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SDS-PAGE的工作原理

瀏覽次數(shù):599 發(fā)布日期:2023-3-10  來源:百泰派克生物科技-原創(chuàng)

電泳是分離蛋白質(zhì)和核酸、嘌呤、嘧啶、一些有機化合物甚至無機離子等物質(zhì)的主要技術(shù)。大多數(shù)電泳方法是將樣品在一個固定化的介質(zhì)中進行分離。聚丙烯酰胺凝膠是主要的介質(zhì)之一。聚丙烯酰胺是一種多孔凝膠,孔徑接近蛋白質(zhì)分子的大小,從而提高了蛋白質(zhì)的分辨率。此外,聚丙烯酰胺凝膠還具有良好的化學(xué)穩(wěn)定性、強重復(fù)性、對pH和溫度變化的穩(wěn)定性,顏色易于觀察等優(yōu)點。十二脘基磺酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrohoresis,SDS PAGE)在確定蛋白質(zhì)分子量,檢測特定蛋白質(zhì)和鑒定菌株種類方面具有操作簡單和重復(fù)性好的優(yōu)點。

聚丙烯酰胺凝膠電泳示意圖(Gülay, et al.,2018)

如何通過SDS-PAGE確定蛋白質(zhì)的分子量?

SDS-PAGE是確定未知蛋白質(zhì)分子量的主要方法。已知分子量的蛋白質(zhì)和未知樣品同時電泳。染色后,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的相對遷移率和分子量的對數(shù),可得到一條線,利用其相對遷移率確定未知樣品的分子量。在實驗室中,將一個與染料共價偶聯(lián)的標(biāo)準(zhǔn)分子量蛋白質(zhì)用作參考蛋白質(zhì),以大致指示未知蛋白質(zhì)的大小。這種預(yù)先染色的蛋白質(zhì)標(biāo)記可以在電泳過程中或轉(zhuǎn)移膜時直接觀察到。

如何讀取SDS-PAGE的結(jié)果?

電泳后,肉眼無法直接觀察到蛋白質(zhì)分離,需要后續(xù)的染色技術(shù)?捡R斯亮藍(lán)染色和銀染是電泳分離蛋白質(zhì)常規(guī)檢測和定量的常用方法。經(jīng)過簡單的處理,如固定-染色-脫色,可以清楚地觀察到蛋白質(zhì)的分布。隨著高靈敏蛋白質(zhì)分析方法和蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)的改進,熒光標(biāo)記和同位素標(biāo)記技術(shù)等新的染色方法大大提高了靈敏度,并且還與自動蛋白質(zhì)組學(xué)平臺凝膠切割技術(shù)兼容,開發(fā)了更高的靈敏度和自動染色技術(shù)。

如何儲存SDS-PAGE凝膠?

通常在每次實驗之前會準(zhǔn)備新鮮的SDS-PAGE凝膠。但是,凝膠也可以在4°C的清水中儲存大約一周。如果在染色后無法及時拍照,則需要將其放入水中以防止凝膠干燥和收縮。建議盡快拍攝染色結(jié)果。如果將凝膠長時間浸泡在水中,條帶會散開。

參考文獻(xiàn)

1. Smith B J. SDS Polyacrylamide Gel Electrophoresis of Proteins. Methods in Molecular Biology, 1984, 1(4):41-55.
2. Duffy M F, Noormohammadi A H, Baseggio N, et al. Polyacrylamide gel-electrophoresis separation of whole-cell proteins. Methods in Molecular Biology, 1998, 104:267.

來源:北京百泰派克生物科技有限公司
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