羅氏454長測序平臺用于蝴蝶基因組測序
瀏覽次數(shù):2820 發(fā)布日期:2012-8-14
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羅氏454長測序平臺用于蝴蝶基因組測序
袖蝶(Heliconius)基因組學(xué)會最近完成了紅帶袖蝶(Heliconius melpomene)基因組草圖1,并與其他如蝴蝶品種H. timareta和H. elevatus及其他昆蟲的基因組序列進行了比較。
Heliconius屬包括近50種蝴蝶,幾百種擁有不同色彩花紋。紅帶袖蝶H. melpomene的花紋在一些相關(guān)的蝴蝶品種中也存在,并其一股特殊的氣味,因此被認為其花紋既可以吸引潛在配偶有可以抵御潛在的捕食者。
雖然已有一些蝴蝶不同品種間相互交配的證據(jù),但沒有證據(jù)表明這些種間交配對于蝴蝶獲取適應(yīng)性性狀的重要性。為了解答這一問題以及其他有關(guān)蝴蝶生物學(xué)的問題,該國際團隊提取了源于巴拿馬的自交系紅帶蝴蝶的DNA,使用羅氏454長測序平臺以及其他短測序測序平臺的組合,以獲得了269萬條紅帶袖蝶基因組序列,完成了基因組草圖的繪制。
測序數(shù)據(jù)達到基因組的38倍深度,推測出分布在21個染色體上的12,669個蛋白質(zhì)編碼基因;诜治鼋Y(jié)果,發(fā)現(xiàn)袖蝶屬(Heliconius)的蝴蝶經(jīng)常隨機的交換決定保護色圖案的基因,這意味著種間交配在環(huán)境適應(yīng)中的重要作用。即蝴蝶可以通過與其他品種的蝴蝶的交配,獲取他們的保護色圖案的基因,比自行從無到的進化過程更快。
該紅帶蝴蝶基因組研究的其他信息及完成基因注釋的草圖,將在ENSEMBL公布。