“從芯片到新一代測序”講座-上海交大醫(yī)學(xué)院(5.20)
瀏覽次數(shù):2535 發(fā)布日期:2010-5-17
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從芯片到新一代測序
——新技術(shù)在疾病研究中的應(yīng)用
一、高通量技術(shù)在表觀遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用
表觀遺傳的改變(基因組DNA甲基化、組蛋白修飾等)以及轉(zhuǎn)錄因子與DNA的相互作用都可以在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因的表達(dá),并與生物體正常生理過程以及疾病發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。講座將介紹基于高通量芯片和Illumina GA IIx測序平臺的高通量檢測技術(shù)及應(yīng)用:包括MeDIP-chip、ChIP-chip、MeDIP-Seq、ChIP-Seq。
二、非編碼RNA研究------從microRNA到LncRNA
長鏈非編碼RNA(lncRNA)作為長度超過200nt的非編碼RNA,與microRNA為代表的small ncRNA, 在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等多個層面調(diào)控基因表達(dá)。講座將介紹非編碼RNA的多種研究方法及應(yīng)用,包括microRNA表達(dá)譜芯片,最新推出的lncRNA表達(dá)譜芯片,以及Illumina GA IIx新一代測序技術(shù)在非編碼RNA研究中的應(yīng)用。
三、實時定量PCR芯片在疾病中的應(yīng)用和進(jìn)展
實時定量PCR芯片,結(jié)合了芯片高通量和實時定量PCR準(zhǔn)確性的優(yōu)點,廣泛應(yīng)用于各種疾病和正常生長發(fā)育機(jī)制的研究。講座將系統(tǒng)介紹PCR array的應(yīng)用,一次精確檢測幾十到幾百個不同基因,有超過100種不同信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路或疾病研究的方向可供選擇;講座還將介紹專門用于研究microRNA表達(dá)的PCR array。
四、表達(dá)譜芯片在疾病研究中的應(yīng)用及數(shù)據(jù)挖掘
全基因組表達(dá)譜芯片可一次性檢測所有已知基因(mRNA)的表達(dá)水平,是目前應(yīng)用最廣泛的生物芯片技術(shù)平臺。講座將介紹表達(dá)譜芯片技術(shù)與生物學(xué)研究尤其是疾病研究的有效結(jié)合,重點涉及實驗設(shè)計與芯片數(shù)據(jù)的深入挖掘。
時間:2010年5月20號(星期四)下午14:00-16:00(講第二、第四部分)
地點:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院5號樓11樓免疫學(xué)研究所會議室
(上海市重慶南路280號5號樓11樓會議室)
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地址:上海市漕河涇高新技術(shù)開發(fā)區(qū)虹漕路421號63號樓2樓
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