羅氏 NimbleGen 在全球范圍占領(lǐng)定向重測序市場
瀏覽次數(shù):3834 發(fā)布日期:2009-2-2
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NimbleGen 序列捕獲芯片迅速成為全球高通量測序?qū)嶒炇业臉悠分苽浞椒ㄖx世界各地的研究人員紛紛采用羅氏NimbleGen 序列捕獲芯片以及相關(guān)儀器和試劑盒來加速疾。ㄈ绨┌Y和糖尿。┭芯恐械臉悠分苽,這意味著羅氏 NimbleGen 正在占領(lǐng)全球定向重測序市場。定向重測序可讓科學(xué)家們只捕獲人類基因組上感興趣的區(qū)域,并利用高通量的測序系統(tǒng),如454 生命科學(xué)的Genome Sequencer FLX 儀器,來評估捕獲片斷中的遺傳變異。NimbleGen 序列捕獲產(chǎn)品的應(yīng)用與傳統(tǒng)的實驗室方法相比,簡化了這些基因組區(qū)域的捕獲,可令研究人員更快進(jìn)入測序階段。
基因組捕獲技術(shù)已經(jīng)成為科研實驗室的寶貴工具,尤其是在美國明尼蘇達(dá)州的梅奧診所,這里也是美國較早接受NimbleGen 序列捕獲芯片的早期使用者。梅奧診所實驗室醫(yī)學(xué)及病理學(xué)的助理教授,同時也是分子遺傳學(xué)實驗室的聯(lián)合主管,Matthew J.Ferber 博士表示:“NimbleGen 序列捕獲芯片提供了一項極具前景的強(qiáng)大技術(shù),讓我們實驗室快速開發(fā)出大量的定向基因測序分析,并可輕松融入454 測序流水線!
NimbleGen序列捕獲芯片同時也成為測序服務(wù)供應(yīng)商實驗室的研究工具之一,譬如法國巴黎的Genoscope – CEA。其基因組資源部門的主管Gábor Gyapay博士提到:“在我們研究罕見單基因遺傳病的工作中,如果疾病基因所在的間隔超過幾百kb,那簡直不可能用PCR的方法來制備測序樣品。利用NimbleGen Sequence 385K芯片,我們能夠捕獲大小在幾百萬個堿基的區(qū)域,并利用Genome Sequencer FLX儀器對樣品進(jìn)行測序。初期的結(jié)果讓我們非常興奮! Gyapay博士高度贊揚了技術(shù)的易用性:“羅氏NimbleGen的詳細(xì)步驟很有用,它以清晰的解說方式指導(dǎo)你操作每一步。我很欣賞在每個質(zhì)量控制步驟都提供了預(yù)期結(jié)果的圖片!
作為NimbleGen 序列捕獲芯片在加拿大的早期采用者,加拿大安大略癌癥研究所癌癥基因組學(xué)和高通量篩選的平臺主管- John McPherson 博士已經(jīng)在他的實驗室牢固確立了這種技術(shù)!叭蚪M測序?qū)τ谖覀兿胍幚淼臉悠窋?shù)量來說還是太昂貴了。定向重測序讓我們能分析更多的基因組。我們初次嘗試就富集到了目標(biāo)區(qū)域,目前我們?nèi)栽趦?yōu)化步驟,讓它適用于其他的測序平臺。來自羅氏的這臺儀器很奏效,讓整個過程很容易操作!
在2009 年1 月,Roche NimbleGen 推出了人外顯組捕獲產(chǎn)品,它利用了優(yōu)化的設(shè)計算法(2008 年10 月推出的385K 平臺),提供了迄今為止表現(xiàn)最佳,功能最強(qiáng)大的NimbleGen 序列捕獲芯片設(shè)計。這種優(yōu)化設(shè)計的目標(biāo)是以相等的效率捕獲所有目標(biāo)區(qū)域,并全面減少所需的測序,從而降低測序費用。人外顯組產(chǎn)品是建立在新的高密度HD2(210 萬個長寡核苷酸探針)平臺上的NimbleGen 序列捕獲芯片。此產(chǎn)品能在單個芯片上捕獲人基因組的幾乎所有編碼區(qū)域(約18 萬個人編碼外顯子和約700 個miRNA 外顯子)。它為研究人員提供了比傳統(tǒng)PCR 方法更簡單經(jīng)濟(jì)的外顯子樣品制備方案,可用于旨在闡明人遺傳變異復(fù)雜度的研究推理中。
現(xiàn)在有了羅氏認(rèn)證的NimbleGen 序列捕獲培訓(xùn)師提供的3 天客戶現(xiàn)場研討會,這項新技術(shù)在客戶實驗室的開展就變得很簡單。培訓(xùn)師能對客戶進(jìn)行385K 和2.1M 捕獲步驟的培訓(xùn)。
Roche NimbleGen 是具有專利的DNA 微陣列、耗材、儀器和服務(wù)的領(lǐng)先創(chuàng)造者、生產(chǎn)商和供應(yīng)商。Roche NimbleGen 生產(chǎn)長寡核苷酸探針的高密度微陣列,為基因組和表觀基因組變異的研究提供了更多的信息和更高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。這種性能的提高是通過Roche NimbleGen 專利的無膜芯片合成(MAS)技術(shù),該技術(shù)使用了數(shù)字光處理和快速、高產(chǎn)的光化學(xué)技術(shù),以極高的靈活性合成長寡核苷酸、高密度的DNA 微陣列。關(guān)于Roche NimbleGen 的更多信息,請訪問公司網(wǎng)站。