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賽默飛世爾在人類蛋白質(zhì)組大會發(fā)布Proteome Dynamics

瀏覽次數(shù):3198 發(fā)布日期:2008-8-22  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
世界領(lǐng)先的賽默飛世爾科技在2008年人類蛋白質(zhì)組大會(HUPO 2008)上推出新的蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程解決方案,以及兩個Thermo Scientific軟件升級包。不久前推出的Proteome Discoverer 軟件平臺是一個綜合性的、可拓展軟件平臺,可以對蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù)進行定性和定量分析,作為Proteome Discoverer 的補充,新加入的部分將進一步升級Thermo Scientific Proteome Dynamics。

Proteome Dynamics是一套完整的蛋白質(zhì)組解決方案,包括試劑,樣品制備試劑盒和操作流程,質(zhì)譜儀和具有特定功能的生物軟件,以方便識別,定量和定性鑒定蛋白質(zhì)。推出新品包括以下幾個方面:

•自動化的磷酸化肽段工作流程—一套完整可自動化分析磷酸化肽段的操作流程
•SIEVE™ 1.2---主要對軟件中無標記差異分析部分進行升級;谝合嗌V質(zhì)譜數(shù)據(jù)比較對蛋白和肽段的變化進行衡量和鑒定
•ProSightPC™ 2.0—拓展了業(yè)界領(lǐng)先的自上而下的鑒定能力,支持所有高質(zhì)量準確度的串聯(lián)質(zhì)譜實驗的蛋白鑒定和表征

在過去的十年里,蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域大步發(fā)展,它對生物和醫(yī)藥領(lǐng)域的尖端科技產(chǎn)生了深遠的影響。

Thermo Fisher一直致力于蛋白質(zhì)組科學(xué)的發(fā)展,打破了傳統(tǒng)定性蛋白質(zhì)組分析,轉(zhuǎn)向更高級的定量蛋白質(zhì)組,因而創(chuàng)造了蛋白質(zhì)組動態(tài)研究藍圖。

新型自動化磷酸化肽段分析流程將Thermo Scientific技術(shù)與Pierce®磷酸化肽段富集試劑盒、Kingfisher® Flex 磁珠純化系統(tǒng)和LTQ Orbitrap™ XL ETD 雜交質(zhì)譜儀結(jié)合起來,可以完全實現(xiàn)對磷酸化肽段進行分析。致力于構(gòu)建信號途徑的科學(xué)家會發(fā)現(xiàn)固定化金屬和金屬氧化物的親和色譜能夠富集磷酸化肽段,然后用質(zhì)譜對其分析是一個功能強大的技術(shù)。然而,樣品的復(fù)雜度和低通量制備步驟成為一個主要的障礙。新型Thermo Scientific的整合操作流程對這類難題提供了一個簡單、有效的解決方案!皹悠分苽浜头治鲞^程的每一部都是經(jīng)過優(yōu)化的!盩hermo Fisher Scientific 蛋白質(zhì)學(xué)市場總監(jiān)Andreas Huhmer說,“該工作流程可以使科學(xué)家實現(xiàn)整個過程無縫連接。

在2008年的人類蛋白質(zhì)組大會上發(fā)布的另一款軟件是Thermo Scientific 的SIEVE 1.2。通過比較“健康”或?qū)φ战M和“疾病”或處理不需要同位素標記的樣品的液相色譜質(zhì)譜數(shù)據(jù)組,SIEVE可自動對無標記的蛋白和肽段進行差異分析。之前,研究者只能比較成對的數(shù)據(jù)。然而,在生物標志物發(fā)現(xiàn)的研究領(lǐng)域內(nèi),觀察數(shù)據(jù)趨勢是必須的,SIEVE 1.2 可以實現(xiàn)在單個趨勢分析中觀察多時間點和劑量點。

“SIEVE第一次發(fā)布后,我們從客戶收到反饋的主要問題是SIEVE如何根據(jù)時間不同監(jiān)控蛋白變化,如何更方便的在肽段和蛋白水平上解釋其統(tǒng)計結(jié)果!盩hermo Fisher Scientific 蛋白質(zhì)學(xué)市場程序經(jīng)理Amy Zumwalt說,“為了滿足這一需求,我們在這個版本中加入了趨勢分析功能,并且完全重新構(gòu)建了用戶界面。新的向?qū)Ы缑鎸⑹共町悓嶒灲Y(jié)果和解釋統(tǒng)計結(jié)果變得更容易!

同樣首次發(fā)布的軟件還有Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0,它最初是設(shè)計來方便“自上而下”(top-down)蛋白質(zhì)定性鑒定。而現(xiàn)在可以支持所有高質(zhì)量精度、高分辨率的串聯(lián)質(zhì)譜蛋白實驗。

ProSightPC 2.0可以實現(xiàn)對高質(zhì)量精度的二級質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行高通量分析,無論其來自是“自上而下”(top-down),“自中而下”(middle-down),還是“自下而上”(bottom-up)的實驗,而且可表征已知的翻譯后修飾蛋白(PTM)!癟hermo Scientific 的ProSightPC 2.0是專門面向雜交質(zhì)譜技術(shù)的,現(xiàn)在也可以支持新型LTQ Orbitrap XL ETD質(zhì)譜的數(shù)據(jù)!盇ndreas Huhmer說,“這給研究人員提供了獨一無二的工具,可以對蛋白異構(gòu)體和變異體的錯綜復(fù)雜的差異進行分析。

SIEVE采用一種新型圖形界面,更易使用,而且重要的是它現(xiàn)在可以對液相色譜質(zhì)譜的數(shù)據(jù)文件自動進行分析。而以前在處理數(shù)據(jù)之前必須手動挑選峰。而現(xiàn)在選擇整個色譜圖就可以對所有的峰進行自動分析了。

如需對Proteome Dynamics了解更多信息,請于2008年8月16日至20日訪問阿姆斯特丹的HUPO #34展臺,或致電800-810-5118或400-650-5118,電郵analyze.cn@thermofisher.com 或者訪問 www.thermo.com/orbitrap。

Thermo Scientific是Thermo Fisher Scientific的一部分,是全球科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者

關(guān)于賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)
Thermo Fisher Scientific(賽默飛世爾科技)(紐約證交所代碼:TMO)是全球科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者,致力于幫助客戶使世界更健康、更清潔、更安全。公司年銷售額超過100億美元,擁有員工約33,000人,在全球范圍內(nèi)服務(wù)超過350,000家客戶。主要客戶類型包括:醫(yī)藥和生物公司,醫(yī)院和臨床診斷實驗室,大學(xué)、科研院所和政府機構(gòu),以及環(huán)境與工業(yè)過程控制裝備制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific這兩個主要的品牌,幫助客戶解決在分析化學(xué)領(lǐng)域從常規(guī)的測試到復(fù)雜的研發(fā)項目中所遇到的各種挑戰(zhàn)。Thermo Scientific能夠為客戶提供一整套包括高端分析儀器、實驗室裝備、軟件、服務(wù)、耗材和試劑在內(nèi)的實驗室綜合解決方案。Fisher Scientific為衛(wèi)生保健,科學(xué)研究,以及安全和教育領(lǐng)域的客戶提供一系列的實驗室裝備、化學(xué)藥品以及其他用品和服務(wù)。賽默飛世爾科技將努力為客戶提供最為便捷的采購方案,為科研的飛速發(fā)展不斷地改進工藝技術(shù),提升客戶價值,幫助股東提高收益,為員工創(chuàng)造良好的發(fā)展空間。欲了解更多信息,請登陸: www.thermofisher.com


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