美國西格諾公司—北京分部快訊
世界首個質(zhì)譜掃描31種人乳頭瘤病毒HPV雙基因分型問世
經(jīng)中國醫(yī)學科學院和第四軍醫(yī)大學與美國西格諾公司合作,聯(lián)合研究開發(fā)的多重PCR-Mass質(zhì)譜掃描法,于2012年11月9日被美國臨床微生物雜志Journal of Clinical Microbiology接收網(wǎng)上發(fā)表。
該研究揭示,在女性宮頸癌中HPV檢出率>97%,主要為15種高危型;而男同性戀MSM者中,HPV感染型已經(jīng)超過30種型,特別是>10種型的高混合型感染的嚴重程度,已經(jīng)遠超過女性的>5種型的程度,其對健康的影響目前還鮮為人知,應(yīng)當受到高度關(guān)注。
該方法用于檢測世界衛(wèi)生組織國際腫瘤研究機構(gòu)(WHO_ IARC)公布的30種與婦女子宮頸病變相關(guān)HPV基因型,包括:15種致癌高危型:16,18,31,33,35,39,45,51,52,56,58,59,68,73,82;3種可能致癌高危型:26,53,66;及12種低危型:6,11,40,42,43,44,54,61,70,
72,81/CP8304和89/CP6108型;以及男性同性戀中高發(fā)的84型。檢測探針針對兩個基因區(qū),致癌性早期轉(zhuǎn)錄E6基因和衣殼蛋白晚期轉(zhuǎn)錄L1基因,避免了因病毒整合、變異或樣本降解而造成的假陰性問題。經(jīng)兩輪擴增和采用先進的飛行質(zhì)譜MALDI掃描,軟件自動分析報告HPV基因型結(jié)果,避免了人為目測判斷造成的誤差,檢測靈敏度高達單拷貝/反應(yīng)。
經(jīng)對200份同性戀肛拭子DNA標本檢測,發(fā)現(xiàn)64.5%(129/200) HPV陽性,其中混合型感染者51.9% (67/129),最高達12種,總共檢出31種HPV類型。
經(jīng)對135例宮頸癌組織標本作對比實驗,質(zhì)譜法與凱普法(GA,CE,SFDA認證) 分別檢出HPV基因型為15種和11種,陽性率為97% (131/135) 和90.4% (122/135)。質(zhì)譜法與凱普法所檢測的陽性標本122例和陰性標本4例完全吻合,用測序法補充驗證9例凱普檢測陰性的標本,結(jié)果與質(zhì)譜法完全一致。質(zhì)譜法與凱普法分別檢出混合型感染者55.6%(75/135) 和25.2% (34/135),發(fā)現(xiàn)最高混合型分別為6種和3種HPV類型。
該方法的主要優(yōu)勢:
高特異性:在高重數(shù)引物設(shè)計、試劑遴選及特異甄別等方面獨具匠心,徹底解決了目前多重探針混合,識別相似基因序列易產(chǎn)生交叉錯配的假陽性問題。經(jīng)幾千例樣本測試和測序比對,特異性達100%。
高靈敏度:雙基因探針、兩輪PCR擴增和高特異性探針單堿基延伸反應(yīng),飛行質(zhì)譜掃描,顯著提高了檢測致病HPV基因型的靈敏度,解決了現(xiàn)行試劑盒中因采用E或L單基因探針檢測而出現(xiàn)的結(jié)果不一致性及其所致的假陰性問題,達到每個反應(yīng)單拷貝水平。
防污染:封閉式單孔完成全部反應(yīng),無須清洗,產(chǎn)物可即時降解。
通量靈活:每天檢測10-1000份樣本,每板可檢測7800重反應(yīng)。
高自動化:軟件實時判讀檢測結(jié)果,避免了目測判讀的人為誤差。
低成本:毋需熒光標記,5µL反應(yīng)體系,試劑用量低。
本方法廣泛適用于轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究的各種男女性臨床樣本:血液、尿液、細胞、咽拭子、肛拭子、新鮮組織及福爾馬林固定石蠟包埋組織中31種HPV病毒DNA的分型測試。
本項服務(wù)將首先在國內(nèi)首批醫(yī)學獨立實驗室北京德易醫(yī)檢開展。
服務(wù)地址:北京市西城區(qū)新街口外大街8號
聯(lián)系熱線:masscan2012@yahoo.com
儀器信息:美國西格諾公司 www.sequenom.com
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