羅氏454測序儀用于抗生素相關(guān)哮喘研究

瀏覽次數(shù)：2500　發(fā)布日期：2012-5-23　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

454測序儀用于抗生素相關(guān)哮喘研究

加拿大的科學(xué)家最近在EMBO發(fā)表文章¹，發(fā)現(xiàn)萬古霉素抗生素會增加幼鼠的哮喘易感性。這一研究結(jié)果與之前的“衛(wèi)生假設(shè)理論”（hygiene hypothesis）相一致，認(rèn)為腸道內(nèi)微生物菌落中益生菌的缺乏是導(dǎo)致哮喘發(fā)生的原因之一。

過敏性哮喘影響著全球約1億人口，并且患者數(shù)量與日俱增，尤其是在工業(yè)發(fā)達國家的兒童中的患病率上升。不斷提高的衛(wèi)生狀況以及抗生素使用的普及被認(rèn)為是過敏性哮喘增加的可能原因。此次研究中，不同年齡組的小鼠口服抗生素后，分析其腸道微生物菌落組成與外因引起的過敏性哮喘的關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，幼年小鼠在口服萬古霉素抗生素后，腸道內(nèi)細(xì)菌的種類減少，菌群組成明顯改變，同時對于人為外因的敏感性增強，更易發(fā)生哮喘。

早期的腸道菌群被認(rèn)為對于免疫力的形成有重大影響，腸道內(nèi)寄生有無數(shù)細(xì)菌，種類超過1000種。如果腸道內(nèi)細(xì)菌的平衡被打破，機體抵抗疾病的能力便會受到影響。此次研究證明，口服萬古霉素會對腸道內(nèi)的部分菌種產(chǎn)生選擇壓力，致使免疫調(diào)節(jié)能力、免疫應(yīng)答反應(yīng)受到影響。在幼鼠早期的抗生素使用，改變了腸道菌群的組成，加重了哮喘發(fā)生的機會。

在對腸道菌群的研究中，使用了454測序儀進行16S rRNA擴增子測序。69個樣本的68014條高質(zhì)量測序序列進行Principle Coordinate Analysis分析后，表明萬古霉素對于幼鼠腸道菌落的影響最大。而鏈霉素的影響較小，成年小鼠受到的影響也較幼鼠小。通過分子實驗對免疫分子的檢測，直接鑒定了肺部哮喘的嚴(yán)重程度。

生命早期是哮喘的關(guān)鍵時期，此時的腸道微生物菌群可能影響免疫系統(tǒng)對于過敏原的反應(yīng)。通過這類研究將為更好的理解微生物與健康、疾病關(guān)系提供新線索，幫助更好地預(yù)防治療哮喘。

1. . Shannon L. Russell SL, Gold MJ, Hartmann M, Willing BP, Thorson L, Wlodarska M, Gill N, Blanchet MR, Mohn WW, McNagny KM, Finlay BB (2012) EMBO Rep. May 1;13(5):440-7. doi: 10.1038/embor.2012.32.

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