NimbleGen SeqCap被用于加拿大大型外顯子組測序項目
瀏覽次數:3216 發(fā)布日期:2012-7-23
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羅氏NimbleGen SeqCap用于加拿大一4000外顯子組測序項目
最近羅氏NimbleGen的SeqCap EZ Exome產品被加拿大多倫多一醫(yī)院基因組服務中心選中,用于一個癌癥生物標記物研究。該中心將開展一項4000個外顯子組測序項目,用于發(fā)現癌癥相關的生物標記物。
第一批購買的產品還包括一臺Caliper Sciclone NGS Workstation移液工作站,這個平臺將自動化、高通量地完成外顯子組序列捕獲,以及二代測序文庫制備。該實驗室希望通過建立這一SeqCap EZ Exome與二代測序結合的平臺,加強其在轉化基因組方面(translational genomics)的優(yōu)勢。除該項目外,該平臺還為Mount Sinai醫(yī)院的其他基礎研究實驗室以及臨床病理實驗室提供多種基因組研究服務。
NimbleGen的SeqCap產品獲選用于大型外顯子組測序項目已經不是第一次。去年年末SeqCap就被選中運用于一項在荷蘭進行的大規(guī)模流行病研究項目(Rotterdam Study),對超過3000個樣本進行外顯子組捕獲,然后用于測序。今年年初,在英國又再次被選中用于一個血液病相關研究,對50000個樣本進行外顯子組捕獲。
此次作為其后續(xù)實驗,對外顯子進行重測序。實驗中NimbleGen SeqCap液相外顯子捕獲產品(NimbleGen SeqCap EZ Exome Library)以及Caliper Life Sciences的自動化平臺(Sciclone NGS Workstation)將在未來的3-4個月內完成3000多個樣本捕獲然后進行測序。
多次的成功獲選表明NimbleGen的SeqCap產品 展現了其在市場上的重要地位,同時體現了NimbleGen高于對手的性能優(yōu)勢。同時,多個獨立進行的序列捕獲產品比較實驗,也發(fā)現了NimbleGen SeqCap EZ Exome產品的高定向捕獲能力 以及高捕獲均一性,減少了后續(xù)所需測序量。
同時, NimbleGen SeqCap EZ成熟的自動化解決方案也實現對大量樣本的平行、快速、高效的序列捕獲,減少人力和縮短實驗周期,同時保證實驗的重復性、穩(wěn)定性。