盤古定量PCR在種質(zhì)資源基因組學研究的應用
瀏覽次數(shù):1083 發(fā)布日期:2024-4-17
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了解種質(zhì)資源
種質(zhì)資源,也稱為遺傳資源或基因資源,指的是那些對人類具有實際或潛在利用價值的遺傳材料。如農(nóng)作物遺傳改良和品種改良的種子、種苗和組織等植物資源,品種優(yōu)良的動物資源都屬于種質(zhì)資源的范圍。
種質(zhì)資源保護
我國幅員遼闊,種質(zhì)資源極其豐富,位居世界首列。作物、畜禽、水產(chǎn)、農(nóng)業(yè)微生物等農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源是新品種選育的基礎,遺傳信息由上一代傳給下一代的載體,種質(zhì)資源是人類生存不可或缺的重要資源之一。
因此,我國一直致力于采取多維度措施,保護和開發(fā)種質(zhì)資源,實現(xiàn)農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化。
2024年1月1日,農(nóng)業(yè)部一號文件 《關于學習運用“千村示范、萬村整治”工程經(jīng)驗有力有效推進鄉(xiāng)村全面振興工作的實施意見》
文件提出“種業(yè)振興行動”,其內(nèi)容包含如下:
1.強化種質(zhì)資源保護利用,篩選挖掘大豆、玉米等優(yōu)異種質(zhì)和基因資源,推進育種創(chuàng)新攻關。
2.生物育種產(chǎn)業(yè)化提速,加快選育推廣高油高產(chǎn)大豆、短生育期油菜、耐鹽堿作物等生產(chǎn)急需的自主優(yōu)良品種。
種質(zhì)資源學和基因組學
生物種質(zhì)資源的保護通常離不開現(xiàn)代科技基礎設施,包括種子庫、植物離體庫、DNA庫、微生物庫和動物種質(zhì)資源庫,現(xiàn)代分子檢測方法可以為種質(zhì)資源建立先進的植物基因組學和種子生物學實驗研究平臺。
定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)在種質(zhì)資源研究中有著廣泛的應用,定量PCR在這一領域的應用主要包括以下幾個方面:
1、基因型鑒定:定量PCR可以用于快速、準確地鑒定種質(zhì)資源中的基因型。通過PCR反應檢測目標基因的存在與否以及其表達水平,可以幫助研究人員確定種質(zhì)資源中所含有的有用基因型,為后續(xù)的遺傳改良工作提供重要信息。
2、基因表達分析:定量PCR可以定量檢測種質(zhì)資源中特定基因的表達水平。通過比較不同種質(zhì)資源或不同處理條件下目標基因的表達情況,可以揭示基因在生長發(fā)育過程中的調(diào)控機制,為選擇優(yōu)良基因型提供依據(jù)。
3、遺傳改良:熒光實時定量PCR技術可以用于分子育種。通過分析動植物的基因組序列和遺傳特征,可以預測它們的生長、繁殖等性狀,幫助養(yǎng)殖者選擇優(yōu)良的個體進行繁殖和培育
4、遺傳多樣性評估:定量PCR可以用于評估種質(zhì)資源的遺傳多樣性。通過分析種質(zhì)資源中多個基因座的遺傳變異情況,可以確定種質(zhì)資源的遺傳背景和多樣性水平,為種質(zhì)資源的保護和合理利用提供科學依據(jù)。
5、抗性鑒定:定量PCR可以用于檢測種質(zhì)資源中對病蟲害等脅迫因子的抗性。通過PCR反應檢測與抗性相關的基因或標記物,可以篩選出具有抗性特點的種質(zhì)資源,為抗性育種提供候選材料。
艾普拜為科研用戶開發(fā)了國際標準級qPCR系統(tǒng)——盤古快速定量PCR系統(tǒng),遵循國際MIQE原則,性能出眾,非常適合種質(zhì)資源研究。
•升溫速度可達8.5℃/s,一次快速完成96孔檢測并出具結果,產(chǎn)物得率高,特異性好
•溫控精度±0.1℃滿足敏感樣品對擴增溫度的嚴苛要求,保證陽性靶標的正常擴增
•支持12列溫度梯度功能,便于快速優(yōu)化擴增所需條件
•光波導頂部檢測,無邊緣效應和光程差,無需校準
•6色檢測通道,支持各種常用熒光標記,兼容各種商業(yè)化qPCR試劑盒
•具備基因表達和基因分型強大的軟件功能,適合SNP/KASP等等位基因分型
總的來說,定量PCR在種質(zhì)資源研究中的應用可以幫助研究人員更全面、深入地了解種質(zhì)資源的遺傳特征、基因表達情況以及抗性等重要信息,為農(nóng)作物遺傳改良和種質(zhì)資源的合理利用提供技術支持。