上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院上海市內(nèi)分泌代謝病研究所、上海血液學(xué)研究所、醫(yī)學(xué)基因組學(xué)國家重點實驗室的宋懷東研究員、陳家倫、寧光、
Graves病(Graves’Disease,GD以下簡稱甲亢),是一種常見的器官特異性自身免疫性疾病,其突出特征是血清中存在甲狀腺刺激激素受體抗體(TRAb)。我國人群甲亢患病率約為1%,估計患者約有1300萬,但目前來說,甲亢的治療效果并不理想,其所引起的心衰、甲狀腺危象等,常危及患者生命,致疾病預(yù)后不良。應(yīng)用抗甲狀腺藥物(ATD)治療該病已近50年歷史,至今仍是一種最為安全有效的療法。然而,相當(dāng)一部分患者治療緩解后仍有復(fù)發(fā),復(fù)發(fā)時病情加重,且療效不佳。對于該病在治療中存在的困難,迫切需要分子標(biāo)志物的鑒定和應(yīng)用。
研究組采用GWAS技術(shù),通過對大樣本甲亢人群和正常人群全基因位點的比較、分析和驗證。對1536名甲亢病患者,以及1516名未患該病的對照個體進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析。隨后的研究中對第二組7504名受試者(其中包括3994名甲亢病患者,以及3510名對照個體)進(jìn)行一系列相關(guān)的SNPs 檢測,他們鑒定出了6個與甲亢病相關(guān)聯(lián)的風(fēng)險位點,發(fā)現(xiàn)了兩個新的甲亢易感位點,由此識別了兩個相關(guān)基因,其中一個是以前尚未報道過的,研究小組將它命名為GDCG4p14。研究人員發(fā)現(xiàn)這兩個基因會影響調(diào)節(jié)免疫的T細(xì)胞功能,因此,這兩個基因可能是新認(rèn)識到的甲亢致病易感基因。
更有意義的是,研究人員還發(fā)現(xiàn),甲亢病人中可能存在兩種不同的發(fā)病機(jī)制。甲亢治療后,TRAb持續(xù)陽性,是停藥后復(fù)發(fā)的一個重要的預(yù)測指標(biāo)。研究發(fā)現(xiàn),對于經(jīng)過藥物治療后,甲狀腺刺激激素受體基因的多態(tài)性和TRAb抗體轉(zhuǎn)陰性的病人不相關(guān),但和持續(xù)陽性的病人密切相關(guān)。由此可見,該研究為臨床治療提供了一種有價值的手段,可以更為準(zhǔn)確的區(qū)分兩類病人,并有助于指導(dǎo)甲亢的臨床用藥,為病人的愈后提供有效預(yù)判。這一成果,既是GWAS技術(shù)在推進(jìn)疾病基因組研究和藥物基因組研究方面的一個重要的成果,也是通過基因組研究,推動臨床研究和基礎(chǔ)研究的結(jié)合,加快臨床醫(yī)療技術(shù)提高的典型事例。
這項研究針對多個基因進(jìn)行了多中心、大樣本和反復(fù)的驗證。需要分析大量樣本,研究團(tuán)隊在考慮時間及成本及數(shù)據(jù)質(zhì)量等多種因素后,使用了Fluidigm BioMark高通量基因分析系統(tǒng) 進(jìn)行SNP 實驗認(rèn)證。 Fluidigm BioMark高通量基因分析系統(tǒng)能夠同時對最多96 個樣品進(jìn)行多達(dá)96 個位點的SNP分析,使研究人員能迅速獲得目的基因的更多信息,滿足了GWAS高靈敏度,高內(nèi)涵,大動態(tài)范圍和超高通量的應(yīng)用需求。
該研究團(tuán)隊是Fluidigm BioMark高通量基因分析系統(tǒng)在中國大陸最早的使用者之一,這篇文章也是Fluidigm BioMark眾多高水平文章中第一篇主要由中國內(nèi)地學(xué)者發(fā)表的研究報告,相信隨著該系統(tǒng)的普及,將有更多高水平文章的產(chǎn)生。
該研究得到了國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)、國家自然科學(xué)基金、上海市科委重點項目和上海市教委重點學(xué)科等基金的支持。
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