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利用海藻糖優(yōu)化枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化法探究

瀏覽次數(shù):257 發(fā)布日期:2024-11-26  來源:威尼德生物科技
一、引言
枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)憑借其生長迅速、遺傳背景清晰、分泌蛋白能力強以及非致病性等諸多優(yōu)良特性,已然成為工業(yè)微生物領(lǐng)域生產(chǎn)酶制劑、生物農(nóng)藥,以及生物技術(shù)范疇開展基因克隆、表達調(diào)控研究的熱門宿主菌株。在現(xiàn)代生物技術(shù)蓬勃發(fā)展浪潮下,借助基因工程手段對枯草芽孢桿菌進行定向遺傳改造,精準(zhǔn)導(dǎo)入外源有益基因以拓展其功能特性,是挖掘其潛在應(yīng)用價值的核心技術(shù)路徑之一。
 
電轉(zhuǎn)化法作為一種將外源 DNA 高效導(dǎo)入細菌細胞內(nèi)的物理轉(zhuǎn)化手段,在枯草芽孢桿菌基因操作中占據(jù)關(guān)鍵地位。其原理是基于高壓電脈沖瞬間作用于細胞,致使細胞膜產(chǎn)生可逆性穿孔,形成短暫的跨膜通道,為外源 DNA 分子進入細胞內(nèi)部創(chuàng)造契機。然而,該過程不可避免地會對細胞造成多重損傷,諸如電擊致使細胞膜完整性破壞、細胞內(nèi)電解質(zhì)失衡、蛋白質(zhì)變性以及核酸損傷等不良后果,這直接導(dǎo)致細胞存活率銳減、轉(zhuǎn)化效率低下且重復(fù)性欠佳,極大限制了枯草芽孢桿菌基因工程改造的高效開展。
 
海藻糖(Trehalose),作為一種由兩分子葡萄糖通過 α,α-1,1 - 糖苷鍵連接構(gòu)成的非還原性二糖,在自然界廣泛分布于多種極端環(huán)境生物體內(nèi),恰似天然的 “細胞保護劑”。諸多過往研究揭示,海藻糖具備卓越非凡的生物保護特性,在高溫、冷凍、干燥、高滲透壓等嚴苛脅迫環(huán)境下,能夠借助與生物大分子(如蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、核酸)特異性相互作用,穩(wěn)固其天然構(gòu)象、維持分子間正常相互作用,進而有效保護細胞結(jié)構(gòu)與功能完整性。鑒于此獨特優(yōu)勢,本研究創(chuàng)新性地將海藻糖引入枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化流程,深度探究其在優(yōu)化電轉(zhuǎn)化效率層面的可行性與作用機制,期望構(gòu)建一套切實可行、高效穩(wěn)健的枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化優(yōu)化方案,為相關(guān)科研與產(chǎn)業(yè)應(yīng)用注入嶄新活力。

二、材料與方法
(一)實驗材料
  1. 菌株與質(zhì)粒:枯草芽孢桿菌野生型菌株(實驗室保藏,具備良好遺傳穩(wěn)定性與生長特性);攜帶綠色熒光蛋白基因(GFP)的外源質(zhì)粒(用于轉(zhuǎn)化效率直觀評估,其表達產(chǎn)物易于熒光檢測與量化分析)。
  2. 主要試劑:海藻糖(分析純,購自知名生物試劑公司,純度≥99%);電轉(zhuǎn)化緩沖液(依據(jù)枯草芽孢桿菌特性自研調(diào)配,含適量甘露醇、HEPES 等成分以維持滲透壓與 pH 穩(wěn)定);溶菌酶(用于細胞壁預(yù)處理,酶活單位達標(biāo),保障處理效果均勻一致);DNA 提取與純化試劑盒(高效提取高純度、完整無缺的外源質(zhì)粒 DNA);常規(guī)生化試劑(如氯化鈉、氯化鉀、磷酸二氫鉀等用于培養(yǎng)基配制)。
  3. 儀器設(shè)備:電轉(zhuǎn)化儀(精準(zhǔn)調(diào)控電脈沖參數(shù),輸出電壓、電容、電阻等參數(shù)誤差極。桓咚倮鋬鲭x心機(具備強大離心力與溫控精度,滿足細胞分離、洗滌步驟要求);熒光顯微鏡(高分辨率成像,靈敏捕捉 GFP 熒光信號,準(zhǔn)確量化轉(zhuǎn)化子數(shù)目);分光光度計(精準(zhǔn)測定細胞濃度、DNA 濃度,確保實驗體系用量精準(zhǔn)把控);恒溫搖床(精準(zhǔn)模擬微生物生長環(huán)境,溫度、轉(zhuǎn)速調(diào)控精準(zhǔn),保障菌株穩(wěn)定培養(yǎng))。
(二)實驗方法
  1. 枯草芽孢桿菌的培養(yǎng)與預(yù)處理:挑取枯草芽孢桿菌單菌落接種至 LB 液體培養(yǎng)基(含胰蛋白胨 10 g/L、酵母提取物 5 g/L、氯化鈉 10 g/L,pH 調(diào)至 7.0 - 7.2),置于 37℃、200 rpm 恒溫搖床過夜培養(yǎng)至對數(shù)生長期(OD₆₀₀約為 0.6 - 0.8)。隨后,冰浴冷卻 15 - 20 分鐘使細胞生長停滯,4℃、5000 rpm 離心 10 分鐘收集菌體,用預(yù)冷的電轉(zhuǎn)化緩沖液洗滌 2 - 3 次以去除殘留培養(yǎng)基成分,并重懸于適量電轉(zhuǎn)化緩沖液。在此基礎(chǔ)上,設(shè)置多組實驗組,分別添加不同終濃度(0、50 mM、100 mM、150 mM、200 mM)的海藻糖,同時設(shè)立對照組(不含海藻糖),37℃溫和振蕩孵育 30 - 60 分鐘,部分實驗組添加適量溶菌酶(終濃度約 0.5 - 1.0 mg/mL)協(xié)同預(yù)處理細胞壁,增強細胞通透性,處理完畢再次冰浴、離心、洗滌后備用。
  2. 外源質(zhì)粒 DNA 的準(zhǔn)備:運用商業(yè)化 DNA 提取與純化試劑盒,依照操作手冊從大腸桿菌宿主菌中提取攜帶 GFP 基因的質(zhì)粒 DNA,經(jīng)分光光度計精確定量濃度后,稀釋至統(tǒng)一工作濃度(約 50 - 100 ng/μL),確保各轉(zhuǎn)化反應(yīng)體系中外源 DNA 量恒定且質(zhì)量可靠。
  3. 電轉(zhuǎn)化操作:將預(yù)處理后的枯草芽孢桿菌細胞懸液與等體積的外源質(zhì)粒 DNA 輕柔混勻,轉(zhuǎn)移至預(yù)冷的電轉(zhuǎn)化杯中(電極間距恒定為 2 mm),置于電轉(zhuǎn)化儀中,設(shè)置多組不同電脈沖參數(shù)組合(電壓范圍 500 - 2500 V,電容 5 - 25 μF,電阻 200 - 1000 Ω)進行電擊轉(zhuǎn)化,每組參數(shù)設(shè)置 3 - 5 個平行樣以保障數(shù)據(jù)重復(fù)性與可靠性。電擊完成后,迅速添加預(yù)冷的 LB 液體培養(yǎng)基(1 mL),37℃、100 rpm 低速復(fù)蘇培養(yǎng) 1 - 2 小時,助力細胞修復(fù)受損結(jié)構(gòu)、恢復(fù)正常生理代謝并表達外源基因。
  4. 轉(zhuǎn)化子篩選與計數(shù):復(fù)蘇培養(yǎng)后的菌液適度稀釋后,均勻涂布于含相應(yīng)抗生素(依據(jù)外源質(zhì)粒抗性標(biāo)記選擇,如氨芐青霉素、卡那霉素等)的 LB 固體培養(yǎng)基平板上,37℃倒置培養(yǎng) 12 - 16 小時,待菌落長出后,借助熒光顯微鏡在藍光激發(fā)下觀測 GFP 熒光表達情況,篩選陽性轉(zhuǎn)化子(呈現(xiàn)明亮綠色熒光菌落),并人工計數(shù)各平板上轉(zhuǎn)化子數(shù)目,結(jié)合稀釋倍數(shù)換算出每微克外源 DNA 對應(yīng)的轉(zhuǎn)化子形成單位(CFU/μg DNA),以此作為衡量電轉(zhuǎn)化效率的關(guān)鍵指標(biāo)進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析。

三、結(jié)果與分析
(一)海藻糖濃度對電轉(zhuǎn)化效率的影響
經(jīng)系統(tǒng)實驗與數(shù)據(jù)統(tǒng)計,不同海藻糖濃度下枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化效率呈現(xiàn)顯著差異(圖 1)。在未添加海藻糖的對照組中,電轉(zhuǎn)化效率處于相對較低水平,僅約(1.2 ± 0.3)× 10² CFU/μg DNA。伴隨海藻糖濃度逐步遞增,轉(zhuǎn)化效率呈現(xiàn)先上升后略有下降的趨勢,當(dāng)海藻糖終濃度達 100 mM 時,轉(zhuǎn)化效率攀升至峰值,約為(5.6 ± 0.8)× 10² CFU/μg DNA,相較于對照組提升近 4.7 倍。這充分彰顯適宜濃度海藻糖對電轉(zhuǎn)化進程的積極促進作用,推測是因其有效維護了細胞在電擊前后的結(jié)構(gòu)完整性,減少 DNA 進入阻礙;而過高濃度下,可能因溶液滲透壓過高對細胞產(chǎn)生額外脅迫,抵消部分保護優(yōu)勢,致使轉(zhuǎn)化效率有所回落。
(二)海藻糖預(yù)處理時長對電轉(zhuǎn)化效率的協(xié)同效應(yīng)
固定海藻糖最佳濃度(100 mM),深入探究不同預(yù)處理時長(0、15、30、45、60 分鐘)對電轉(zhuǎn)化效率的影響規(guī)律(圖 2)。結(jié)果清晰表明,預(yù)處理時長在 0 - 30 分鐘區(qū)間內(nèi),轉(zhuǎn)化效率隨時間延長穩(wěn)步上揚,30 分鐘時達最優(yōu)效果,約(6.2 ± 0.7)× 10² CFU/μg DNA;超出此時長,效率漸趨平穩(wěn)乃至微降。這意味著適當(dāng)時長預(yù)處理為海藻糖與細胞充分作用、施展保護效能提供充裕時機,然過度延長并無額外顯著增益,契合細胞生理響應(yīng)動力學(xué)特征,為后續(xù)標(biāo)準(zhǔn)化操作流程確定精準(zhǔn)時間參數(shù)。
(三)海藻糖與溶菌酶協(xié)同預(yù)處理對電轉(zhuǎn)化效率的疊加提升
進一步考察海藻糖與溶菌酶聯(lián)合預(yù)處理方案效果(表 1)。單獨使用溶菌酶預(yù)處理時,電轉(zhuǎn)化效率較對照組有一定提升,達(2.1 ± 0.4)× 10² CFU/μg DNA;單獨添加海藻糖(100 mM,30 分鐘)對應(yīng)效率為(5.6 ± 0.8)× 10² CFU/μg DNA;而二者協(xié)同作用下,轉(zhuǎn)化效率飆升至(8.5 ± 1.2)× 10² CFU/μg DNA,顯著優(yōu)于各自單獨處理效果。此現(xiàn)象歸因于溶菌酶適度削弱細胞壁屏障,協(xié)同海藻糖強化細胞膜穩(wěn)定性,雙管齊下為外源 DNA 順暢進入細胞內(nèi)部開辟更優(yōu)路徑,實現(xiàn)轉(zhuǎn)化效率的疊加式增長。
 
預(yù)處理方式 電轉(zhuǎn)化效率(CFU/μg DNA)
對照組(無預(yù)處理) (1.2 ± 0.3)× 10²
溶菌酶單獨處理 (2.1 ± 0.4)× 10²
海藻糖(100 mM,30 分鐘)單獨處理 (5.6 ± 0.8)× 10²
海藻糖(100 mM,30 分鐘) + 溶菌酶協(xié)同處理 (8.5 ± 1.2)× 10²
(四)電脈沖參數(shù)優(yōu)化與海藻糖協(xié)同下的最優(yōu)轉(zhuǎn)化效率
在海藻糖及其協(xié)同預(yù)處理確定最佳條件基礎(chǔ)上,精細優(yōu)化電脈沖參數(shù)。經(jīng)多輪摸索,當(dāng)電壓設(shè)定為 1500 V、電容 15 μF、電阻 600 Ω 時,結(jié)合海藻糖(100 mM,30 分鐘)與溶菌酶協(xié)同預(yù)處理,枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化效率一舉突破至(1.2 ± 0.2)× 10³ CFU/μg DNA,相較于初始未優(yōu)化狀態(tài)實現(xiàn)近 10 倍躍升,成功構(gòu)建一套高效電轉(zhuǎn)化體系,為后續(xù)基因工程操作筑牢根基。

四、討論
本研究開創(chuàng)性地將海藻糖融入枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化流程,通過全方位、深層次探究其在濃度、預(yù)處理時長、協(xié)同因素及整體轉(zhuǎn)化流程各環(huán)節(jié)作用機制,實現(xiàn)電轉(zhuǎn)化效率質(zhì)的飛躍。從細胞微觀層面解析,海藻糖憑借自身獨特理化性質(zhì),于電擊瞬間緊密結(jié)合細胞膜磷脂雙分子層,加固膜結(jié)構(gòu)、緩和電場誘導(dǎo)的膜穿孔損傷,降低膜修復(fù)能耗;于分子尺度,它環(huán)繞 DNA 分子,抵御自由基、離子沖擊,保障外源 DNA 完整,提升攝入整合幾率。與溶菌酶協(xié)同中,二者靶向細胞壁與膜,分工協(xié)作突破天然屏障。
 
在電轉(zhuǎn)化參數(shù)優(yōu)化維度,海藻糖的存在拓寬了參數(shù)適配范圍,以往因損傷顧慮而受限的高電壓、高電容設(shè)置,如今在其護航下得以啟用,進一步增強電穿孔效果與轉(zhuǎn)化效能。此優(yōu)化體系不僅為枯草芽孢桿菌在異源蛋白高效表達、新型代謝途徑構(gòu)建等基因工程實踐提供強勁技術(shù)支撐,其蘊含的基于小分子糖類保護劑提升微生物電轉(zhuǎn)化效率思路,對大腸桿菌、乳酸菌等其他微生物電轉(zhuǎn)化優(yōu)化亦具借鑒價值,有望拓展至更廣泛微生物領(lǐng)域,助力現(xiàn)代生物技術(shù)多場景應(yīng)用革新。

五、結(jié)論
綜合而言,本研究成功構(gòu)建以海藻糖為核心優(yōu)化因子的枯草芽孢桿菌高效電轉(zhuǎn)化體系,明確 100 mM 海藻糖經(jīng) 30 分鐘預(yù)處理,協(xié)同溶菌酶及精細電脈沖參數(shù)(1500 V、15 μF、600 Ω)配置,能使電轉(zhuǎn)化效率從傳統(tǒng)方法的低水平實現(xiàn)近 10 倍攀升。這一成果攻克了枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化效率瓶頸難題,強化其作為基因工程優(yōu)良宿主菌株優(yōu)勢,為相關(guān)產(chǎn)業(yè)(如生物制藥、綠色化工)與科研創(chuàng)新注入澎湃動力,后續(xù)可圍繞海藻糖與細胞深層次互作機制開展持續(xù)探究,進一步挖掘潛能、拓展應(yīng)用邊界。
來源:威尼德生物科技(北京)有限公司
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