方正醫(yī)藥研究院是北大國際醫(yī)院集團(tuán)所屬研發(fā)機(jī)構(gòu)，成立于2008年，注冊(cè)資本5000萬元人民幣。方正醫(yī)藥研究院依托北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部深厚的學(xué)術(shù)基礎(chǔ)，致力于開發(fā)擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的創(chuàng)新藥物，重點(diǎn)以研發(fā)抗腫瘤類、精神神經(jīng)類、糖尿病類等藥物研發(fā)為主，包括創(chuàng)新藥物、仿創(chuàng)藥物、醫(yī)藥中間體研發(fā)。
2008年10月，方正醫(yī)藥研究院出資1000萬元人民幣與北大醫(yī)學(xué)部創(chuàng)立“北大醫(yī)學(xué)部•方正創(chuàng)新藥物研究基金”，旨在以專項(xiàng)資金支持北大醫(yī)學(xué)部及方正創(chuàng)新藥物的研發(fā)事業(yè)，采取產(chǎn)、學(xué)、研相結(jié)合的模式，通過創(chuàng)新藥物項(xiàng)目將北大醫(yī)學(xué)部在人才資源、多學(xué)科技術(shù)支持和基礎(chǔ)科研實(shí)力等方面的優(yōu)勢(shì)，同方正的組織經(jīng)驗(yàn)、標(biāo)準(zhǔn)化管理和資金保障等優(yōu)勢(shì)相結(jié)合，搭建高水準(zhǔn)的科研項(xiàng)目產(chǎn)業(yè)化平臺(tái)。2010年9月，方正醫(yī)藥研究院相繼建立了國家級(jí)博士后工作站。
方正醫(yī)藥研究院自成立以來，已有20多個(gè)仿創(chuàng)藥物處在研發(fā)中，包括一類新藥、國內(nèi)首仿等藥物，其中多個(gè)項(xiàng)目處在臨床研究中。