羅氏454測(cè)序完成倭黑猩猩基因組草圖測(cè)序
瀏覽次數(shù):2357 發(fā)布日期:2012-8-10
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羅氏454測(cè)序完成倭黑猩猩基因組草圖測(cè)序
近期,一個(gè)國(guó)際研究小組在《Nature》1雜志報(bào)道倭黑猩猩(Bonobo)基因組測(cè)序完成。利用完成的倭黑猩猩基因組圖譜,以及另外19個(gè)倭黑猩猩及黑猩猩(Chimpanzee)基因組的測(cè)序數(shù)據(jù),研究人員不僅研究了倭黑猩猩的基因組,也對(duì)不同倭黑猩猩、黑猩猩及人類基因組進(jìn)行了比較。
研究人員首先利用454測(cè)序系統(tǒng)對(duì)一只來(lái)自剛果Leipzig動(dòng)物園的雌性倭黑猩猩基因組進(jìn)行測(cè)序,獲得了2.7Gb的序列,拼接出倭黑猩猩的基因組圖譜,其正確可達(dá)為99.98%,與現(xiàn)有的黑猩猩基因組數(shù)據(jù)質(zhì)量相似。
結(jié)果印證了之前對(duì)非洲猿(ape)進(jìn)化史的認(rèn)識(shí),即倭黑猩猩及黑猩猩祖先約100萬(wàn)年前在中部非洲分離,晚于非洲猿與人類祖先分化數(shù)百萬(wàn)年。倭黑猩猩基因組的99.6%與黑猩猩基因組一致,而與人類基因組的一致度略低在98.7%。研究人員推測(cè)倭黑猩猩與黑猩猩的分化事件發(fā)生在150-120萬(wàn)年前剛果河形成的時(shí)期,這也使得這兩個(gè)物種被分割開因而沒有再發(fā)生種間交配。
同時(shí),此次研究也給人類及非洲猿進(jìn)化歷史帶來(lái)了新的線索,比如在人類的基因組中也存在一些區(qū)域,相比倭黑猩猩與黑猩猩基因組兩者之前的差異,人類基因組序列可能更接近于倭黑猩猩或黑猩猩的序列。這樣的區(qū)域總量超過人類基因組的3%以上,其中約1.6%的基因組人類與倭黑猩猩更相似,約1.7%的基因人類與黑猩猩更為相似,推測(cè)可能這些區(qū)域與倭黑猩猩及黑猩猩進(jìn)化歷史上發(fā)生的重大的群體性選擇事件相關(guān)。
倭黑猩猩和黑猩猩在許多高級(jí)、復(fù)雜的性狀特征上與人類有相似之處,如群體組織、社交行為;倭黑猩猩性格活潑并性行為活躍,而黑猩猩更具有攻擊性和競(jìng)爭(zhēng)意識(shí)。研究人員下一步將通過對(duì)三者基因組異同及基因的特征特點(diǎn)的分析,推測(cè)在進(jìn)化中關(guān)鍵的基因組事件,進(jìn)而將一些包括行為學(xué)特征在內(nèi)的性狀與基因特征相互關(guān)聯(lián),以幫助解答這些性狀的遺傳學(xué)基礎(chǔ)的問題。
1. The bonobo genome compared with the chimpanzee and human genomes. Prüfer K. et al. Nature. 2012 Jun 28;486(7404):527-31.