引言
表面等離子體共振儀器可以提供例如動力學、親和力和濃度等豐富的信息。P4SPR分子互作儀具有兩種不同類型的設(shè)置,可以進行靜態(tài)和動力學 SPR 分析。在靜態(tài)系統(tǒng)中,樣品溶液通過注射器手動引入流動池并通過擴散與表面發(fā)生相互作用。在動力學系統(tǒng)中,(通過手動注射器或自動進樣器)將樣品溶液先裝入樣品環(huán),然后通過注射泵將運行緩沖液流過樣品環(huán),將樣品引入流動池中。
本文描述了固定化多克隆鼠抗人 IgG (MAH IgG) 與全人 IgG (Hm IgG) 在靜態(tài)和動態(tài) Affinite Instruments SPR 設(shè)備之間的生物分子相互作用。
讓我們首先定義基本的親和力和動力學參數(shù)。使用基本的 Langmuir 結(jié)合模型假設(shè)固定配體 (L) 與分析物 (A) 相互作用的比例為 1:1。
A+L⇌AL (1)
速率常數(shù) (kon 和 koff) 分別表示正向 (結(jié)合) 和反向 (解離) 反應(yīng)。解離平衡常數(shù) KD 表示一半表面固定配體與分析物結(jié)合的時間,可以用游離分析物 [A]、配體 [L] 和分析物-配體復(fù)合物 [AL] 的濃度來表示 (等式 2)。或者,KD 可以使用速率常數(shù) kon 和 koff(或者 ka 和 kd)來定義 (等式 2):
KD 通常是作為求解參數(shù)的首選,因為它以摩爾濃度 (M) 表示,而締合平衡常數(shù) KA 以 M-1 表示。
P4SPR分子互作儀靜態(tài)與動態(tài)SPR分析
動力學分析和靜態(tài)分析均以不同的方式提供有價值的信息。
動力學分析使我們能夠了解分子相互作用的動態(tài),因為它可以洞悉結(jié)合的速度和強度。它有助于研究生物過程的機制并開發(fā)靶向療法。通過實時監(jiān)測相互作用,我們可以評估結(jié)合率和解離率并得出親和常數(shù)。
另一方面,靜態(tài)分析非常適合分析物的篩選和定量。它提供了特定時間點的結(jié)合快照,允許快速分析大量樣本集。由于簡化的樣品引入過程、更快的基線建立和高效的系統(tǒng)沖洗,靜態(tài) SPR 中的檢測時間最多可以是動態(tài) SPR 的一半。這使得靜態(tài) SPR 成為特異性篩選、分析物定量和基本親和力表征的省時選擇。
通過利用動力學和靜態(tài)分析,我們可以全面了解分子相互作用。動力學分析有助于我們揭示結(jié)合的動態(tài)方面,而靜態(tài)分析則可以進行有效的篩選和量化。它們共同提供了結(jié)合過程的整體視圖,從初始關(guān)聯(lián)到穩(wěn)態(tài)結(jié)合水平。
表 1 靜態(tài)和動態(tài)SPR 實驗?zāi)J街g的特征比較
SPR應(yīng)用 |
靜態(tài)分析 |
動力學分析 |
實時結(jié)合數(shù)據(jù) |
√ |
√ |
特異性篩選/排序 |
√ |
√ |
濃度分析 |
√ |
√ |
親和力表征(KD) |
√ |
√ |
動力學表征(kon/koff) |
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√ |
同時分析四個樣品 |
√ |
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單周期和多周期分析 |
√ |
√ |
圖 2 P4PRO圖
試驗設(shè)計
結(jié)果
在靜態(tài) SPR 中,只能觀察到結(jié)合階段。圖 4 中顯示了典型的圖形疊加。隨著分析物與固定在表面上的配體結(jié)合,信號逐漸增加。一旦大多數(shù)可用的配體位點被占據(jù),信號就會達到稱為穩(wěn)定狀態(tài)的平臺,此時配體和分析物結(jié)合和解離之間達到平衡。曲線的形狀和動力學還可以提供有關(guān)結(jié)合親和力、結(jié)合速率和分析物-配體相互作用的化學計量的定性信息。圖 5 中繪制了 SPR 偏移值與濃度的關(guān)系,并通過 Affinité 的 ezControl 軟件獲得了曲線擬合。
圖 4 編制不同濃度 (0、0.89、2.7、8.0、24、72nM) 的 Hm IgG 與參考通道調(diào)整后的固定化 MAH IgG 結(jié)合的靜態(tài) SPR 傳感圖
圖 5 通過繪制 RU 中的 SPR 偏移與納摩爾濃度的關(guān)系圖,可以對 ezControl 軟件中的 KD 進行靜態(tài)評估
通過此曲線擬合,在 63RU 處評估 Rmax,在 ½ Rmax (KD) 處評估濃度為 4.9nM。
在動力學 SPR 中,結(jié)合和解離階段都是可觀察到的。圖 6 顯示了 Hm IgG 動力學注射的圖形疊加。在結(jié)合階段,分析物被注入并允許其與固定在表面上的配體結(jié)合。隨著結(jié)合的發(fā)生,SPR 傳感圖上的信號逐漸增加。信號增加的速率反映了結(jié)合速率常數(shù) (ka),這表明結(jié)合發(fā)生的速度。結(jié)合階段使我們能夠?qū)崟r監(jiān)測分析物-配體復(fù)合物的形成。
結(jié)合階段之后,解離階段開始。在此階段,分析物被運行緩沖液取代,傳感圖上的信號開始減弱。信號減弱的速率反映了解離速率常數(shù) (kd),這表明分析物-配體復(fù)合物解離的速度。解離階段使我們能夠觀察結(jié)合的穩(wěn)定性并測量解離速率。
SPR 中的曲線形狀取決于結(jié)合動力學和分析物與配體之間的親和力。在典型的結(jié)合場景中,在結(jié)合階段,傳感圖上的信號迅速增加,直到達到穩(wěn)定狀態(tài),這表明大多數(shù)可用的配體位點已被占用。信號達到穩(wěn)定狀態(tài)的速率取決于結(jié)合速率常數(shù) (ka) 和分析物的濃度。
圖 6 編制不同濃度 (0、0.89、2.7、8.0、24、72nM) 的 Hm IgG 與用參考通道和空白調(diào)整的固定化 MAH IgG 結(jié)合的動力學 SPR 傳感圖
圖 7 顯示了動力學數(shù)據(jù)的描跡擬合:它表示兩個連接段,分別代表結(jié)合速率和解離速率。結(jié)合速率斜率相對較陡表明結(jié)合速度較快,而解離速率斜率較平緩表明解離速率較慢,表明抗體結(jié)合強。相反,斜率越陡,解離速率越快,抗體結(jié)合越弱。
圖 7 通過 TraceDrawer 評估動力學參數(shù)
表 2 提供了靜態(tài) SPR 和動態(tài) SPR 之間各種參數(shù)的比較。在動態(tài) SPR 中,分析物-配體相互作用的結(jié)合速率 (kon) 為 3.42 x 10^5 M-1*s-1,解離速率 (koff) 為 3.10 x 10^-4 s-1,親和力 (KD) 值為 1 nM,最大結(jié)合響應(yīng) (Rmax) 為 83。在靜態(tài) SPR 中,kon 和 koff 速率不可觀察,Rmax 在 63RU 處評估,KD 評估為 5nM。靜態(tài)系統(tǒng)中分析物的停留時間越長,Rmax 投影就越高,因此與動態(tài)分析相比,KD 值越低,相關(guān)性越高。
表 2 通過 TraceDrawer 評估動力學參數(shù)(NA:不適用)
參數(shù) |
靜態(tài)SPR |
動態(tài)SPR |
KD(nM) |
5 |
1 |
kon(M-1*s-1) |
NA |
3.42×105 |
Koff(s-1) |
NA |
3.10×10-4 |
Rmax(RU) |
63 |
83 |
概括
從動態(tài) SPR 獲得的這些參數(shù)為生物分子相互作用提供了寶貴的見解。另一方面,靜態(tài) SPR 提供了一種更簡單、更具成本效益的方法來篩選和量化分析物。
雖然靜態(tài) SPR 與動態(tài) SPR 相比提供的參數(shù)較少,但它仍然可以在更短的時間內(nèi)產(chǎn)生類似的結(jié)果。靜態(tài) SPR 中簡化的樣品引入過程、更快的基線建立和高效的系統(tǒng)沖洗有助于提高其時間效率。此外,靜態(tài) SPR 儀器的簡化系統(tǒng)設(shè)計和較低成本使它們對許多研究人員來說更容易獲得和負擔得起.
總之,動態(tài) SPR 提供了一套全面的參數(shù)來表征生物分子相互作用,包括親和力、結(jié)合速率、解離速率和最大結(jié)合響應(yīng)。另一方面,靜態(tài) SPR 可以提供其中一些參數(shù),例如親和力,并在更快、更簡單、更實惠的系統(tǒng)中提供類似的結(jié)果。動態(tài)和靜態(tài) SPR 之間的選擇取決于特定的實驗要求和從分析中尋求的信息。
關(guān)于 Affinity 儀器
加拿大Affinité Instruments是一家專注于分子互作研究的公司,基于無標記、高靈敏、表面等離子共振技術(shù)(SRP技術(shù))開發(fā)了性價比極高的個人型分子互作儀,旨在讓每位科研工作者和實驗室都能夠順利的把分子互作相關(guān)實驗開展起來,助力生物科學發(fā)展。
P4PRO是Affinité Instruments最暢銷的一款分子互作儀,其特點是:
①基于SPR原理,實時、無標記、檢測相互作用;
②搭配先進的微流控技術(shù),實現(xiàn)高性能和高準確性;
③10分鐘內(nèi)完成1個樣本測試;
④一組實驗可獲得結(jié)合特異性、親和力、動力學等數(shù)據(jù);
⑤四通道檢測,結(jié)合參照通道信號,可進行背景扣除,獲得可信數(shù)據(jù);
⑥儀器穩(wěn)定,操作簡單,維護簡便;
⑦采用注射泵組件,控制精準,信號穩(wěn)定;
⑧儀器性價比高,單個實驗室即可負擔;
⑨AfficoatTM芯片可減少SPR試驗中的非特異性結(jié)合;
⑩芯片耗材成本低,大大降低儀器運行成本。