羅氏NimbleDesign序列捕獲定制設(shè)計(jì)軟件上線

瀏覽次數(shù)：2747　發(fā)布日期：2013-7-17　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

NimbleDesign是羅氏NimbleGen推出的免費(fèi)在線軟件，用于NimbleGenSeqCap EZ Choice以及Choice XL人類基因組目標(biāo)區(qū)域的定向捕獲探針設(shè)計(jì)�，F(xiàn)在您只需用一分鐘注冊您的賬戶，就可以享受到NimbleGen專有的探針?biāo)惴ㄋ鶐淼母呙芏�、高覆蓋、高效率的探針設(shè)計(jì)，從而開始您感興趣的目標(biāo)區(qū)域定向富集，以及后續(xù)更多的二代測序應(yīng)用。

從www.nimblegen.com（左圖）即可進(jìn)入NimbleDesign頁面，或者直接進(jìn)入design.nimblegen.com（右圖），注冊時(shí)需選擇China區(qū)域。

NimbleGenSeqCap EZ Library系列序列捕獲產(chǎn)品的探針設(shè)計(jì)擁有其獨(dú)特的優(yōu)勢，以每次捕獲設(shè)計(jì)擁有多達(dá)200萬個(gè)探針、探針采用在目標(biāo)區(qū)域的高密度疊式排布而著稱，保證了在捕獲過程中對于包括片段插入缺失等各種類型突變的有效捕獲。這些特點(diǎn)不僅來自于來自于探針設(shè)計(jì)時(shí)所采用的算法。NimbleGen建立了特殊的探針設(shè)計(jì)算法，使得NimbleGen的高密度探針生產(chǎn)工藝可以更好地應(yīng)用到序列捕獲之中。而且NimbleGen優(yōu)化了repeat mask算法，使得目標(biāo)區(qū)域中的更多堿基序列可以直接設(shè)計(jì)探針，從而保證了目標(biāo)區(qū)域的更高覆蓋。

NimbleGen自有算法可以更好的針對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行探針設(shè)計(jì)。例如上圖中對11號染色體上一個(gè)500kb的區(qū)域進(jìn)行探針設(shè)計(jì)，黑色區(qū)域分別表示由兩種不同算法計(jì)算出的探針?biāo)芨采w的區(qū)域，而紅色區(qū)域表示只有NimbleGen的設(shè)計(jì)能覆蓋的區(qū)域。

而NimbleDesign將NimbleGen探針?biāo)惴◣У侥纳磉�，是NimbleGenBioinformatics團(tuán)隊(duì)心血之作，從此您可以全天候、全時(shí)段、零距離地使用NimbleGen專有的探針?biāo)惴āＯ聢D顯示了NimbleDesign的設(shè)計(jì)流程，提交設(shè)計(jì)背景信息、目標(biāo)區(qū)域范圍以及選擇探針設(shè)計(jì)參數(shù)后，即可在最快幾分鐘到最多24小時(shí)，獲得您的探針設(shè)計(jì)文件。當(dāng)您確認(rèn)探針設(shè)計(jì)后，需要訂購這一產(chǎn)品，只需在系統(tǒng)中點(diǎn)擊Transmit，我們就會(huì)收到您的訂購需求，與您進(jìn)一步聯(lián)系。

NimbleDesign軟件設(shè)計(jì)流程

● 縮短定制設(shè)計(jì)時(shí)間

● 易學(xué)易用在線軟件

● 在軟件中隨時(shí)可以獲取各種幫助信息

● 將專業(yè)的捕獲設(shè)計(jì)算法帶到您的身邊

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