。發(fā)展了進行蛋白結(jié)構(gòu)模型質(zhì)量評估和蛋白相互作用界面預(yù)測的算法，開發(fā)了在國內(nèi)處于最高精度的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測服務(wù)器。

 

5.      董紅曼律師，專利代理人，上海麥其知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所的創(chuàng)始合伙人。本科、碩士畢業(yè)于華東師范大學(xué)生物化學(xué)專業(yè)，同時獲上海交通大學(xué)法律碩士。國際保護知識產(chǎn)權(quán)協(xié)會、國際商標協(xié)會、全國專利代理人協(xié)會、技術(shù)經(jīng)紀協(xié)會會員。執(zhí)業(yè)領(lǐng)域以知識產(chǎn)權(quán)法律為主，為海內(nèi)外企業(yè)提供中國及外國的專利商標事務(wù)，包括申請、復(fù)審、無效、異議、維權(quán)訴訟，以及商業(yè)并購中的技術(shù)轉(zhuǎn)讓許可等法律事務(wù)。

 

6.      李園園博士，研究員，上海生物信息技術(shù)研究中心系統(tǒng)生物學(xué)課題組長，上海生物醫(yī)學(xué)研究院生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化應(yīng)用中心副主任，上海藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心執(zhí)行主任，上海生物信息學(xué)會理事。本科畢業(yè)于南開大學(xué)，碩士畢業(yè)于協(xié)和醫(yī)科大學(xué)腫瘤研究所，博士畢業(yè)于中科院上海生化細胞所。研究方向為生物信息學(xué)，系統(tǒng)生物學(xué)，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。在PLoS Computational Biology、Bioinformatics、Molecular Systems Biology等國際權(quán)威專業(yè)期刊上發(fā)表論文50余篇，其中第一或通訊作者30余篇。獲軟件著作權(quán)7項，發(fā)明專利授權(quán)3項。擔(dān)任國家自然科學(xué)基金評審專家，任PLoS Computational Biology、PLoS ONE、BMC Systems Biology、BMC Bioinformatics、BMC Genomics、Gene、中國科學(xué)等10余家專業(yè)期刊審稿人。作為項目負責(zé)人承擔(dān)多項國家自然科學(xué)基金面上項目、973項目、863項目、上海市科委重大項目等。2006年上海市科技啟明星。2013年明治生命科學(xué)獎。

 

三、費用：

會議費用：3500元/人

在校學(xué)生持學(xué)生證： 3000元/人

說明：以上費用含證書（上海生物信息學(xué)會頒發(fā)）、材料、稅金、午餐、茶點

 

如您計劃參加，可以登錄上海生物信息技術(shù)研究中心網(wǎng)站（）查看詳細內(nèi)容或登錄科學(xué)網(wǎng)、丁香園等網(wǎng)址查詢或聯(lián)系當(dāng)?shù)嘏嘤?xùn)負責(zé)人。